Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H1U0

Protein Details
Accession C1H1U0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
501-520TASGRSRDPRRPHLPSKTPFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
588-594ERKRARR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG pbl:PAAG_04876  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MDGFDEETFKKFFPSGFGKRDKSTNIAAQIDRTKRVEAGSKSPAAVLGEKKPLGVLDDNDVEKTGPRIDKGGSKQDGNLASDADSDSSDESDEDEFPTSHDLTFKTHDRAVTTITLDPSGSRMITGSTDCTIKLHDFASMTPTTLRAFKSVEPSAKKQSAASEIHPVHVARFNPLYPSQVLVISATPQAKILDRDGDTIVEFAKGDMYLRDMRNTKGHISEITSGTWSPSDYNLCVTAGTDSTLRIWDVNAGRSQKEVIVHQSRAAGSAGRTRMTAVAWGSPAQGGNNFLVASALDGSLVMWGGNGPFTRPSAQIQGAHTKDAWTSGLDISPDGRLVVTRGGDDTIKLWDTRKFKNPITTVPHPSGSKYSHNANIMFSPSGANIVTGSETGDLHILNPATLKPELSTSVTPGSPLIAVLWHEKLNQIIAGSANGETHVLYNPSLSHNGAVLVMSKAPKRRHVDDDPNFTTDLSLGLSADSTTGQITSGASFSSRHPTIGLTASGRSRDPRRPHLPSKTPFANSQPDEKHIKENIPLSSMRDEDPRAALLKYAEQAEKEPVFTKVWQETQPKPIFAELSEEEDEGEKPERKRARRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.38
3 0.45
4 0.54
5 0.57
6 0.59
7 0.65
8 0.62
9 0.57
10 0.55
11 0.52
12 0.5
13 0.51
14 0.48
15 0.48
16 0.53
17 0.52
18 0.51
19 0.46
20 0.41
21 0.37
22 0.4
23 0.42
24 0.38
25 0.42
26 0.43
27 0.44
28 0.42
29 0.41
30 0.39
31 0.33
32 0.33
33 0.29
34 0.28
35 0.32
36 0.32
37 0.32
38 0.3
39 0.28
40 0.27
41 0.27
42 0.23
43 0.21
44 0.26
45 0.27
46 0.26
47 0.27
48 0.23
49 0.2
50 0.2
51 0.21
52 0.19
53 0.19
54 0.22
55 0.24
56 0.32
57 0.37
58 0.45
59 0.42
60 0.41
61 0.42
62 0.45
63 0.46
64 0.4
65 0.34
66 0.25
67 0.22
68 0.21
69 0.2
70 0.15
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.16
88 0.16
89 0.17
90 0.23
91 0.27
92 0.28
93 0.29
94 0.3
95 0.3
96 0.31
97 0.3
98 0.28
99 0.25
100 0.24
101 0.22
102 0.21
103 0.19
104 0.18
105 0.16
106 0.15
107 0.12
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.15
119 0.14
120 0.15
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.18
126 0.16
127 0.16
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.17
132 0.18
133 0.15
134 0.17
135 0.19
136 0.26
137 0.3
138 0.36
139 0.38
140 0.43
141 0.48
142 0.49
143 0.47
144 0.41
145 0.39
146 0.39
147 0.36
148 0.34
149 0.35
150 0.32
151 0.32
152 0.33
153 0.3
154 0.25
155 0.26
156 0.24
157 0.19
158 0.2
159 0.19
160 0.21
161 0.22
162 0.22
163 0.18
164 0.2
165 0.17
166 0.15
167 0.15
168 0.12
169 0.12
170 0.1
171 0.13
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.15
179 0.18
180 0.18
181 0.2
182 0.2
183 0.19
184 0.18
185 0.16
186 0.14
187 0.09
188 0.08
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.09
195 0.14
196 0.15
197 0.2
198 0.21
199 0.23
200 0.27
201 0.29
202 0.28
203 0.25
204 0.25
205 0.21
206 0.23
207 0.25
208 0.22
209 0.2
210 0.19
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.12
215 0.09
216 0.09
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.11
235 0.12
236 0.14
237 0.17
238 0.18
239 0.19
240 0.19
241 0.2
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.19
246 0.23
247 0.23
248 0.23
249 0.25
250 0.23
251 0.23
252 0.22
253 0.15
254 0.11
255 0.16
256 0.16
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.14
261 0.13
262 0.14
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.03
288 0.02
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.07
296 0.09
297 0.1
298 0.12
299 0.15
300 0.17
301 0.19
302 0.21
303 0.28
304 0.26
305 0.26
306 0.24
307 0.21
308 0.19
309 0.17
310 0.15
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.16
337 0.2
338 0.25
339 0.33
340 0.36
341 0.38
342 0.47
343 0.47
344 0.49
345 0.53
346 0.54
347 0.5
348 0.47
349 0.48
350 0.4
351 0.39
352 0.36
353 0.31
354 0.3
355 0.27
356 0.29
357 0.3
358 0.33
359 0.32
360 0.29
361 0.27
362 0.24
363 0.21
364 0.18
365 0.14
366 0.1
367 0.11
368 0.09
369 0.08
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.1
388 0.11
389 0.09
390 0.1
391 0.13
392 0.15
393 0.15
394 0.15
395 0.17
396 0.17
397 0.17
398 0.15
399 0.13
400 0.1
401 0.1
402 0.08
403 0.06
404 0.07
405 0.1
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.13
412 0.12
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.1
429 0.12
430 0.14
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.11
437 0.09
438 0.08
439 0.1
440 0.12
441 0.15
442 0.22
443 0.26
444 0.34
445 0.4
446 0.45
447 0.51
448 0.58
449 0.66
450 0.68
451 0.74
452 0.68
453 0.63
454 0.57
455 0.49
456 0.39
457 0.28
458 0.2
459 0.11
460 0.08
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.09
478 0.11
479 0.19
480 0.19
481 0.18
482 0.19
483 0.19
484 0.22
485 0.24
486 0.24
487 0.18
488 0.2
489 0.22
490 0.24
491 0.24
492 0.28
493 0.31
494 0.38
495 0.44
496 0.52
497 0.59
498 0.66
499 0.74
500 0.79
501 0.82
502 0.78
503 0.79
504 0.76
505 0.7
506 0.65
507 0.61
508 0.6
509 0.52
510 0.56
511 0.5
512 0.48
513 0.51
514 0.49
515 0.51
516 0.45
517 0.46
518 0.43
519 0.45
520 0.42
521 0.39
522 0.38
523 0.34
524 0.35
525 0.33
526 0.29
527 0.29
528 0.28
529 0.27
530 0.28
531 0.27
532 0.24
533 0.23
534 0.23
535 0.2
536 0.22
537 0.22
538 0.24
539 0.24
540 0.23
541 0.25
542 0.31
543 0.3
544 0.28
545 0.27
546 0.25
547 0.27
548 0.27
549 0.31
550 0.31
551 0.35
552 0.41
553 0.46
554 0.49
555 0.56
556 0.6
557 0.55
558 0.5
559 0.48
560 0.41
561 0.35
562 0.37
563 0.28
564 0.29
565 0.29
566 0.27
567 0.24
568 0.24
569 0.24
570 0.2
571 0.24
572 0.24
573 0.24
574 0.34
575 0.43