Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3XDV4

Protein Details
Accession W3XDV4    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPPHLPRKRLRTPSPEGGNGHydrophilic
149-172ASEMSKKGPSKREKQIRNVTHCIHHydrophilic
237-256GKSTTKGKTARSRGKQPASKHydrophilic
419-442KTRKTPARPTSRRTRKNDKDSLKMBasic
992-1035EDEDIKPPKRAQRKVAKPKAKAKAKPRATNRRRTRTTQIKSSEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-28RKRLRTPSPEGGNGAKKAGKSS
233-253SGARGKSTTKGKTARSRGKQP
412-434KKSQAAAKTRKTPARPTSRRTRK
844-857RKRKEDEKRRKAAL
997-1025KPPKRAQRKVAKPKAKAKAKPRATNRRRT
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG pfy:PFICI_05483  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPHLPRKRLRTPSPEGGNGAKKAGKSSKSSTPNGVVPPRKSTVFEDLNTSDKKRSADKTKSALQKMVDDDDSSSLSSLSDSDVEFEDVPSAKRQKVDAQSVKESDDEDDDEDIEFEDVPNHEPQLEVEPVISGDLELTLYRNSHVPLASEMSKKGPSKREKQIRNVTHCIHVQYLLWHNATRNSWLCDPEVQATMISHLTPRLWEEVDRWRTNSGLEKDDAVEEKAAPTSKSGARGKSTTKGKTARSRGKQPASKSTRDWSDAADRLENGVPNMSHGDPLFRLMKSLSAWWKQRFTTTAPGLRKKGYMDVRRLAKWRVAFEEEEHDPERFGEKIHNLEDFRTHARKCEGSRDVGAQLFTALLRGIGLEARMVANLQSLGFGWSKSEEADEEKAVGDASTNGTATPIKTNAKKSQAAAKTRKTPARPTSRRTRKNDKDSLKMDLDDSDEYLEPISDDDSDDNSVVDVTADFKKPKAALKIYDKDLDFPIYWTEVLSPVTKKWLPVDAIVKSIVGTNRELVESLEPRGAKADKAKQIMAYTVAHSQDGTAKDVTVRYLRKQLFPGRTKGSRMGVEKIPIYNRHGKIKRYEKFDWFKFALSGYVRGTLKYPVTELDQWEDATDLKPAVPEKKEVKEGEETLQYFKSSKEFVLQRHLKREEALLPSAKPVKVFRNKVKGGKVEEEDVYLRKDVVAVKSAETWHKQGRAPVLGAEPLKHAPYRAATTNRRREIAEAEARTGEKVLQPLYSEEQTDWIIPPPIENGVIPKNDYGNIDMFAEHMCPEGAIHLPYRGAVRVCKRLGIDYAEAVVGFEFGHRMAVPVIQGVVVAEEHEDKVLEEIEKDEAERKRKEDEKRRKAALGMWRKLLMGMRIAARIEKEYGHLEDKQTKTIVDLRGSDEDDAGEGGFMKMSEHDEDMAGGFLPEGYDEEEPGDQPKQTSSYFSGAHDAEGVDTLEVDHGDSVEKPRDFSGLAISRYHEGSPEDKGDEEENNEDMEDEDIKPPKRAQRKVAKPKAKAKAKPRATNRRRTRTTQIKSSEDDDDDDDFELSDSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.77
3 0.7
4 0.67
5 0.65
6 0.57
7 0.52
8 0.45
9 0.38
10 0.41
11 0.45
12 0.43
13 0.43
14 0.47
15 0.53
16 0.58
17 0.62
18 0.6
19 0.57
20 0.58
21 0.59
22 0.62
23 0.6
24 0.56
25 0.59
26 0.56
27 0.53
28 0.51
29 0.48
30 0.48
31 0.46
32 0.43
33 0.44
34 0.42
35 0.46
36 0.47
37 0.44
38 0.39
39 0.37
40 0.39
41 0.39
42 0.46
43 0.5
44 0.57
45 0.63
46 0.66
47 0.71
48 0.77
49 0.75
50 0.7
51 0.62
52 0.58
53 0.53
54 0.51
55 0.44
56 0.35
57 0.32
58 0.29
59 0.28
60 0.22
61 0.18
62 0.13
63 0.11
64 0.11
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.12
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.17
77 0.22
78 0.25
79 0.26
80 0.28
81 0.31
82 0.37
83 0.45
84 0.54
85 0.55
86 0.57
87 0.62
88 0.61
89 0.59
90 0.51
91 0.44
92 0.34
93 0.29
94 0.24
95 0.18
96 0.17
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.13
101 0.11
102 0.09
103 0.07
104 0.09
105 0.1
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.17
113 0.18
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.12
130 0.12
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.22
136 0.26
137 0.26
138 0.26
139 0.27
140 0.33
141 0.35
142 0.4
143 0.45
144 0.49
145 0.56
146 0.66
147 0.73
148 0.75
149 0.82
150 0.85
151 0.86
152 0.85
153 0.83
154 0.75
155 0.71
156 0.64
157 0.57
158 0.47
159 0.38
160 0.3
161 0.28
162 0.31
163 0.29
164 0.28
165 0.27
166 0.26
167 0.31
168 0.31
169 0.32
170 0.3
171 0.3
172 0.32
173 0.32
174 0.33
175 0.3
176 0.31
177 0.28
178 0.26
179 0.22
180 0.2
181 0.18
182 0.18
183 0.15
184 0.13
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.18
194 0.28
195 0.36
196 0.38
197 0.37
198 0.35
199 0.34
200 0.36
201 0.41
202 0.34
203 0.3
204 0.28
205 0.28
206 0.28
207 0.3
208 0.29
209 0.21
210 0.18
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.13
216 0.13
217 0.17
218 0.18
219 0.27
220 0.3
221 0.32
222 0.35
223 0.39
224 0.42
225 0.46
226 0.52
227 0.48
228 0.51
229 0.54
230 0.57
231 0.63
232 0.69
233 0.71
234 0.71
235 0.77
236 0.79
237 0.82
238 0.8
239 0.76
240 0.76
241 0.73
242 0.69
243 0.63
244 0.6
245 0.55
246 0.53
247 0.48
248 0.4
249 0.41
250 0.41
251 0.39
252 0.34
253 0.29
254 0.28
255 0.29
256 0.25
257 0.18
258 0.16
259 0.14
260 0.13
261 0.16
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.15
266 0.13
267 0.16
268 0.18
269 0.15
270 0.16
271 0.14
272 0.17
273 0.16
274 0.21
275 0.25
276 0.29
277 0.36
278 0.39
279 0.44
280 0.42
281 0.44
282 0.42
283 0.39
284 0.41
285 0.41
286 0.44
287 0.47
288 0.52
289 0.52
290 0.51
291 0.48
292 0.41
293 0.42
294 0.44
295 0.44
296 0.45
297 0.49
298 0.52
299 0.54
300 0.56
301 0.5
302 0.45
303 0.42
304 0.38
305 0.35
306 0.34
307 0.31
308 0.29
309 0.32
310 0.29
311 0.3
312 0.28
313 0.23
314 0.2
315 0.19
316 0.19
317 0.14
318 0.13
319 0.14
320 0.15
321 0.19
322 0.2
323 0.24
324 0.23
325 0.23
326 0.25
327 0.24
328 0.27
329 0.28
330 0.27
331 0.27
332 0.3
333 0.34
334 0.34
335 0.4
336 0.37
337 0.36
338 0.37
339 0.36
340 0.34
341 0.31
342 0.29
343 0.19
344 0.16
345 0.12
346 0.1
347 0.08
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.09
372 0.08
373 0.09
374 0.07
375 0.1
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.09
383 0.06
384 0.05
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.1
393 0.12
394 0.16
395 0.2
396 0.26
397 0.32
398 0.38
399 0.4
400 0.39
401 0.45
402 0.48
403 0.53
404 0.55
405 0.55
406 0.57
407 0.61
408 0.65
409 0.59
410 0.61
411 0.61
412 0.65
413 0.65
414 0.63
415 0.68
416 0.73
417 0.79
418 0.79
419 0.81
420 0.79
421 0.83
422 0.86
423 0.8
424 0.78
425 0.71
426 0.68
427 0.58
428 0.48
429 0.39
430 0.3
431 0.26
432 0.18
433 0.16
434 0.11
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.07
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.04
454 0.06
455 0.08
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.14
460 0.15
461 0.19
462 0.23
463 0.24
464 0.29
465 0.38
466 0.43
467 0.43
468 0.46
469 0.42
470 0.37
471 0.35
472 0.3
473 0.21
474 0.17
475 0.15
476 0.11
477 0.11
478 0.09
479 0.09
480 0.07
481 0.09
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.14
486 0.14
487 0.15
488 0.15
489 0.18
490 0.17
491 0.2
492 0.24
493 0.2
494 0.21
495 0.2
496 0.18
497 0.15
498 0.15
499 0.13
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.11
506 0.09
507 0.11
508 0.1
509 0.11
510 0.12
511 0.11
512 0.11
513 0.14
514 0.13
515 0.12
516 0.17
517 0.23
518 0.26
519 0.29
520 0.29
521 0.28
522 0.28
523 0.28
524 0.24
525 0.18
526 0.14
527 0.14
528 0.14
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.13
533 0.13
534 0.14
535 0.11
536 0.11
537 0.12
538 0.12
539 0.14
540 0.15
541 0.15
542 0.16
543 0.24
544 0.26
545 0.28
546 0.33
547 0.39
548 0.43
549 0.45
550 0.48
551 0.45
552 0.46
553 0.46
554 0.45
555 0.41
556 0.36
557 0.35
558 0.33
559 0.29
560 0.29
561 0.27
562 0.26
563 0.25
564 0.23
565 0.25
566 0.3
567 0.3
568 0.38
569 0.41
570 0.43
571 0.49
572 0.57
573 0.58
574 0.57
575 0.59
576 0.58
577 0.62
578 0.6
579 0.58
580 0.48
581 0.43
582 0.36
583 0.32
584 0.26
585 0.19
586 0.2
587 0.14
588 0.18
589 0.17
590 0.17
591 0.18
592 0.17
593 0.17
594 0.15
595 0.15
596 0.11
597 0.14
598 0.16
599 0.16
600 0.16
601 0.16
602 0.15
603 0.15
604 0.14
605 0.11
606 0.1
607 0.09
608 0.07
609 0.06
610 0.07
611 0.09
612 0.14
613 0.14
614 0.2
615 0.24
616 0.27
617 0.33
618 0.33
619 0.34
620 0.34
621 0.34
622 0.32
623 0.31
624 0.28
625 0.24
626 0.24
627 0.21
628 0.17
629 0.16
630 0.16
631 0.13
632 0.12
633 0.17
634 0.2
635 0.22
636 0.32
637 0.39
638 0.41
639 0.49
640 0.5
641 0.44
642 0.42
643 0.42
644 0.37
645 0.33
646 0.32
647 0.25
648 0.23
649 0.26
650 0.29
651 0.26
652 0.23
653 0.22
654 0.28
655 0.35
656 0.43
657 0.48
658 0.54
659 0.59
660 0.64
661 0.67
662 0.63
663 0.59
664 0.57
665 0.5
666 0.43
667 0.38
668 0.34
669 0.29
670 0.24
671 0.21
672 0.15
673 0.14
674 0.1
675 0.12
676 0.13
677 0.13
678 0.16
679 0.16
680 0.16
681 0.19
682 0.21
683 0.23
684 0.22
685 0.25
686 0.25
687 0.29
688 0.29
689 0.3
690 0.34
691 0.33
692 0.31
693 0.29
694 0.25
695 0.25
696 0.23
697 0.21
698 0.18
699 0.16
700 0.17
701 0.16
702 0.15
703 0.13
704 0.16
705 0.19
706 0.23
707 0.3
708 0.38
709 0.48
710 0.57
711 0.59
712 0.57
713 0.54
714 0.5
715 0.46
716 0.45
717 0.43
718 0.34
719 0.32
720 0.32
721 0.31
722 0.29
723 0.26
724 0.18
725 0.12
726 0.13
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.15
731 0.18
732 0.18
733 0.17
734 0.15
735 0.16
736 0.16
737 0.16
738 0.14
739 0.13
740 0.14
741 0.13
742 0.13
743 0.12
744 0.13
745 0.12
746 0.11
747 0.13
748 0.16
749 0.17
750 0.17
751 0.17
752 0.17
753 0.18
754 0.19
755 0.18
756 0.15
757 0.15
758 0.14
759 0.13
760 0.12
761 0.11
762 0.1
763 0.08
764 0.08
765 0.06
766 0.06
767 0.06
768 0.07
769 0.08
770 0.08
771 0.09
772 0.09
773 0.1
774 0.11
775 0.12
776 0.13
777 0.13
778 0.19
779 0.24
780 0.32
781 0.32
782 0.35
783 0.34
784 0.34
785 0.36
786 0.34
787 0.29
788 0.22
789 0.22
790 0.19
791 0.17
792 0.15
793 0.12
794 0.07
795 0.05
796 0.05
797 0.04
798 0.04
799 0.06
800 0.05
801 0.07
802 0.07
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.08
807 0.07
808 0.07
809 0.06
810 0.06
811 0.05
812 0.05
813 0.05
814 0.07
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.07
819 0.08
820 0.1
821 0.09
822 0.08
823 0.09
824 0.11
825 0.11
826 0.12
827 0.18
828 0.22
829 0.29
830 0.33
831 0.34
832 0.41
833 0.48
834 0.58
835 0.63
836 0.69
837 0.72
838 0.77
839 0.79
840 0.73
841 0.68
842 0.64
843 0.63
844 0.63
845 0.56
846 0.5
847 0.46
848 0.44
849 0.43
850 0.39
851 0.31
852 0.23
853 0.21
854 0.2
855 0.21
856 0.21
857 0.21
858 0.2
859 0.2
860 0.18
861 0.16
862 0.17
863 0.19
864 0.22
865 0.24
866 0.25
867 0.28
868 0.35
869 0.36
870 0.37
871 0.35
872 0.31
873 0.31
874 0.35
875 0.35
876 0.3
877 0.3
878 0.31
879 0.34
880 0.35
881 0.32
882 0.26
883 0.21
884 0.18
885 0.16
886 0.11
887 0.07
888 0.06
889 0.06
890 0.06
891 0.06
892 0.06
893 0.07
894 0.1
895 0.12
896 0.12
897 0.13
898 0.13
899 0.13
900 0.13
901 0.12
902 0.1
903 0.07
904 0.06
905 0.05
906 0.05
907 0.05
908 0.06
909 0.08
910 0.08
911 0.09
912 0.1
913 0.11
914 0.12
915 0.15
916 0.16
917 0.14
918 0.14
919 0.17
920 0.19
921 0.19
922 0.23
923 0.24
924 0.27
925 0.28
926 0.29
927 0.32
928 0.28
929 0.28
930 0.24
931 0.2
932 0.15
933 0.15
934 0.14
935 0.08
936 0.08
937 0.08
938 0.07
939 0.07
940 0.07
941 0.06
942 0.06
943 0.07
944 0.09
945 0.14
946 0.21
947 0.21
948 0.22
949 0.23
950 0.25
951 0.24
952 0.23
953 0.28
954 0.27
955 0.29
956 0.29
957 0.3
958 0.3
959 0.32
960 0.31
961 0.24
962 0.2
963 0.2
964 0.24
965 0.26
966 0.25
967 0.24
968 0.26
969 0.26
970 0.26
971 0.27
972 0.24
973 0.21
974 0.2
975 0.2
976 0.18
977 0.16
978 0.15
979 0.13
980 0.12
981 0.17
982 0.23
983 0.25
984 0.29
985 0.34
986 0.42
987 0.5
988 0.56
989 0.61
990 0.66
991 0.76
992 0.84
993 0.89
994 0.9
995 0.89
996 0.91
997 0.91
998 0.9
999 0.88
1000 0.87
1001 0.87
1002 0.87
1003 0.88
1004 0.89
1005 0.9
1006 0.89
1007 0.91
1008 0.92
1009 0.92
1010 0.89
1011 0.86
1012 0.86
1013 0.86
1014 0.85
1015 0.84
1016 0.81
1017 0.76
1018 0.72
1019 0.69
1020 0.64
1021 0.54
1022 0.48
1023 0.41
1024 0.35
1025 0.3
1026 0.27
1027 0.23
1028 0.17