Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDD4

Protein Details
Accession C1HDD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1034-1061TSHKNGPHGRHKRSTTPQQTDNNNREKQHydrophilic
1087-1115STPTGWQITTKKKTKRSNKVPAEPNHNNLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR002058  PAP_assoc  
IPR002934  Polymerase_NTP_transf_dom  
Gene Ontology GO:0005743  C:mitochondrial inner membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:1990817  F:poly(A) RNA polymerase activity  
GO:0031123  P:RNA 3'-end processing  
KEGG pbl:PAAG_08775  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01909  NTP_transf_2  
PF03828  PAP_assoc  
CDD cd05402  NT_PAP_TUTase  
Amino Acid Sequences MKSRTHGNAASSHNTGDISPIAPKTFSEMAWSIPADLPQHITLPPTFTSQHSSSLPSTPYQHPRDLQFTSRSPSPTRGNSSPRSTHSESTHLLPSSRRPHGGCKYETGMAHFRRRIPYSLGSELLPKETGPLKKQLDPADEKKLSGDMRELYDRLLPSEESEQRRLKFVNKLEKLLNKQWPGNNIRVRVFGSSGNKLCSSDSDVDICITTTYKELEKVCMLADFLAKSGMERVVCVSHARVPIVKIWDPELLLACDMNVNNTMALENTRMIRTYVDIDERVRPLAMILKYWTKRRILNDAALGGTLSSYTWICLIISFLQTRNPPVLPSLQKRCSKQQKNVGDSESSFDDDLEKLVGFGRDNKSSLGELLFQFFRYYGYEVDYETKVMSVREGSLISKEGKGWHLLQNNRLCVEEPFNTSRNLGNTADDTSFRGLHMELRRAFNAVSEGNFEECCEQYEYPPEEERNWERPPPQPRPILAPNPSISSRGGRGGGRGGRHNNHYNRVPNTGRRSSSSANRPNIQHTNPSFAADIALQAQQAQQAQYLLHDHLYQQIQILQAQEQELRMQLQNQALISGRAPPTLIRQPYLQFPFQHQEAVGQDENSRARAGTVNHPPLTAPVRQQVFFNPSFIPLSIPTIQDANANPPSPSIVPTAPETRRSHRRSSIASGSPRGPMRAQSQPARPLPSPIVQNFGNAHHSVPLSEAPHTPSPRLQPSSPKRADAEVDVLVPNGIPIFSRSYAEERRPSEYVGYYLGDSPQSQTIHHPSMGSPQSVMDGLAIQSSSLFSNLRNPTNYRHNAIVFTEQASLSLEHDHLPDHNPLSTHGQSSSQPKTQKDGGPLIVDGSISINERHYSMSVDNADQFGPMSLSTSASEDRPFDTPGSTSDTLSQGLPDHILYDEEFEKTYGRGRQDTQPHAHINGWDSVGANGVTLNGHSGRLETLSERLQRFQMSDTSRSAESHGKLNMNQVKGGKSYPCTAENGMVEKEHHVAHDNYVPLSTSAPALSPVKESRTSPATSKRRLNGLDPEKANGTSHKNGPHGRHKRSTTPQQTDNNNREKQTDPERRKPNGHPAANGAGGNEHHCGSTPTGWQITTKKKTKRSNKVPAEPNHNNLIKGVEPLPADESLRKGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.27
3 0.22
4 0.18
5 0.14
6 0.17
7 0.18
8 0.19
9 0.19
10 0.19
11 0.23
12 0.24
13 0.22
14 0.24
15 0.23
16 0.24
17 0.28
18 0.28
19 0.24
20 0.23
21 0.26
22 0.21
23 0.21
24 0.23
25 0.2
26 0.21
27 0.19
28 0.21
29 0.19
30 0.21
31 0.21
32 0.21
33 0.22
34 0.22
35 0.29
36 0.28
37 0.33
38 0.31
39 0.34
40 0.32
41 0.36
42 0.35
43 0.31
44 0.35
45 0.38
46 0.46
47 0.47
48 0.51
49 0.5
50 0.54
51 0.57
52 0.56
53 0.54
54 0.51
55 0.5
56 0.49
57 0.5
58 0.49
59 0.46
60 0.49
61 0.5
62 0.51
63 0.56
64 0.58
65 0.61
66 0.64
67 0.69
68 0.68
69 0.65
70 0.66
71 0.62
72 0.6
73 0.56
74 0.55
75 0.49
76 0.47
77 0.48
78 0.41
79 0.38
80 0.34
81 0.39
82 0.42
83 0.45
84 0.46
85 0.43
86 0.51
87 0.59
88 0.65
89 0.59
90 0.56
91 0.55
92 0.54
93 0.52
94 0.48
95 0.48
96 0.46
97 0.52
98 0.5
99 0.51
100 0.54
101 0.57
102 0.55
103 0.52
104 0.53
105 0.51
106 0.51
107 0.47
108 0.4
109 0.41
110 0.38
111 0.34
112 0.27
113 0.19
114 0.19
115 0.24
116 0.29
117 0.28
118 0.36
119 0.38
120 0.44
121 0.5
122 0.53
123 0.55
124 0.57
125 0.59
126 0.6
127 0.57
128 0.51
129 0.46
130 0.45
131 0.38
132 0.31
133 0.3
134 0.22
135 0.26
136 0.3
137 0.29
138 0.25
139 0.29
140 0.27
141 0.24
142 0.24
143 0.19
144 0.18
145 0.26
146 0.32
147 0.33
148 0.4
149 0.44
150 0.43
151 0.48
152 0.47
153 0.44
154 0.46
155 0.49
156 0.53
157 0.51
158 0.54
159 0.56
160 0.62
161 0.64
162 0.64
163 0.64
164 0.58
165 0.6
166 0.59
167 0.61
168 0.58
169 0.6
170 0.57
171 0.54
172 0.51
173 0.48
174 0.46
175 0.39
176 0.36
177 0.33
178 0.32
179 0.35
180 0.35
181 0.35
182 0.34
183 0.33
184 0.32
185 0.28
186 0.28
187 0.24
188 0.23
189 0.22
190 0.22
191 0.21
192 0.21
193 0.19
194 0.13
195 0.11
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.12
200 0.16
201 0.17
202 0.2
203 0.21
204 0.21
205 0.2
206 0.19
207 0.18
208 0.14
209 0.15
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.18
225 0.2
226 0.21
227 0.21
228 0.21
229 0.24
230 0.29
231 0.3
232 0.25
233 0.26
234 0.27
235 0.25
236 0.25
237 0.22
238 0.17
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.16
261 0.17
262 0.19
263 0.2
264 0.22
265 0.26
266 0.26
267 0.25
268 0.21
269 0.18
270 0.15
271 0.2
272 0.19
273 0.16
274 0.18
275 0.26
276 0.29
277 0.35
278 0.39
279 0.36
280 0.41
281 0.44
282 0.5
283 0.46
284 0.48
285 0.45
286 0.42
287 0.38
288 0.33
289 0.28
290 0.18
291 0.13
292 0.08
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.17
307 0.18
308 0.19
309 0.21
310 0.19
311 0.17
312 0.18
313 0.25
314 0.28
315 0.35
316 0.42
317 0.47
318 0.53
319 0.56
320 0.65
321 0.69
322 0.71
323 0.72
324 0.73
325 0.74
326 0.74
327 0.75
328 0.67
329 0.58
330 0.5
331 0.43
332 0.34
333 0.26
334 0.2
335 0.15
336 0.14
337 0.11
338 0.11
339 0.09
340 0.07
341 0.06
342 0.08
343 0.09
344 0.08
345 0.14
346 0.18
347 0.2
348 0.21
349 0.21
350 0.22
351 0.21
352 0.21
353 0.16
354 0.15
355 0.13
356 0.15
357 0.15
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.12
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.13
368 0.16
369 0.15
370 0.14
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.1
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.17
389 0.18
390 0.22
391 0.27
392 0.29
393 0.36
394 0.39
395 0.4
396 0.38
397 0.36
398 0.31
399 0.25
400 0.27
401 0.22
402 0.21
403 0.23
404 0.24
405 0.24
406 0.24
407 0.24
408 0.22
409 0.23
410 0.19
411 0.16
412 0.16
413 0.18
414 0.18
415 0.16
416 0.16
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.09
422 0.15
423 0.18
424 0.23
425 0.25
426 0.27
427 0.28
428 0.28
429 0.27
430 0.22
431 0.21
432 0.15
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.11
444 0.11
445 0.19
446 0.21
447 0.22
448 0.24
449 0.23
450 0.22
451 0.27
452 0.31
453 0.3
454 0.3
455 0.31
456 0.31
457 0.37
458 0.44
459 0.47
460 0.48
461 0.47
462 0.45
463 0.49
464 0.53
465 0.53
466 0.48
467 0.44
468 0.38
469 0.37
470 0.37
471 0.31
472 0.25
473 0.2
474 0.18
475 0.16
476 0.17
477 0.14
478 0.15
479 0.18
480 0.2
481 0.2
482 0.24
483 0.27
484 0.27
485 0.32
486 0.4
487 0.38
488 0.41
489 0.44
490 0.45
491 0.43
492 0.46
493 0.44
494 0.42
495 0.46
496 0.46
497 0.42
498 0.39
499 0.42
500 0.39
501 0.44
502 0.47
503 0.48
504 0.46
505 0.49
506 0.47
507 0.48
508 0.5
509 0.44
510 0.41
511 0.34
512 0.36
513 0.33
514 0.33
515 0.27
516 0.22
517 0.21
518 0.13
519 0.13
520 0.08
521 0.08
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.11
538 0.12
539 0.11
540 0.1
541 0.11
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.1
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.11
556 0.11
557 0.12
558 0.11
559 0.12
560 0.11
561 0.11
562 0.1
563 0.11
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.14
569 0.2
570 0.21
571 0.17
572 0.19
573 0.2
574 0.26
575 0.29
576 0.27
577 0.22
578 0.24
579 0.26
580 0.25
581 0.24
582 0.18
583 0.17
584 0.15
585 0.19
586 0.16
587 0.13
588 0.13
589 0.15
590 0.15
591 0.14
592 0.13
593 0.09
594 0.09
595 0.11
596 0.14
597 0.18
598 0.25
599 0.3
600 0.3
601 0.3
602 0.29
603 0.29
604 0.29
605 0.24
606 0.18
607 0.19
608 0.2
609 0.21
610 0.21
611 0.22
612 0.25
613 0.23
614 0.23
615 0.18
616 0.17
617 0.17
618 0.17
619 0.15
620 0.1
621 0.14
622 0.14
623 0.14
624 0.13
625 0.13
626 0.13
627 0.14
628 0.14
629 0.15
630 0.16
631 0.16
632 0.15
633 0.15
634 0.16
635 0.15
636 0.16
637 0.13
638 0.11
639 0.12
640 0.15
641 0.21
642 0.21
643 0.28
644 0.3
645 0.34
646 0.44
647 0.47
648 0.51
649 0.51
650 0.55
651 0.52
652 0.55
653 0.56
654 0.52
655 0.5
656 0.46
657 0.41
658 0.4
659 0.36
660 0.31
661 0.24
662 0.21
663 0.23
664 0.27
665 0.3
666 0.32
667 0.37
668 0.42
669 0.45
670 0.46
671 0.41
672 0.38
673 0.36
674 0.35
675 0.34
676 0.27
677 0.28
678 0.24
679 0.25
680 0.23
681 0.22
682 0.22
683 0.18
684 0.17
685 0.15
686 0.15
687 0.13
688 0.13
689 0.14
690 0.12
691 0.13
692 0.14
693 0.16
694 0.21
695 0.22
696 0.22
697 0.23
698 0.27
699 0.32
700 0.35
701 0.33
702 0.38
703 0.44
704 0.54
705 0.53
706 0.5
707 0.45
708 0.43
709 0.43
710 0.34
711 0.3
712 0.2
713 0.19
714 0.16
715 0.15
716 0.13
717 0.11
718 0.09
719 0.05
720 0.04
721 0.03
722 0.05
723 0.08
724 0.09
725 0.11
726 0.12
727 0.18
728 0.23
729 0.28
730 0.34
731 0.32
732 0.36
733 0.37
734 0.36
735 0.32
736 0.29
737 0.24
738 0.2
739 0.18
740 0.14
741 0.13
742 0.13
743 0.12
744 0.11
745 0.11
746 0.14
747 0.14
748 0.14
749 0.17
750 0.22
751 0.24
752 0.25
753 0.24
754 0.19
755 0.27
756 0.29
757 0.25
758 0.19
759 0.17
760 0.17
761 0.16
762 0.16
763 0.08
764 0.06
765 0.06
766 0.06
767 0.06
768 0.05
769 0.05
770 0.06
771 0.06
772 0.06
773 0.06
774 0.06
775 0.15
776 0.2
777 0.23
778 0.26
779 0.28
780 0.32
781 0.42
782 0.45
783 0.4
784 0.39
785 0.37
786 0.36
787 0.36
788 0.34
789 0.24
790 0.22
791 0.21
792 0.17
793 0.16
794 0.15
795 0.14
796 0.11
797 0.12
798 0.11
799 0.1
800 0.1
801 0.11
802 0.1
803 0.13
804 0.15
805 0.15
806 0.16
807 0.15
808 0.17
809 0.24
810 0.24
811 0.22
812 0.2
813 0.21
814 0.23
815 0.3
816 0.33
817 0.32
818 0.36
819 0.36
820 0.4
821 0.44
822 0.45
823 0.43
824 0.43
825 0.4
826 0.36
827 0.35
828 0.31
829 0.24
830 0.2
831 0.15
832 0.1
833 0.09
834 0.08
835 0.09
836 0.09
837 0.1
838 0.1
839 0.11
840 0.11
841 0.13
842 0.12
843 0.17
844 0.17
845 0.18
846 0.19
847 0.18
848 0.18
849 0.15
850 0.15
851 0.1
852 0.08
853 0.07
854 0.08
855 0.07
856 0.09
857 0.09
858 0.11
859 0.12
860 0.13
861 0.15
862 0.14
863 0.15
864 0.16
865 0.17
866 0.16
867 0.16
868 0.15
869 0.16
870 0.23
871 0.22
872 0.2
873 0.21
874 0.22
875 0.21
876 0.21
877 0.2
878 0.13
879 0.13
880 0.13
881 0.1
882 0.1
883 0.09
884 0.1
885 0.09
886 0.11
887 0.12
888 0.12
889 0.12
890 0.12
891 0.12
892 0.12
893 0.18
894 0.19
895 0.22
896 0.25
897 0.29
898 0.37
899 0.45
900 0.52
901 0.51
902 0.53
903 0.52
904 0.5
905 0.48
906 0.41
907 0.36
908 0.31
909 0.26
910 0.2
911 0.18
912 0.16
913 0.15
914 0.13
915 0.1
916 0.07
917 0.07
918 0.07
919 0.06
920 0.08
921 0.07
922 0.08
923 0.08
924 0.09
925 0.09
926 0.1
927 0.12
928 0.1
929 0.13
930 0.19
931 0.25
932 0.27
933 0.28
934 0.29
935 0.3
936 0.3
937 0.29
938 0.31
939 0.29
940 0.31
941 0.32
942 0.33
943 0.32
944 0.31
945 0.32
946 0.31
947 0.28
948 0.3
949 0.32
950 0.32
951 0.32
952 0.41
953 0.44
954 0.39
955 0.41
956 0.37
957 0.35
958 0.34
959 0.36
960 0.3
961 0.27
962 0.3
963 0.31
964 0.31
965 0.32
966 0.31
967 0.33
968 0.31
969 0.32
970 0.29
971 0.26
972 0.25
973 0.23
974 0.23
975 0.19
976 0.18
977 0.18
978 0.18
979 0.2
980 0.24
981 0.24
982 0.22
983 0.22
984 0.22
985 0.18
986 0.18
987 0.15
988 0.11
989 0.1
990 0.1
991 0.13
992 0.14
993 0.15
994 0.19
995 0.21
996 0.25
997 0.28
998 0.29
999 0.31
1000 0.34
1001 0.36
1002 0.38
1003 0.45
1004 0.5
1005 0.55
1006 0.62
1007 0.61
1008 0.65
1009 0.65
1010 0.64
1011 0.64
1012 0.63
1013 0.64
1014 0.57
1015 0.55
1016 0.49
1017 0.47
1018 0.42
1019 0.37
1020 0.36
1021 0.33
1022 0.38
1023 0.41
1024 0.45
1025 0.51
1026 0.57
1027 0.63
1028 0.66
1029 0.69
1030 0.73
1031 0.73
1032 0.76
1033 0.79
1034 0.82
1035 0.82
1036 0.8
1037 0.8
1038 0.79
1039 0.83
1040 0.83
1041 0.83
1042 0.81
1043 0.75
1044 0.69
1045 0.64
1046 0.59
1047 0.56
1048 0.57
1049 0.59
1050 0.59
1051 0.64
1052 0.72
1053 0.75
1054 0.79
1055 0.79
1056 0.8
1057 0.79
1058 0.75
1059 0.67
1060 0.64
1061 0.62
1062 0.57
1063 0.49
1064 0.38
1065 0.3
1066 0.26
1067 0.25
1068 0.21
1069 0.17
1070 0.14
1071 0.14
1072 0.17
1073 0.18
1074 0.21
1075 0.22
1076 0.25
1077 0.27
1078 0.28
1079 0.32
1080 0.38
1081 0.45
1082 0.5
1083 0.56
1084 0.61
1085 0.68
1086 0.79
1087 0.85
1088 0.88
1089 0.89
1090 0.9
1091 0.91
1092 0.92
1093 0.92
1094 0.9
1095 0.89
1096 0.85
1097 0.78
1098 0.76
1099 0.68
1100 0.58
1101 0.49
1102 0.44
1103 0.34
1104 0.32
1105 0.28
1106 0.23
1107 0.21
1108 0.22
1109 0.24
1110 0.22
1111 0.24
1112 0.22