FuNGI

C1HCS5

Protein Details

Accession

C1HCS5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
213-232	ETKGNSPRRRRWFTRKGFEC	Hydrophilic
419-438	NSFFERAKRKASRKLSAFPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity
KEGG	pbl:PAAG_08566 -
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MSPFYFSLPLAPWEQPLSFRAAWYERRKDGREHKELGEGNVAEDEISNIDTNDYDASVSRNTRSNTLNSSPKSSLILSPDEAHQYRIAGQPFHKKLPGDDFPHARPGSDKTTRITKRDIETELSQLSPPLFISEPANQSSLRLQHLAVITTILHKCLLEGDYTRAGRAWGLILRDEFGGHAVDVRNGGRWGVGAEILLWSDKDTVTAQSSGMETKGNSPRRRRWFTRKGFECAKSYYERLVLQFPYRKSAPRALGPLDFYPAMFGLWISLVQEESQSAREEALDMEDMDDFDMYQDEMSISNNIPRKNSRKDDIIANARRKELEEAHQISVRMDELVISPPFSDSYELLRLRGMVSLWIADLFISSVSADNGDAGSVGNFGDENMLSEEGSGGHVDSELARMEHGLRMERKMAEVEKANSFFERAKRKASRKLSAFPSDETDEGEDVDVDETATEISKIIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.24
3	0.23
4	0.27
5	0.24
6	0.23
7	0.27
8	0.3
9	0.38
10	0.46
11	0.53
12	0.54
13	0.62
14	0.65
15	0.69
16	0.74
17	0.75
18	0.74
19	0.71
20	0.65
21	0.66
22	0.64
23	0.57
24	0.54
25	0.43
26	0.35
27	0.3
28	0.28
29	0.19
30	0.17
31	0.14
32	0.08
33	0.09
34	0.08
35	0.08
36	0.08
37	0.08
38	0.09
39	0.09
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.11
44	0.15
45	0.17
46	0.18
47	0.24
48	0.26
49	0.3
50	0.33
51	0.35
52	0.38
53	0.43
54	0.49
55	0.45
56	0.5
57	0.47
58	0.44
59	0.43
60	0.37
61	0.33
62	0.28
63	0.29
64	0.24
65	0.25
66	0.26
67	0.29
68	0.28
69	0.27
70	0.24
71	0.21
72	0.22
73	0.26
74	0.26
75	0.23
76	0.27
77	0.36
78	0.4
79	0.43
80	0.44
81	0.39
82	0.4
83	0.45
84	0.48
85	0.44
86	0.46
87	0.47
88	0.45
89	0.53
90	0.49
91	0.41
92	0.35
93	0.34
94	0.36
95	0.37
96	0.38
97	0.32
98	0.43
99	0.47
100	0.49
101	0.5
102	0.47
103	0.46
104	0.49
105	0.49
106	0.44
107	0.41
108	0.41
109	0.36
110	0.31
111	0.26
112	0.21
113	0.18
114	0.13
115	0.11
116	0.1
117	0.09
118	0.09
119	0.13
120	0.17
121	0.19
122	0.2
123	0.22
124	0.19
125	0.2
126	0.23
127	0.22
128	0.2
129	0.18
130	0.16
131	0.19
132	0.2
133	0.2
134	0.16
135	0.14
136	0.12
137	0.15
138	0.16
139	0.12
140	0.11
141	0.1
142	0.1
143	0.12
144	0.12
145	0.09
146	0.11
147	0.13
148	0.19
149	0.19
150	0.19
151	0.17
152	0.17
153	0.15
154	0.14
155	0.13
156	0.09
157	0.1
158	0.11
159	0.11
160	0.12
161	0.12
162	0.12
163	0.09
164	0.08
165	0.08
166	0.06
167	0.08
168	0.07
169	0.08
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.08
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.06
190	0.07
191	0.08
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.09
200	0.07
201	0.13
202	0.21
203	0.29
204	0.34
205	0.41
206	0.5
207	0.59
208	0.67
209	0.68
210	0.71
211	0.74
212	0.78
213	0.81
214	0.77
215	0.73
216	0.72
217	0.67
218	0.59
219	0.5
220	0.44
221	0.36
222	0.32
223	0.27
224	0.23
225	0.21
226	0.19
227	0.2
228	0.18
229	0.2
230	0.24
231	0.23
232	0.25
233	0.25
234	0.26
235	0.27
236	0.32
237	0.31
238	0.29
239	0.32
240	0.3
241	0.31
242	0.3
243	0.27
244	0.23
245	0.19
246	0.15
247	0.13
248	0.1
249	0.08
250	0.06
251	0.05
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.07
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.08
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.06
277	0.05
278	0.04
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.05
285	0.06
286	0.07
287	0.07
288	0.12
289	0.16
290	0.17
291	0.2
292	0.26
293	0.33
294	0.41
295	0.47
296	0.47
297	0.49
298	0.5
299	0.53
300	0.54
301	0.57
302	0.56
303	0.57
304	0.55
305	0.51
306	0.49
307	0.44
308	0.4
309	0.34
310	0.32
311	0.34
312	0.36
313	0.37
314	0.39
315	0.37
316	0.33
317	0.3
318	0.24
319	0.15
320	0.1
321	0.08
322	0.07
323	0.12
324	0.12
325	0.11
326	0.11
327	0.11
328	0.12
329	0.12
330	0.13
331	0.09
332	0.14
333	0.21
334	0.21
335	0.21
336	0.21
337	0.21
338	0.19
339	0.2
340	0.15
341	0.09
342	0.09
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.08
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.05
368	0.06
369	0.06
370	0.08
371	0.09
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.1
376	0.09
377	0.1
378	0.08
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.09
389	0.1
390	0.13
391	0.15
392	0.2
393	0.22
394	0.25
395	0.3
396	0.3
397	0.3
398	0.33
399	0.33
400	0.31
401	0.35
402	0.35
403	0.38
404	0.39
405	0.39
406	0.34
407	0.35
408	0.34
409	0.35
410	0.42
411	0.38
412	0.46
413	0.55
414	0.63
415	0.71
416	0.76
417	0.78
418	0.75
419	0.81
420	0.79
421	0.78
422	0.73
423	0.65
424	0.61
425	0.54
426	0.47
427	0.41
428	0.35
429	0.26
430	0.23
431	0.21
432	0.15
433	0.12
434	0.13
435	0.1
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.06

C1HCS5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer