Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X8Y6

Protein Details
Accession W3X8Y6    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-52AHMKKASKEKAEKADKKNLLHydrophilic
336-359EETAPATKKAKKTKAKAQPESDDSHydrophilic
362-385DKEIAERKAKLKKQKAAAKKAVDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-42SKEK
193-206RNKPKVDGKKVKKV
325-330GKKRKS
340-352PATKKAKKTKAKA
366-381AERKAKLKKQKAAAKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 13, cyto 12.5, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG pfy:PFICI_04381  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAPTKEMKLRSSDAALQLVDPDQTLKASKALLAHMKKASKEKAEKADKKNLLAADSDDETSLNEQPVWLTLTTKRHIVDSSRLKPGKIVLPHPLNTDPELSVCLISADPQRHYKNLVASEEFPEEWRKRVTRVIDVGKLQAKFKQYEEQRKLYAEHDIFLGDSRIITRLPKVLGKTFYKNTAKRPIPVNLESRNKPKVDGKKVKKVKGDDTPKSCTPAELAAEIEKAVGSALVHLSPSTNTAVRVGYAGWSADKIAANANAVAEVLVEKYVPQKDKNVRAMYLKGSETVALPLYLADELWLDGQKDIMTKEAEEAKALAEKPNVGKKRKSLDAQPEETAPATKKAKKTKAKAQPESDDSHLDKEIAERKAKLKKQKAAAKKAVDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.31
4 0.28
5 0.25
6 0.21
7 0.15
8 0.13
9 0.1
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.16
16 0.17
17 0.22
18 0.3
19 0.32
20 0.37
21 0.42
22 0.45
23 0.48
24 0.53
25 0.55
26 0.55
27 0.6
28 0.62
29 0.66
30 0.74
31 0.79
32 0.78
33 0.82
34 0.76
35 0.71
36 0.67
37 0.58
38 0.48
39 0.4
40 0.35
41 0.28
42 0.25
43 0.23
44 0.18
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.13
50 0.11
51 0.1
52 0.1
53 0.12
54 0.13
55 0.11
56 0.12
57 0.17
58 0.24
59 0.25
60 0.29
61 0.28
62 0.28
63 0.3
64 0.32
65 0.36
66 0.4
67 0.44
68 0.5
69 0.51
70 0.49
71 0.48
72 0.48
73 0.45
74 0.4
75 0.38
76 0.37
77 0.42
78 0.44
79 0.46
80 0.44
81 0.39
82 0.35
83 0.33
84 0.24
85 0.19
86 0.19
87 0.15
88 0.12
89 0.1
90 0.1
91 0.07
92 0.1
93 0.14
94 0.15
95 0.18
96 0.25
97 0.27
98 0.28
99 0.31
100 0.32
101 0.33
102 0.35
103 0.36
104 0.31
105 0.31
106 0.33
107 0.32
108 0.29
109 0.24
110 0.26
111 0.24
112 0.23
113 0.27
114 0.25
115 0.25
116 0.31
117 0.34
118 0.33
119 0.4
120 0.43
121 0.42
122 0.42
123 0.43
124 0.42
125 0.39
126 0.33
127 0.29
128 0.27
129 0.24
130 0.25
131 0.3
132 0.33
133 0.43
134 0.48
135 0.49
136 0.48
137 0.47
138 0.47
139 0.4
140 0.4
141 0.29
142 0.23
143 0.19
144 0.17
145 0.16
146 0.14
147 0.14
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.12
157 0.15
158 0.16
159 0.2
160 0.25
161 0.28
162 0.32
163 0.31
164 0.38
165 0.43
166 0.44
167 0.46
168 0.51
169 0.49
170 0.47
171 0.5
172 0.46
173 0.45
174 0.46
175 0.45
176 0.42
177 0.47
178 0.46
179 0.47
180 0.46
181 0.4
182 0.38
183 0.4
184 0.42
185 0.47
186 0.54
187 0.56
188 0.62
189 0.7
190 0.74
191 0.72
192 0.67
193 0.63
194 0.62
195 0.64
196 0.61
197 0.59
198 0.59
199 0.54
200 0.53
201 0.47
202 0.37
203 0.29
204 0.24
205 0.2
206 0.14
207 0.14
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.05
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.09
257 0.14
258 0.17
259 0.19
260 0.27
261 0.35
262 0.45
263 0.53
264 0.52
265 0.5
266 0.51
267 0.52
268 0.47
269 0.43
270 0.35
271 0.27
272 0.24
273 0.22
274 0.19
275 0.17
276 0.14
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.15
298 0.21
299 0.2
300 0.19
301 0.19
302 0.17
303 0.21
304 0.21
305 0.21
306 0.17
307 0.2
308 0.25
309 0.35
310 0.42
311 0.43
312 0.48
313 0.52
314 0.59
315 0.64
316 0.64
317 0.64
318 0.67
319 0.7
320 0.69
321 0.64
322 0.57
323 0.5
324 0.45
325 0.39
326 0.3
327 0.28
328 0.31
329 0.35
330 0.42
331 0.51
332 0.6
333 0.67
334 0.74
335 0.78
336 0.81
337 0.86
338 0.88
339 0.86
340 0.85
341 0.8
342 0.76
343 0.68
344 0.64
345 0.55
346 0.48
347 0.4
348 0.32
349 0.27
350 0.28
351 0.32
352 0.32
353 0.35
354 0.35
355 0.42
356 0.52
357 0.59
358 0.64
359 0.67
360 0.7
361 0.75
362 0.81
363 0.85
364 0.85
365 0.87