Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3WPH1

Protein Details
Accession W3WPH1    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MGVRRCKKKPRGTWKGRRGARSLDBasic
202-221LGNFRRKSSTKRHRPSQTFVHydrophilic
469-488NAPKAKPAKLEKRQIEQRIEHydrophilic
553-575EYLAREQAKKKPHDRTQNGFTTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-25CKKKPRGTWKGRRGARSLDR
179-184RGRKRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR042326  Ctk3  
IPR024637  Ctk3_C  
IPR024638  Ctk3_N  
IPR008942  ENTH_VHS  
Gene Ontology GO:0070692  C:CTDK-1 complex  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
KEGG pfy:PFICI_12648  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12243  CTK3  
PF12350  CTK3_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
Amino Acid Sequences MGVRRCKKKPRGTWKGRRGARSLDRRQALNHRRDSDSDSVGLPLSIRQGSPEGSSYQVRDKPRDKPDDDKRAHSTSSLLTPLTDHNIVSHKDEDLSSNQEYQYDEYQLRAKRNLARAANDSLRQQFHPAAVAGELAQGNRPPTPIPQSPHWDIYTRASSHHQPRDKPNNPKTNYGSGNRGRKRKAHDSSQSKSWTDARVDFLGNFRRKSSTKRHRPSQTFVPQPEQADRNPPNCGNSDDDEDDEPLIPLSVALASLRPTQPAFWSFRNIRNWAKAPEIVEQDRRRKIIEDYDLNMADPFEVRMRFSGQLQHLNASVVSAQKAAQYAMKHRDMSEDLHSCILEQLEKNSMNTRANIMYFIEPFLELAEKERNGNDYIRRMQRDIIRVVDAVCPEDGSGAANVKVVRKVLRGLMGKGFLLEQTVEEIEECLKDRAAASHADLGFSSPVNGTADSAAKGTDYKATTAIADANAPKAKPAKLEKRQIEQRIEEDRERHKKMRENMWVTPKDQEEKLRKLWDEVSDCGEDDDRLGQEDEDECVELTGTGVDQAARRSEYLAREQAKKKPHDRTQNGFTTDLEGDVRMNGNHLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.95
2 0.95
3 0.91
4 0.87
5 0.81
6 0.8
7 0.79
8 0.78
9 0.77
10 0.77
11 0.74
12 0.69
13 0.7
14 0.71
15 0.71
16 0.69
17 0.69
18 0.64
19 0.63
20 0.64
21 0.64
22 0.59
23 0.52
24 0.44
25 0.35
26 0.31
27 0.28
28 0.25
29 0.18
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.13
34 0.14
35 0.16
36 0.18
37 0.2
38 0.21
39 0.18
40 0.21
41 0.24
42 0.24
43 0.3
44 0.35
45 0.38
46 0.45
47 0.49
48 0.55
49 0.62
50 0.69
51 0.66
52 0.7
53 0.75
54 0.78
55 0.76
56 0.74
57 0.71
58 0.65
59 0.61
60 0.51
61 0.43
62 0.35
63 0.36
64 0.31
65 0.24
66 0.2
67 0.2
68 0.22
69 0.24
70 0.22
71 0.17
72 0.17
73 0.22
74 0.24
75 0.26
76 0.25
77 0.21
78 0.21
79 0.22
80 0.23
81 0.21
82 0.24
83 0.22
84 0.24
85 0.23
86 0.23
87 0.24
88 0.24
89 0.23
90 0.22
91 0.21
92 0.2
93 0.27
94 0.29
95 0.33
96 0.33
97 0.36
98 0.39
99 0.47
100 0.53
101 0.51
102 0.51
103 0.51
104 0.54
105 0.53
106 0.48
107 0.44
108 0.41
109 0.39
110 0.35
111 0.34
112 0.29
113 0.25
114 0.25
115 0.22
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.15
130 0.22
131 0.27
132 0.3
133 0.35
134 0.42
135 0.45
136 0.49
137 0.46
138 0.4
139 0.37
140 0.38
141 0.38
142 0.31
143 0.29
144 0.29
145 0.36
146 0.43
147 0.51
148 0.51
149 0.5
150 0.6
151 0.69
152 0.74
153 0.77
154 0.77
155 0.78
156 0.75
157 0.77
158 0.72
159 0.69
160 0.65
161 0.58
162 0.57
163 0.54
164 0.62
165 0.61
166 0.63
167 0.6
168 0.6
169 0.65
170 0.67
171 0.66
172 0.66
173 0.69
174 0.71
175 0.71
176 0.73
177 0.69
178 0.58
179 0.54
180 0.47
181 0.41
182 0.35
183 0.33
184 0.29
185 0.26
186 0.26
187 0.24
188 0.25
189 0.3
190 0.31
191 0.3
192 0.27
193 0.3
194 0.31
195 0.38
196 0.45
197 0.47
198 0.54
199 0.63
200 0.71
201 0.76
202 0.81
203 0.8
204 0.79
205 0.77
206 0.73
207 0.66
208 0.62
209 0.54
210 0.5
211 0.47
212 0.39
213 0.31
214 0.33
215 0.34
216 0.31
217 0.33
218 0.31
219 0.3
220 0.29
221 0.3
222 0.25
223 0.23
224 0.25
225 0.22
226 0.22
227 0.21
228 0.2
229 0.18
230 0.14
231 0.12
232 0.08
233 0.07
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.05
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.16
249 0.19
250 0.17
251 0.24
252 0.26
253 0.32
254 0.37
255 0.39
256 0.38
257 0.4
258 0.42
259 0.38
260 0.37
261 0.32
262 0.29
263 0.29
264 0.3
265 0.27
266 0.32
267 0.35
268 0.4
269 0.41
270 0.4
271 0.36
272 0.34
273 0.34
274 0.33
275 0.34
276 0.3
277 0.29
278 0.31
279 0.3
280 0.28
281 0.26
282 0.18
283 0.12
284 0.09
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.17
294 0.18
295 0.23
296 0.24
297 0.24
298 0.22
299 0.21
300 0.2
301 0.14
302 0.13
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.1
311 0.11
312 0.16
313 0.21
314 0.24
315 0.24
316 0.24
317 0.26
318 0.25
319 0.27
320 0.28
321 0.24
322 0.21
323 0.22
324 0.21
325 0.18
326 0.17
327 0.15
328 0.1
329 0.08
330 0.09
331 0.13
332 0.14
333 0.15
334 0.17
335 0.2
336 0.2
337 0.2
338 0.21
339 0.18
340 0.18
341 0.18
342 0.16
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.11
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.08
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.14
357 0.15
358 0.17
359 0.2
360 0.21
361 0.24
362 0.31
363 0.36
364 0.38
365 0.37
366 0.4
367 0.42
368 0.44
369 0.4
370 0.35
371 0.3
372 0.28
373 0.28
374 0.26
375 0.2
376 0.16
377 0.13
378 0.11
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.06
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.13
390 0.14
391 0.15
392 0.16
393 0.17
394 0.18
395 0.25
396 0.26
397 0.27
398 0.28
399 0.28
400 0.26
401 0.24
402 0.22
403 0.14
404 0.13
405 0.1
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.13
423 0.19
424 0.19
425 0.19
426 0.18
427 0.17
428 0.16
429 0.15
430 0.14
431 0.07
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.12
438 0.11
439 0.11
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.14
445 0.13
446 0.14
447 0.15
448 0.15
449 0.15
450 0.16
451 0.17
452 0.11
453 0.13
454 0.13
455 0.17
456 0.19
457 0.18
458 0.2
459 0.23
460 0.24
461 0.28
462 0.38
463 0.44
464 0.51
465 0.61
466 0.65
467 0.71
468 0.79
469 0.8
470 0.77
471 0.7
472 0.67
473 0.66
474 0.64
475 0.58
476 0.55
477 0.57
478 0.6
479 0.63
480 0.63
481 0.61
482 0.64
483 0.69
484 0.73
485 0.74
486 0.71
487 0.73
488 0.77
489 0.73
490 0.66
491 0.63
492 0.57
493 0.51
494 0.47
495 0.48
496 0.47
497 0.5
498 0.55
499 0.57
500 0.53
501 0.53
502 0.54
503 0.52
504 0.48
505 0.44
506 0.42
507 0.35
508 0.34
509 0.32
510 0.28
511 0.2
512 0.16
513 0.17
514 0.13
515 0.14
516 0.15
517 0.13
518 0.14
519 0.15
520 0.16
521 0.14
522 0.14
523 0.12
524 0.11
525 0.11
526 0.09
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.08
533 0.09
534 0.12
535 0.15
536 0.16
537 0.17
538 0.19
539 0.23
540 0.27
541 0.34
542 0.4
543 0.42
544 0.5
545 0.55
546 0.6
547 0.64
548 0.69
549 0.7
550 0.72
551 0.76
552 0.79
553 0.82
554 0.84
555 0.84
556 0.83
557 0.78
558 0.68
559 0.59
560 0.52
561 0.43
562 0.36
563 0.27
564 0.19
565 0.16
566 0.16
567 0.18
568 0.13