Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H8I5

Protein Details
Accession C1H8I5    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-56QGTFPIRSADKRRSRKNHSLDSRETQDHydrophilic
376-395ESRFCPSWRRCQRCRERGHDHydrophilic
600-639LPRQMCRKSNWHSRDRSHSLSPPRSPPRPRGPPPQQTAGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
621-659PPRSPPRPRGPPPQQTAGRGKGRSGGGPRSRGRGVKGGS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG pbl:PAAG_06981  -  
Amino Acid Sequences MSDEDVACDSRTASVGLLRARNKDTSSGSQGTFPIRSADKRRSRKNHSLDSRETQDFVPKGTLFTSTSLAVYSASSSSPDTNTENSCDTASADHVSSPISRPLSRGGAPSMNWNKLSKGTVRTALRGRRQTEAASAAATSSFETVNGKYWRNRSTSTSSRGSGDQSHRMRNQDQSDSKHGVSWSKLQAETSRDQTTYSAEFSDMESGEDTHEDNDIVLNLSGSAKVDAAQEARGWTSDVQGNDLPREDSSVLGARYPNGEGFGETIGSEINVKVGDRILVTPLHAEASEEKTPSEAPKAEAIRSFRARYHSDPITLADLTRDDLEIQARYIFFDMPPENLDLRLPVRCTECMKEGHLADICPSKECEHCGTWSVHESRFCPSWRRCQRCRERGHDAVYCHSPLKGSATEQPCDFCGSKEHTEDDCDLLWKLPKRTPTSGRIFISISCCYCTSNRHLIGDCPMRDYPMNSSSFSLKHYDPSMFSNLNSFHDVIYGRGNKNQGSSGHKVRGRADGWSPSPESDGAFGRSDNWNPLTRSPQRGRIRFSNGIGRGRNLDDDTRRPQVSGNGSYNTNDYRRGYRDRDQYHDSSTRQRSLSPNRSLPRQMCRKSNWHSRDRSHSLSPPRSPPRPRGPPPQQTAGRGKGRSGGGPRSRGRGVKGGSNRETYRHMPSTAKKAWEQHRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.18
3 0.23
4 0.3
5 0.32
6 0.37
7 0.4
8 0.43
9 0.42
10 0.43
11 0.44
12 0.44
13 0.48
14 0.47
15 0.44
16 0.43
17 0.44
18 0.42
19 0.37
20 0.3
21 0.28
22 0.27
23 0.34
24 0.39
25 0.47
26 0.53
27 0.62
28 0.73
29 0.78
30 0.84
31 0.87
32 0.89
33 0.89
34 0.89
35 0.88
36 0.85
37 0.82
38 0.79
39 0.7
40 0.62
41 0.52
42 0.5
43 0.42
44 0.36
45 0.33
46 0.27
47 0.26
48 0.25
49 0.26
50 0.2
51 0.21
52 0.21
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.15
57 0.13
58 0.11
59 0.11
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.13
65 0.14
66 0.17
67 0.18
68 0.21
69 0.23
70 0.25
71 0.26
72 0.25
73 0.24
74 0.21
75 0.19
76 0.17
77 0.17
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.19
86 0.21
87 0.21
88 0.22
89 0.27
90 0.31
91 0.31
92 0.32
93 0.3
94 0.3
95 0.3
96 0.39
97 0.41
98 0.4
99 0.4
100 0.39
101 0.36
102 0.36
103 0.39
104 0.34
105 0.33
106 0.33
107 0.39
108 0.4
109 0.45
110 0.49
111 0.54
112 0.58
113 0.6
114 0.58
115 0.54
116 0.54
117 0.5
118 0.46
119 0.41
120 0.32
121 0.25
122 0.22
123 0.17
124 0.15
125 0.14
126 0.1
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.17
133 0.21
134 0.24
135 0.29
136 0.35
137 0.4
138 0.43
139 0.45
140 0.43
141 0.48
142 0.52
143 0.53
144 0.52
145 0.48
146 0.46
147 0.44
148 0.41
149 0.4
150 0.37
151 0.4
152 0.4
153 0.46
154 0.48
155 0.51
156 0.51
157 0.51
158 0.51
159 0.51
160 0.53
161 0.51
162 0.54
163 0.53
164 0.51
165 0.46
166 0.41
167 0.35
168 0.32
169 0.32
170 0.3
171 0.3
172 0.3
173 0.28
174 0.31
175 0.34
176 0.34
177 0.33
178 0.31
179 0.27
180 0.28
181 0.27
182 0.26
183 0.23
184 0.2
185 0.15
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.15
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.11
224 0.13
225 0.12
226 0.15
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.17
231 0.15
232 0.12
233 0.15
234 0.12
235 0.1
236 0.11
237 0.14
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.12
245 0.1
246 0.1
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.13
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.17
282 0.13
283 0.12
284 0.18
285 0.2
286 0.2
287 0.23
288 0.25
289 0.27
290 0.3
291 0.3
292 0.26
293 0.3
294 0.32
295 0.32
296 0.36
297 0.31
298 0.29
299 0.28
300 0.27
301 0.25
302 0.21
303 0.17
304 0.12
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.05
310 0.06
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.11
327 0.12
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.12
334 0.14
335 0.16
336 0.17
337 0.19
338 0.2
339 0.21
340 0.22
341 0.2
342 0.21
343 0.19
344 0.17
345 0.15
346 0.18
347 0.16
348 0.14
349 0.15
350 0.14
351 0.14
352 0.17
353 0.19
354 0.16
355 0.17
356 0.19
357 0.19
358 0.18
359 0.23
360 0.23
361 0.21
362 0.22
363 0.22
364 0.22
365 0.25
366 0.25
367 0.28
368 0.29
369 0.38
370 0.46
371 0.54
372 0.57
373 0.65
374 0.74
375 0.76
376 0.8
377 0.77
378 0.75
379 0.72
380 0.71
381 0.64
382 0.55
383 0.49
384 0.43
385 0.36
386 0.28
387 0.22
388 0.17
389 0.13
390 0.16
391 0.13
392 0.13
393 0.19
394 0.22
395 0.23
396 0.24
397 0.24
398 0.21
399 0.23
400 0.22
401 0.15
402 0.16
403 0.2
404 0.23
405 0.24
406 0.27
407 0.24
408 0.26
409 0.26
410 0.23
411 0.18
412 0.16
413 0.15
414 0.13
415 0.17
416 0.18
417 0.21
418 0.22
419 0.29
420 0.34
421 0.41
422 0.45
423 0.49
424 0.53
425 0.57
426 0.55
427 0.5
428 0.45
429 0.4
430 0.38
431 0.31
432 0.24
433 0.19
434 0.18
435 0.18
436 0.18
437 0.2
438 0.23
439 0.29
440 0.31
441 0.32
442 0.32
443 0.32
444 0.38
445 0.42
446 0.36
447 0.31
448 0.29
449 0.28
450 0.28
451 0.27
452 0.25
453 0.24
454 0.25
455 0.22
456 0.23
457 0.24
458 0.24
459 0.25
460 0.24
461 0.18
462 0.19
463 0.2
464 0.21
465 0.2
466 0.23
467 0.26
468 0.23
469 0.22
470 0.24
471 0.23
472 0.24
473 0.25
474 0.21
475 0.16
476 0.17
477 0.17
478 0.14
479 0.2
480 0.23
481 0.22
482 0.26
483 0.28
484 0.27
485 0.28
486 0.31
487 0.28
488 0.29
489 0.34
490 0.37
491 0.43
492 0.44
493 0.45
494 0.44
495 0.48
496 0.41
497 0.39
498 0.37
499 0.35
500 0.36
501 0.37
502 0.35
503 0.28
504 0.29
505 0.26
506 0.22
507 0.17
508 0.17
509 0.16
510 0.16
511 0.15
512 0.16
513 0.19
514 0.2
515 0.22
516 0.23
517 0.26
518 0.27
519 0.31
520 0.37
521 0.4
522 0.48
523 0.48
524 0.55
525 0.6
526 0.64
527 0.68
528 0.67
529 0.7
530 0.65
531 0.64
532 0.63
533 0.59
534 0.6
535 0.55
536 0.48
537 0.43
538 0.39
539 0.39
540 0.32
541 0.33
542 0.31
543 0.36
544 0.4
545 0.43
546 0.42
547 0.39
548 0.38
549 0.39
550 0.41
551 0.41
552 0.4
553 0.36
554 0.37
555 0.38
556 0.39
557 0.36
558 0.3
559 0.28
560 0.26
561 0.3
562 0.34
563 0.41
564 0.45
565 0.5
566 0.58
567 0.59
568 0.63
569 0.64
570 0.61
571 0.61
572 0.61
573 0.55
574 0.55
575 0.56
576 0.55
577 0.49
578 0.5
579 0.52
580 0.56
581 0.63
582 0.62
583 0.65
584 0.63
585 0.69
586 0.72
587 0.69
588 0.68
589 0.69
590 0.67
591 0.66
592 0.68
593 0.71
594 0.73
595 0.78
596 0.76
597 0.75
598 0.78
599 0.77
600 0.8
601 0.78
602 0.75
603 0.71
604 0.7
605 0.71
606 0.71
607 0.7
608 0.7
609 0.72
610 0.74
611 0.75
612 0.76
613 0.77
614 0.79
615 0.8
616 0.81
617 0.82
618 0.83
619 0.84
620 0.84
621 0.78
622 0.75
623 0.76
624 0.73
625 0.71
626 0.62
627 0.56
628 0.53
629 0.5
630 0.49
631 0.47
632 0.49
633 0.48
634 0.56
635 0.58
636 0.58
637 0.61
638 0.58
639 0.56
640 0.54
641 0.5
642 0.51
643 0.56
644 0.59
645 0.59
646 0.63
647 0.6
648 0.55
649 0.58
650 0.53
651 0.53
652 0.48
653 0.46
654 0.47
655 0.52
656 0.58
657 0.59
658 0.6
659 0.57
660 0.61