Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X4I0

Protein Details
Accession W3X4I0    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MSSDKKEKRSKRDKSDHKSKKRNRDLEAQPEEEBasic
65-92APVQSGKARRSEKRKKKRQSQGAEDGETHydrophilic
111-137ADAVQDEKKHKKEKRRKNKEAEATEETBasic
372-394LEKLRRWKLKNGASRKEHKKLPDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-26KKEKRSKRDKSDHKSKKRNRDL
35-37RHK
71-82KARRSEKRKKKR
118-129KKHKKEKRRKNK
376-391RRWKLKNGASRKEHKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 3, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG pfy:PFICI_05972  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSSDKKEKRSKRDKSDHKSKKRNRDLEAQPEEEHRHKRSKSEAPGADDQETPAKANVEQTATEDAPVQSGKARRSEKRKKKRQSQGAEDGETAAGDVSMTDAMDQDNVPAADAVQDEKKHKKEKRRKNKEAEATEETQDATNSTSHQPFGKLPEQPYPFFTQKVSQYLPLYPLGMIEPVEGYAEQHLKPLMNHYVPTFQGVLLGYHDVQVGEAPGKGSLTEDSDDTQEALLESIDEYAVSFGWLTAKLDLFKPTRGAWMEGTVNMQTEGHLGVVCWNMFNASIEAGRLPKGWRWVSLLDGKQGSEEFTPEDEDGQLHTTGYWVDKEGQRVRDKIRFQIKNFEVGVSGDYGYLSIEGTMLDPEAEQQKVADELEKLRRWKLKNGASRKEHKKLPDFSMTKFGMDEEQEDETQRAEVWKGSRPASETAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.95
3 0.95
4 0.95
5 0.95
6 0.94
7 0.94
8 0.94
9 0.93
10 0.87
11 0.87
12 0.85
13 0.84
14 0.82
15 0.74
16 0.65
17 0.62
18 0.62
19 0.59
20 0.57
21 0.51
22 0.53
23 0.52
24 0.56
25 0.6
26 0.64
27 0.66
28 0.69
29 0.68
30 0.66
31 0.71
32 0.68
33 0.61
34 0.52
35 0.44
36 0.38
37 0.34
38 0.28
39 0.22
40 0.2
41 0.18
42 0.21
43 0.23
44 0.2
45 0.2
46 0.21
47 0.25
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.19
52 0.18
53 0.18
54 0.16
55 0.15
56 0.2
57 0.23
58 0.29
59 0.37
60 0.43
61 0.54
62 0.65
63 0.72
64 0.78
65 0.86
66 0.88
67 0.92
68 0.94
69 0.94
70 0.93
71 0.92
72 0.91
73 0.87
74 0.78
75 0.67
76 0.57
77 0.46
78 0.35
79 0.25
80 0.14
81 0.07
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.11
101 0.12
102 0.15
103 0.19
104 0.27
105 0.34
106 0.43
107 0.49
108 0.59
109 0.66
110 0.74
111 0.81
112 0.85
113 0.89
114 0.9
115 0.93
116 0.92
117 0.87
118 0.83
119 0.78
120 0.69
121 0.6
122 0.49
123 0.4
124 0.3
125 0.23
126 0.16
127 0.11
128 0.09
129 0.1
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.17
135 0.17
136 0.23
137 0.26
138 0.26
139 0.28
140 0.35
141 0.37
142 0.36
143 0.38
144 0.38
145 0.34
146 0.31
147 0.3
148 0.26
149 0.26
150 0.31
151 0.29
152 0.26
153 0.26
154 0.26
155 0.27
156 0.23
157 0.2
158 0.15
159 0.14
160 0.11
161 0.09
162 0.08
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.07
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.14
177 0.17
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.18
182 0.18
183 0.2
184 0.16
185 0.11
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.08
190 0.09
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.1
236 0.15
237 0.15
238 0.16
239 0.18
240 0.17
241 0.21
242 0.22
243 0.22
244 0.18
245 0.2
246 0.2
247 0.18
248 0.19
249 0.14
250 0.13
251 0.12
252 0.11
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.07
268 0.06
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.2
278 0.21
279 0.22
280 0.25
281 0.25
282 0.28
283 0.34
284 0.33
285 0.3
286 0.3
287 0.28
288 0.25
289 0.24
290 0.22
291 0.14
292 0.13
293 0.1
294 0.1
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.12
302 0.11
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.14
311 0.16
312 0.24
313 0.3
314 0.37
315 0.41
316 0.45
317 0.49
318 0.53
319 0.53
320 0.55
321 0.59
322 0.59
323 0.57
324 0.63
325 0.58
326 0.57
327 0.55
328 0.46
329 0.37
330 0.3
331 0.28
332 0.18
333 0.17
334 0.1
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.08
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.19
359 0.29
360 0.34
361 0.36
362 0.41
363 0.49
364 0.5
365 0.57
366 0.61
367 0.62
368 0.66
369 0.74
370 0.77
371 0.79
372 0.85
373 0.86
374 0.84
375 0.8
376 0.79
377 0.78
378 0.75
379 0.73
380 0.74
381 0.67
382 0.61
383 0.64
384 0.56
385 0.47
386 0.4
387 0.34
388 0.27
389 0.26
390 0.24
391 0.18
392 0.21
393 0.21
394 0.22
395 0.22
396 0.18
397 0.17
398 0.16
399 0.15
400 0.13
401 0.17
402 0.19
403 0.27
404 0.31
405 0.34
406 0.36
407 0.38