Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H0S5

Protein Details
Accession C1H0S5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-43AISRAPSTQQRSGRKRRHEETQDDEHydrophilic
75-101GTTPQAQPPNPNKRKKVEKSPVVEKEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-91KRKKV
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 9, nucl 6, cyto 5.5, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG pbl:PAAG_04369  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MTTPNNMASNPGCQPLYAAISRAPSTQQRSGRKRRHEETQDDEYASPTPRSVRRKQVQNAIASGNRPVIDLTCRGTTPQAQPPNPNKRKKVEKSPVVEKEERRLRMFRNHAPQSYLQKLERARTQRMFVVSRTREATEDVPTERVHIVGTTGNIYQVEIALEPSCTCPDAEKGNQCKHIIYVLCNVLKMTGYLAYQRAFLSSELRVIFANAPLNPQDNSSGENKPGKRKPVDGDCPICFMEFEHSTEEVVWCKAACGNNIHKSCFEKWAATQQGNGVRCVYCRSAWAADTSLEQLLSQGTVNDEGYVNVARQVGLSGVRGMNTLLIIIRHITGLADGAIHPTTTKTTITTMTTTTKTIHAKICHAIIWQDPHHDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.27
4 0.23
5 0.22
6 0.2
7 0.24
8 0.26
9 0.25
10 0.26
11 0.28
12 0.35
13 0.41
14 0.48
15 0.55
16 0.64
17 0.74
18 0.79
19 0.83
20 0.86
21 0.83
22 0.86
23 0.85
24 0.82
25 0.79
26 0.78
27 0.71
28 0.63
29 0.57
30 0.47
31 0.4
32 0.35
33 0.27
34 0.2
35 0.23
36 0.28
37 0.36
38 0.43
39 0.51
40 0.58
41 0.68
42 0.74
43 0.78
44 0.76
45 0.72
46 0.68
47 0.62
48 0.55
49 0.45
50 0.4
51 0.32
52 0.26
53 0.22
54 0.19
55 0.16
56 0.16
57 0.17
58 0.19
59 0.18
60 0.18
61 0.19
62 0.21
63 0.25
64 0.28
65 0.35
66 0.41
67 0.41
68 0.51
69 0.6
70 0.69
71 0.72
72 0.75
73 0.73
74 0.73
75 0.81
76 0.81
77 0.82
78 0.81
79 0.81
80 0.79
81 0.83
82 0.82
83 0.79
84 0.77
85 0.67
86 0.66
87 0.66
88 0.62
89 0.55
90 0.51
91 0.48
92 0.52
93 0.58
94 0.56
95 0.58
96 0.6
97 0.58
98 0.57
99 0.58
100 0.56
101 0.53
102 0.49
103 0.39
104 0.39
105 0.4
106 0.4
107 0.42
108 0.4
109 0.42
110 0.41
111 0.43
112 0.41
113 0.43
114 0.41
115 0.36
116 0.41
117 0.35
118 0.35
119 0.35
120 0.32
121 0.28
122 0.28
123 0.27
124 0.21
125 0.22
126 0.2
127 0.19
128 0.18
129 0.2
130 0.17
131 0.15
132 0.12
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.14
157 0.17
158 0.24
159 0.31
160 0.35
161 0.39
162 0.39
163 0.37
164 0.32
165 0.33
166 0.26
167 0.21
168 0.21
169 0.21
170 0.2
171 0.2
172 0.19
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.09
177 0.06
178 0.06
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.13
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.11
205 0.13
206 0.16
207 0.16
208 0.18
209 0.25
210 0.27
211 0.34
212 0.38
213 0.43
214 0.43
215 0.46
216 0.49
217 0.52
218 0.57
219 0.55
220 0.56
221 0.49
222 0.49
223 0.45
224 0.38
225 0.28
226 0.21
227 0.19
228 0.15
229 0.16
230 0.15
231 0.15
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.07
239 0.08
240 0.11
241 0.12
242 0.14
243 0.18
244 0.26
245 0.34
246 0.37
247 0.38
248 0.37
249 0.4
250 0.39
251 0.4
252 0.34
253 0.27
254 0.27
255 0.35
256 0.38
257 0.34
258 0.33
259 0.32
260 0.37
261 0.35
262 0.34
263 0.27
264 0.22
265 0.22
266 0.25
267 0.23
268 0.16
269 0.17
270 0.2
271 0.21
272 0.21
273 0.22
274 0.2
275 0.18
276 0.19
277 0.19
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.06
286 0.07
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.1
310 0.1
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.12
330 0.14
331 0.15
332 0.14
333 0.16
334 0.2
335 0.23
336 0.24
337 0.24
338 0.28
339 0.29
340 0.29
341 0.28
342 0.31
343 0.32
344 0.35
345 0.4
346 0.38
347 0.41
348 0.44
349 0.45
350 0.4
351 0.38
352 0.35
353 0.33
354 0.36
355 0.34