Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GTH9

Protein Details
Accession C1GTH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-298EREFRERKEKREKERLAKEABasic
564-583AGLHRCCKNKCRFRASSSGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-337KAREETRRKEDIRRKMEEFRKKREEEEKEKQRQREKETREREFRERKEKREKERLAKEAAEKEAAEKAVKEQVRAEAAARFAAAREAAAAKRAAEKAA
Subcellular Location(s) plas 16, nucl 7, mito 1, cyto 1, pero 1, E.R. 1, cyto_mito 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037651  Swc3  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0000812  C:Swr1 complex  
GO:0140849  F:ATP-dependent H2AZ histone chaperone activity  
KEGG pbl:PAAG_01824  -  
Amino Acid Sequences MDRPPPPPPPPHGSPPGGGPPPNANGGYRKSTDLPEGPYDIFIVPPHSSGSGFIYLPSLQCHTNSFLAGVTATLFGVALYIYVLPMLKAWVSTVAQSGGAGVLMLVVVVGVGSWAWGRSQTDLPQPPPRGTPRTPPAGGTAPRGPHHETPPSSGPNHTSGGGSHYQSFNGQYTDGYANGPHPSGQYSGGPYPGGNHYAHETGTPPGPRGDGPSRPPNSPDTPPKPSGGATPEMKNQNWEKAREETRRKEDIRRKMEEFRKKREEEEKEKQRQREKETREREFRERKEKREKERLAKEAAEKEAAEKAVKEQVRAEAAARFAAAREAAAAKRAAEKAAVDKLAAEKLAEKLAAEKLAAEKRAESVKQAAESRKQEESVKSPPKTPSPQKKSPPFPSAKTECEDDAYSFRPYDRPRNQPSASSVFSESSYAPSQSTARTTPPPSRRGPYSTKDPDKVIIAGVYLFNNAFMRTPVGQLVSGKGNVTDGLILRITTEGMFVDDDIRGVAQREWDVKAWTMKLVEVWCPQLGANNPPTRQSPMKINPFRFSSSYAHKVPSSEESDAHLAGLHRCCKNKCRFRASSSGMRSRNGSMIDGDILQNAELRGFHVVRASIRDQEGKKYVFILSETEAWKVALGLQRLRKGSQVRALGVCGLPANETNAILESLGYIAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.55
3 0.56
4 0.52
5 0.47
6 0.42
7 0.39
8 0.38
9 0.41
10 0.36
11 0.3
12 0.31
13 0.36
14 0.39
15 0.36
16 0.37
17 0.36
18 0.37
19 0.42
20 0.4
21 0.4
22 0.38
23 0.39
24 0.36
25 0.33
26 0.32
27 0.25
28 0.22
29 0.17
30 0.18
31 0.15
32 0.15
33 0.16
34 0.15
35 0.15
36 0.16
37 0.19
38 0.18
39 0.17
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.17
46 0.15
47 0.16
48 0.19
49 0.21
50 0.22
51 0.21
52 0.19
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.13
57 0.09
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.04
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.02
93 0.02
94 0.02
95 0.02
96 0.02
97 0.02
98 0.02
99 0.02
100 0.03
101 0.03
102 0.04
103 0.07
104 0.08
105 0.12
106 0.16
107 0.2
108 0.29
109 0.35
110 0.4
111 0.46
112 0.49
113 0.47
114 0.5
115 0.53
116 0.51
117 0.49
118 0.53
119 0.51
120 0.56
121 0.55
122 0.49
123 0.47
124 0.47
125 0.46
126 0.41
127 0.4
128 0.36
129 0.37
130 0.4
131 0.4
132 0.38
133 0.41
134 0.44
135 0.41
136 0.43
137 0.47
138 0.47
139 0.43
140 0.4
141 0.37
142 0.32
143 0.32
144 0.27
145 0.21
146 0.18
147 0.21
148 0.23
149 0.21
150 0.2
151 0.19
152 0.19
153 0.2
154 0.21
155 0.18
156 0.16
157 0.14
158 0.12
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.13
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.11
168 0.1
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.16
174 0.17
175 0.17
176 0.17
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.14
182 0.14
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.17
190 0.17
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.15
195 0.21
196 0.25
197 0.26
198 0.31
199 0.4
200 0.42
201 0.42
202 0.44
203 0.43
204 0.42
205 0.43
206 0.48
207 0.45
208 0.49
209 0.5
210 0.49
211 0.45
212 0.4
213 0.37
214 0.31
215 0.29
216 0.25
217 0.26
218 0.31
219 0.33
220 0.33
221 0.34
222 0.33
223 0.36
224 0.37
225 0.37
226 0.35
227 0.38
228 0.46
229 0.51
230 0.58
231 0.58
232 0.61
233 0.67
234 0.66
235 0.69
236 0.7
237 0.71
238 0.7
239 0.68
240 0.65
241 0.66
242 0.72
243 0.73
244 0.71
245 0.7
246 0.71
247 0.67
248 0.68
249 0.68
250 0.68
251 0.67
252 0.71
253 0.72
254 0.73
255 0.77
256 0.78
257 0.76
258 0.75
259 0.74
260 0.72
261 0.7
262 0.71
263 0.73
264 0.75
265 0.75
266 0.74
267 0.75
268 0.75
269 0.73
270 0.74
271 0.71
272 0.72
273 0.75
274 0.78
275 0.77
276 0.78
277 0.79
278 0.78
279 0.8
280 0.75
281 0.68
282 0.63
283 0.58
284 0.51
285 0.44
286 0.35
287 0.27
288 0.23
289 0.21
290 0.19
291 0.15
292 0.11
293 0.11
294 0.16
295 0.17
296 0.16
297 0.15
298 0.16
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.04
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.11
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.11
342 0.14
343 0.15
344 0.13
345 0.13
346 0.14
347 0.18
348 0.18
349 0.15
350 0.16
351 0.16
352 0.19
353 0.23
354 0.24
355 0.27
356 0.3
357 0.32
358 0.3
359 0.3
360 0.3
361 0.29
362 0.31
363 0.34
364 0.4
365 0.37
366 0.4
367 0.42
368 0.45
369 0.51
370 0.56
371 0.57
372 0.58
373 0.66
374 0.71
375 0.77
376 0.79
377 0.78
378 0.77
379 0.71
380 0.66
381 0.65
382 0.61
383 0.55
384 0.48
385 0.42
386 0.33
387 0.31
388 0.28
389 0.21
390 0.18
391 0.18
392 0.17
393 0.15
394 0.15
395 0.18
396 0.21
397 0.3
398 0.36
399 0.43
400 0.48
401 0.56
402 0.57
403 0.54
404 0.56
405 0.51
406 0.45
407 0.38
408 0.33
409 0.25
410 0.24
411 0.23
412 0.18
413 0.15
414 0.15
415 0.14
416 0.12
417 0.13
418 0.14
419 0.13
420 0.16
421 0.14
422 0.17
423 0.21
424 0.25
425 0.33
426 0.39
427 0.44
428 0.45
429 0.48
430 0.49
431 0.5
432 0.53
433 0.49
434 0.53
435 0.56
436 0.59
437 0.57
438 0.54
439 0.49
440 0.44
441 0.39
442 0.3
443 0.2
444 0.13
445 0.11
446 0.11
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.1
456 0.1
457 0.12
458 0.12
459 0.13
460 0.13
461 0.14
462 0.15
463 0.15
464 0.15
465 0.14
466 0.12
467 0.12
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.07
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.07
479 0.07
480 0.05
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.06
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.12
494 0.15
495 0.17
496 0.19
497 0.21
498 0.22
499 0.25
500 0.23
501 0.23
502 0.21
503 0.19
504 0.2
505 0.2
506 0.21
507 0.2
508 0.22
509 0.2
510 0.2
511 0.19
512 0.21
513 0.22
514 0.23
515 0.29
516 0.32
517 0.33
518 0.35
519 0.37
520 0.39
521 0.4
522 0.38
523 0.4
524 0.43
525 0.54
526 0.59
527 0.61
528 0.6
529 0.6
530 0.61
531 0.53
532 0.48
533 0.43
534 0.42
535 0.45
536 0.42
537 0.42
538 0.39
539 0.37
540 0.36
541 0.37
542 0.34
543 0.29
544 0.27
545 0.28
546 0.29
547 0.28
548 0.25
549 0.21
550 0.16
551 0.2
552 0.25
553 0.27
554 0.3
555 0.36
556 0.4
557 0.48
558 0.58
559 0.63
560 0.68
561 0.71
562 0.74
563 0.75
564 0.81
565 0.78
566 0.77
567 0.75
568 0.75
569 0.68
570 0.62
571 0.59
572 0.51
573 0.48
574 0.39
575 0.32
576 0.24
577 0.22
578 0.22
579 0.2
580 0.18
581 0.14
582 0.13
583 0.12
584 0.12
585 0.1
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.14
590 0.14
591 0.15
592 0.16
593 0.19
594 0.2
595 0.26
596 0.28
597 0.27
598 0.3
599 0.38
600 0.36
601 0.42
602 0.47
603 0.43
604 0.41
605 0.38
606 0.36
607 0.3
608 0.29
609 0.25
610 0.2
611 0.24
612 0.25
613 0.24
614 0.23
615 0.21
616 0.2
617 0.17
618 0.18
619 0.18
620 0.21
621 0.27
622 0.33
623 0.4
624 0.43
625 0.44
626 0.46
627 0.46
628 0.5
629 0.51
630 0.5
631 0.48
632 0.47
633 0.48
634 0.44
635 0.38
636 0.32
637 0.25
638 0.19
639 0.16
640 0.15
641 0.17
642 0.15
643 0.15
644 0.15
645 0.15
646 0.15
647 0.13
648 0.12
649 0.09