FuNGI

W3XAT1

Protein Details

Accession

W3XAT1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-41	QGKAPVPRRRPAKANPFRPVQKPH	Hydrophilic
198-223	APSGGPAKKQPKQKDKPQGTKVNHGP	Hydrophilic
419-443	LERKLFGKKMKKALKKRDKQFQYDS	Hydrophilic
526-550	DSSGNESSRKNKKKKTGPANASLMG	Hydrophilic
672-691	HGNYKKDTKTLSRKQKQKAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-46	GKAPVPRRRPAKANPFRPVQKPHARPAA
202-216	GPAKKQPKQKDKPQG
415-436	RREELERKLFGKKMKKALKKRD
477-521	SKDKDKDKDGKDKNASASKGNGTPQGKKNLADASKKGKSLKRPGS
532-543	SSRKNKKKKTGP
586-588	KKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	pfy:PFICI_05036 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPANGPNGQGPTPPQGKAPVPRRRPAKANPFRPVQKPHARPAAVHAPGTPLPASSKGVPPKPPVPKPLGNSQSQQNFEEDRQKYGGWSFPMREGMGEFDLVLTKKNTKDGLRSHVMRLIPPRKSENGIDPSDQNEFTRPVLLHRRDPRQPPPGRVLKEPTPIEEETPEQIAERERLAQIKADRDAQRALDDAQKAPSGGPAKKQPKQKDKPQGTKVNHGPRTEAAKKEFDIRYEEALPWHLEDADGRNVWVGQYERPLSETKAAIVYKDNKFMITPLGKWYKFTSKRSSVNAMTIEEVEAIMKKKAPVGRWAVRDQQREAAEKAINESRGAGMVKQESHTYKQSSRKEKEDHDDIDMSGDEFQDDDETAGFEPEKDEDSKDSKDKVRRDQLGANLFGAADEKAVESEEAVRRREELERKLFGKKMKKALKKRDKQFQYDSDDSERERDPFASSSDESESDSDEEKVKKEEDKDSKDKDKDKDGKDKNASASKGNGTPQGKKNLADASKKGKSLKRPGSPMVSDSSGNESSRKNKKKKTGPANASLMGSRSSTPIPRRPGPPGSASDAEATGGEMSDGVGGKIKKKKIGSNLATGTGARGTPVGSRAGSPAPSNSQPTAPLTAQEIIDALPENPEDGVTISELLRSFNSRIGEGPNKSTKADFIQLVKIHGNYKKDTKTLSRKQKQKAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.35
3	0.35
4	0.32
5	0.34
6	0.39
7	0.47
8	0.54
9	0.56
10	0.6
11	0.67
12	0.73
13	0.74
14	0.77
15	0.77
16	0.78
17	0.78
18	0.81
19	0.8
20	0.82
21	0.81
22	0.8
23	0.78
24	0.77
25	0.77
26	0.73
27	0.75
28	0.75
29	0.69
30	0.62
31	0.62
32	0.62
33	0.54
34	0.48
35	0.4
36	0.35
37	0.35
38	0.37
39	0.29
40	0.2
41	0.2
42	0.22
43	0.25
44	0.22
45	0.29
46	0.35
47	0.41
48	0.45
49	0.49
50	0.56
51	0.62
52	0.66
53	0.65
54	0.65
55	0.66
56	0.65
57	0.69
58	0.66
59	0.6
60	0.57
61	0.58
62	0.58
63	0.54
64	0.51
65	0.44
66	0.41
67	0.41
68	0.47
69	0.4
70	0.36
71	0.35
72	0.34
73	0.32
74	0.31
75	0.33
76	0.28
77	0.31
78	0.29
79	0.31
80	0.34
81	0.32
82	0.3
83	0.26
84	0.24
85	0.21
86	0.19
87	0.14
88	0.11
89	0.14
90	0.14
91	0.15
92	0.14
93	0.17
94	0.19
95	0.24
96	0.29
97	0.29
98	0.37
99	0.42
100	0.47
101	0.52
102	0.53
103	0.51
104	0.5
105	0.48
106	0.44
107	0.48
108	0.48
109	0.44
110	0.46
111	0.48
112	0.47
113	0.5
114	0.49
115	0.48
116	0.47
117	0.45
118	0.43
119	0.39
120	0.38
121	0.37
122	0.34
123	0.26
124	0.22
125	0.2
126	0.19
127	0.22
128	0.19
129	0.23
130	0.32
131	0.36
132	0.42
133	0.49
134	0.56
135	0.6
136	0.67
137	0.69
138	0.7
139	0.72
140	0.68
141	0.69
142	0.7
143	0.66
144	0.63
145	0.61
146	0.57
147	0.59
148	0.55
149	0.48
150	0.45
151	0.42
152	0.38
153	0.33
154	0.29
155	0.22
156	0.22
157	0.19
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.15
162	0.14
163	0.15
164	0.15
165	0.17
166	0.17
167	0.21
168	0.22
169	0.26
170	0.27
171	0.32
172	0.34
173	0.34
174	0.35
175	0.31
176	0.29
177	0.25
178	0.25
179	0.22
180	0.22
181	0.2
182	0.2
183	0.19
184	0.18
185	0.17
186	0.2
187	0.21
188	0.2
189	0.24
190	0.32
191	0.41
192	0.46
193	0.55
194	0.61
195	0.66
196	0.74
197	0.79
198	0.8
199	0.82
200	0.87
201	0.87
202	0.87
203	0.8
204	0.8
205	0.79
206	0.78
207	0.73
208	0.63
209	0.56
210	0.49
211	0.54
212	0.5
213	0.45
214	0.39
215	0.36
216	0.36
217	0.42
218	0.4
219	0.33
220	0.33
221	0.31
222	0.31
223	0.29
224	0.29
225	0.22
226	0.22
227	0.21
228	0.16
229	0.14
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.12
234	0.13
235	0.13
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.14
241	0.11
242	0.09
243	0.13
244	0.15
245	0.15
246	0.17
247	0.18
248	0.17
249	0.19
250	0.18
251	0.14
252	0.18
253	0.18
254	0.17
255	0.2
256	0.26
257	0.25
258	0.29
259	0.28
260	0.24
261	0.24
262	0.24
263	0.25
264	0.2
265	0.19
266	0.21
267	0.28
268	0.28
269	0.29
270	0.32
271	0.36
272	0.41
273	0.46
274	0.48
275	0.48
276	0.53
277	0.56
278	0.59
279	0.5
280	0.47
281	0.43
282	0.35
283	0.28
284	0.23
285	0.19
286	0.13
287	0.11
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.12
295	0.15
296	0.16
297	0.21
298	0.29
299	0.34
300	0.38
301	0.41
302	0.46
303	0.5
304	0.51
305	0.46
306	0.44
307	0.4
308	0.39
309	0.36
310	0.31
311	0.25
312	0.22
313	0.24
314	0.2
315	0.18
316	0.15
317	0.15
318	0.11
319	0.12
320	0.12
321	0.09
322	0.08
323	0.1
324	0.1
325	0.11
326	0.13
327	0.13
328	0.16
329	0.19
330	0.21
331	0.25
332	0.34
333	0.41
334	0.49
335	0.51
336	0.54
337	0.56
338	0.57
339	0.58
340	0.55
341	0.48
342	0.41
343	0.38
344	0.31
345	0.27
346	0.22
347	0.16
348	0.11
349	0.09
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.11
368	0.14
369	0.18
370	0.2
371	0.23
372	0.28
373	0.34
374	0.39
375	0.45
376	0.51
377	0.52
378	0.53
379	0.54
380	0.54
381	0.52
382	0.47
383	0.38
384	0.29
385	0.24
386	0.2
387	0.17
388	0.1
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.04
396	0.09
397	0.14
398	0.17
399	0.18
400	0.18
401	0.19
402	0.21
403	0.28
404	0.29
405	0.32
406	0.36
407	0.4
408	0.42
409	0.46
410	0.47
411	0.48
412	0.5
413	0.49
414	0.52
415	0.57
416	0.65
417	0.71
418	0.79
419	0.83
420	0.83
421	0.85
422	0.85
423	0.83
424	0.8
425	0.77
426	0.73
427	0.71
428	0.64
429	0.58
430	0.52
431	0.46
432	0.4
433	0.35
434	0.29
435	0.22
436	0.2
437	0.18
438	0.16
439	0.16
440	0.17
441	0.18
442	0.17
443	0.18
444	0.19
445	0.19
446	0.17
447	0.16
448	0.16
449	0.13
450	0.14
451	0.13
452	0.15
453	0.16
454	0.16
455	0.18
456	0.18
457	0.21
458	0.24
459	0.32
460	0.38
461	0.45
462	0.52
463	0.57
464	0.64
465	0.67
466	0.7
467	0.65
468	0.66
469	0.67
470	0.65
471	0.69
472	0.66
473	0.69
474	0.68
475	0.69
476	0.64
477	0.62
478	0.57
479	0.48
480	0.45
481	0.38
482	0.36
483	0.33
484	0.34
485	0.31
486	0.37
487	0.41
488	0.45
489	0.44
490	0.42
491	0.43
492	0.44
493	0.46
494	0.44
495	0.43
496	0.44
497	0.46
498	0.49
499	0.52
500	0.49
501	0.53
502	0.58
503	0.64
504	0.62
505	0.64
506	0.66
507	0.66
508	0.63
509	0.55
510	0.48
511	0.4
512	0.33
513	0.28
514	0.29
515	0.24
516	0.23
517	0.24
518	0.23
519	0.3
520	0.41
521	0.5
522	0.53
523	0.6
524	0.69
525	0.77
526	0.85
527	0.87
528	0.87
529	0.84
530	0.83
531	0.8
532	0.72
533	0.63
534	0.52
535	0.42
536	0.33
537	0.26
538	0.18
539	0.15
540	0.15
541	0.2
542	0.27
543	0.33
544	0.39
545	0.44
546	0.48
547	0.53
548	0.57
549	0.55
550	0.53
551	0.49
552	0.49
553	0.44
554	0.41
555	0.35
556	0.29
557	0.25
558	0.2
559	0.16
560	0.1
561	0.08
562	0.06
563	0.05
564	0.05
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.1
569	0.11
570	0.19
571	0.26
572	0.3
573	0.35
574	0.41
575	0.48
576	0.53
577	0.64
578	0.62
579	0.64
580	0.63
581	0.58
582	0.54
583	0.46
584	0.38
585	0.28
586	0.23
587	0.14
588	0.11
589	0.1
590	0.11
591	0.13
592	0.14
593	0.13
594	0.15
595	0.17
596	0.2
597	0.21
598	0.2
599	0.22
600	0.25
601	0.28
602	0.32
603	0.31
604	0.29
605	0.3
606	0.32
607	0.33
608	0.28
609	0.26
610	0.25
611	0.26
612	0.24
613	0.22
614	0.19
615	0.13
616	0.14
617	0.14
618	0.1
619	0.09
620	0.1
621	0.1
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.08
626	0.09
627	0.08
628	0.1
629	0.09
630	0.12
631	0.12
632	0.13
633	0.14
634	0.17
635	0.18
636	0.21
637	0.22
638	0.21
639	0.22
640	0.29
641	0.36
642	0.35
643	0.42
644	0.46
645	0.46
646	0.47
647	0.46
648	0.41
649	0.39
650	0.41
651	0.37
652	0.33
653	0.39
654	0.39
655	0.42
656	0.41
657	0.38
658	0.39
659	0.4
660	0.41
661	0.39
662	0.47
663	0.49
664	0.5
665	0.54
666	0.58
667	0.64
668	0.7
669	0.75
670	0.76
671	0.79

W3XAT1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer