Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HCX0

Protein Details
Accession C1HCX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-331ETDIKKFGKKIKKEMNKEVFSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
317-321GKKIK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019310  Efg1  
Gene Ontology GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbl:PAAG_08611  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10153  Efg1  
Amino Acid Sequences MDSSRDQGKRKDAGDDFIPLVPSKRHRGNDLDPQEAFPSERDERLNHQDGKDLNSEPRKRHSNPQIQSLKSHKTSQSRRDVRVSSTGRASAKQNRPRELDLPSAGELRNRIRDIKRLLKRADHLPPGVKIEKERALIGYERDLEIVESRKNRAAMIKKYHFVRFLERKTATRQLAKLIKQKKSLTKSNPNPNKQELDALEKYIYITEVDLNYAIYSPLTEKYISLYPNQHRDKQSAPEQENPKVTVNNSGEKPPLWYAVEQSMKDGTLDLLREGRLKIGISGQKKTAKNLSLPVMGRENEPSKRALSTAETDIKKFGKKIKKEMNKEVFSKHSKMDVDIARDDNDNDDDSDGGFFEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.47
3 0.4
4 0.35
5 0.35
6 0.26
7 0.26
8 0.27
9 0.3
10 0.34
11 0.41
12 0.43
13 0.47
14 0.54
15 0.59
16 0.64
17 0.65
18 0.62
19 0.54
20 0.52
21 0.48
22 0.41
23 0.34
24 0.25
25 0.25
26 0.22
27 0.25
28 0.25
29 0.27
30 0.33
31 0.4
32 0.48
33 0.45
34 0.43
35 0.45
36 0.44
37 0.46
38 0.43
39 0.37
40 0.36
41 0.42
42 0.47
43 0.45
44 0.53
45 0.56
46 0.56
47 0.65
48 0.68
49 0.68
50 0.67
51 0.73
52 0.73
53 0.66
54 0.69
55 0.65
56 0.62
57 0.55
58 0.57
59 0.53
60 0.54
61 0.62
62 0.65
63 0.7
64 0.7
65 0.71
66 0.72
67 0.68
68 0.62
69 0.63
70 0.57
71 0.49
72 0.44
73 0.44
74 0.38
75 0.37
76 0.39
77 0.4
78 0.46
79 0.51
80 0.55
81 0.57
82 0.6
83 0.62
84 0.6
85 0.54
86 0.5
87 0.43
88 0.38
89 0.33
90 0.31
91 0.26
92 0.24
93 0.23
94 0.21
95 0.25
96 0.24
97 0.29
98 0.29
99 0.37
100 0.43
101 0.5
102 0.54
103 0.56
104 0.58
105 0.57
106 0.59
107 0.59
108 0.59
109 0.53
110 0.48
111 0.43
112 0.41
113 0.41
114 0.39
115 0.33
116 0.27
117 0.27
118 0.29
119 0.27
120 0.26
121 0.21
122 0.21
123 0.21
124 0.21
125 0.19
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.16
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.24
140 0.3
141 0.34
142 0.42
143 0.44
144 0.45
145 0.48
146 0.5
147 0.46
148 0.4
149 0.41
150 0.4
151 0.4
152 0.44
153 0.42
154 0.42
155 0.44
156 0.5
157 0.44
158 0.4
159 0.37
160 0.36
161 0.41
162 0.44
163 0.46
164 0.46
165 0.48
166 0.5
167 0.54
168 0.55
169 0.55
170 0.59
171 0.6
172 0.63
173 0.66
174 0.71
175 0.76
176 0.73
177 0.71
178 0.66
179 0.6
180 0.5
181 0.45
182 0.36
183 0.34
184 0.29
185 0.26
186 0.22
187 0.19
188 0.19
189 0.15
190 0.14
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.1
209 0.14
210 0.15
211 0.17
212 0.23
213 0.27
214 0.37
215 0.41
216 0.45
217 0.44
218 0.46
219 0.46
220 0.46
221 0.5
222 0.48
223 0.48
224 0.5
225 0.52
226 0.54
227 0.53
228 0.49
229 0.42
230 0.35
231 0.32
232 0.33
233 0.31
234 0.32
235 0.31
236 0.3
237 0.3
238 0.28
239 0.31
240 0.23
241 0.24
242 0.19
243 0.18
244 0.18
245 0.25
246 0.29
247 0.26
248 0.26
249 0.24
250 0.23
251 0.22
252 0.2
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.19
266 0.25
267 0.27
268 0.3
269 0.35
270 0.42
271 0.43
272 0.46
273 0.46
274 0.44
275 0.43
276 0.45
277 0.44
278 0.42
279 0.42
280 0.41
281 0.38
282 0.35
283 0.33
284 0.33
285 0.34
286 0.31
287 0.32
288 0.3
289 0.27
290 0.27
291 0.27
292 0.24
293 0.22
294 0.23
295 0.29
296 0.35
297 0.35
298 0.35
299 0.39
300 0.39
301 0.39
302 0.38
303 0.41
304 0.42
305 0.49
306 0.59
307 0.66
308 0.73
309 0.78
310 0.86
311 0.87
312 0.83
313 0.79
314 0.74
315 0.72
316 0.68
317 0.62
318 0.54
319 0.5
320 0.45
321 0.43
322 0.46
323 0.42
324 0.41
325 0.42
326 0.42
327 0.37
328 0.37
329 0.35
330 0.3
331 0.27
332 0.23
333 0.19
334 0.18
335 0.16
336 0.15
337 0.15