FuNGI

W3X9P4

Protein Details

Accession

W3X9P4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
371-390	IEYKKEQKAKRNARSNARGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
375-399	KEQKAKRNARSNARGGGDGTHGGRG
455-474	RGGRGGRGRGRGNNARGNRG

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12.333, cyto 11, nucl 10.5, cyto_mito 6.999, extr 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	pfy:PFICI_04709 -
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MASPFQIPGLSTLNQAENSQTPKATENTEHTTSIATTSVPVATGNAPVTAPGDLNNGAEQNSVSDVNTAQNAQQDITSTVNDGAMDVDGQSNEETAAKASDATEAPASPPSLTEGLEALIGGLDPTPAQADLASAPATHETEADQNAEMRDADAADGGNEEGEGWEADSSPYESSSDSSSSDDSDDDSDDDNELLKPEEMARILMEAASDDEGDGKTKGSASGGLRTKNEMPEEVVPRPDVIIKPEMQLHVLGEVEHVVDSAIVIKAYTSGEYQVLDSGSVLCTEDRTVVAALADLIGSVREPRYMAMFKDAEELKTFNIEVGTKIFYTMELSTFVFTEPLKGMKGTDASNLNDEELNDDEMEFSDDEKEIEYKKEQKAKRNARSNARGGGDGTHGGRGGRGGRQDATPAPANLKYDDEDDGPYRPLTRPANFGQGGAPPAFTGGSTSHDGGSHRGGRGGRGRGRGNNARGNRGGQRHQGAGYSQQPQSQGYPSQQPQQQQQMPFWTPPPPHVGAAQGFVPPPPPQFFGAAGGQAPMAPFTWPQQPQNLPANFVPPPPPQFQQYGQNGQPAFPPAFFTAMQNQAQAQAQAQYQAAQNAGNQQQTGQFPPPSGSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.24
3	0.24
4	0.24
5	0.28
6	0.28
7	0.26
8	0.25
9	0.28
10	0.3
11	0.31
12	0.32
13	0.34
14	0.39
15	0.41
16	0.4
17	0.36
18	0.35
19	0.31
20	0.27
21	0.21
22	0.14
23	0.11
24	0.12
25	0.12
26	0.1
27	0.1
28	0.1
29	0.11
30	0.14
31	0.13
32	0.13
33	0.12
34	0.13
35	0.14
36	0.13
37	0.12
38	0.1
39	0.13
40	0.12
41	0.14
42	0.15
43	0.14
44	0.14
45	0.14
46	0.13
47	0.11
48	0.12
49	0.12
50	0.11
51	0.11
52	0.12
53	0.13
54	0.15
55	0.14
56	0.13
57	0.17
58	0.17
59	0.17
60	0.16
61	0.16
62	0.17
63	0.18
64	0.17
65	0.15
66	0.14
67	0.14
68	0.14
69	0.12
70	0.1
71	0.08
72	0.08
73	0.07
74	0.08
75	0.07
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.08
82	0.08
83	0.09
84	0.08
85	0.08
86	0.09
87	0.12
88	0.11
89	0.13
90	0.13
91	0.13
92	0.14
93	0.16
94	0.16
95	0.13
96	0.13
97	0.14
98	0.14
99	0.14
100	0.14
101	0.11
102	0.11
103	0.11
104	0.1
105	0.07
106	0.06
107	0.05
108	0.04
109	0.04
110	0.04
111	0.03
112	0.04
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.06
118	0.06
119	0.08
120	0.08
121	0.07
122	0.08
123	0.1
124	0.1
125	0.1
126	0.09
127	0.09
128	0.12
129	0.13
130	0.14
131	0.13
132	0.13
133	0.14
134	0.14
135	0.13
136	0.1
137	0.09
138	0.08
139	0.08
140	0.07
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.06
145	0.05
146	0.05
147	0.04
148	0.04
149	0.05
150	0.04
151	0.04
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.06
156	0.07
157	0.07
158	0.08
159	0.08
160	0.08
161	0.09
162	0.11
163	0.11
164	0.11
165	0.12
166	0.12
167	0.12
168	0.13
169	0.12
170	0.11
171	0.11
172	0.11
173	0.1
174	0.11
175	0.11
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.07
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.07
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.07
207	0.12
208	0.12
209	0.2
210	0.23
211	0.26
212	0.26
213	0.29
214	0.31
215	0.3
216	0.29
217	0.22
218	0.21
219	0.24
220	0.28
221	0.26
222	0.24
223	0.21
224	0.2
225	0.2
226	0.2
227	0.15
228	0.13
229	0.15
230	0.15
231	0.16
232	0.18
233	0.18
234	0.16
235	0.16
236	0.13
237	0.1
238	0.1
239	0.08
240	0.06
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.07
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.07
264	0.07
265	0.06
266	0.06
267	0.05
268	0.06
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.02
285	0.03
286	0.03
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.15
295	0.15
296	0.15
297	0.19
298	0.19
299	0.17
300	0.16
301	0.17
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.07
309	0.08
310	0.09
311	0.08
312	0.09
313	0.08
314	0.07
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.08
324	0.07
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.12
333	0.1
334	0.13
335	0.15
336	0.16
337	0.17
338	0.17
339	0.16
340	0.15
341	0.14
342	0.12
343	0.1
344	0.1
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.09
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.09
357	0.08
358	0.11
359	0.14
360	0.2
361	0.26
362	0.35
363	0.39
364	0.47
365	0.57
366	0.66
367	0.72
368	0.75
369	0.77
370	0.78
371	0.81
372	0.75
373	0.7
374	0.61
375	0.52
376	0.42
377	0.36
378	0.28
379	0.21
380	0.18
381	0.13
382	0.12
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.15
390	0.16
391	0.16
392	0.19
393	0.18
394	0.2
395	0.2
396	0.19
397	0.19
398	0.2
399	0.21
400	0.19
401	0.2
402	0.17
403	0.16
404	0.17
405	0.16
406	0.16
407	0.16
408	0.16
409	0.16
410	0.15
411	0.15
412	0.15
413	0.2
414	0.24
415	0.25
416	0.28
417	0.29
418	0.38
419	0.36
420	0.35
421	0.3
422	0.27
423	0.27
424	0.21
425	0.19
426	0.1
427	0.11
428	0.1
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.1
433	0.13
434	0.14
435	0.14
436	0.15
437	0.16
438	0.17
439	0.22
440	0.22
441	0.2
442	0.23
443	0.23
444	0.26
445	0.33
446	0.39
447	0.39
448	0.42
449	0.46
450	0.48
451	0.56
452	0.59
453	0.59
454	0.59
455	0.56
456	0.55
457	0.53
458	0.52
459	0.5
460	0.48
461	0.47
462	0.45
463	0.46
464	0.42
465	0.41
466	0.39
467	0.33
468	0.33
469	0.32
470	0.31
471	0.29
472	0.29
473	0.29
474	0.29
475	0.3
476	0.28
477	0.26
478	0.25
479	0.32
480	0.33
481	0.39
482	0.41
483	0.43
484	0.46
485	0.52
486	0.54
487	0.48
488	0.49
489	0.49
490	0.49
491	0.46
492	0.42
493	0.38
494	0.33
495	0.34
496	0.37
497	0.32
498	0.3
499	0.29
500	0.31
501	0.26
502	0.27
503	0.25
504	0.2
505	0.17
506	0.16
507	0.18
508	0.15
509	0.18
510	0.19
511	0.2
512	0.2
513	0.23
514	0.23
515	0.25
516	0.25
517	0.22
518	0.19
519	0.17
520	0.15
521	0.13
522	0.12
523	0.09
524	0.08
525	0.07
526	0.08
527	0.11
528	0.2
529	0.23
530	0.26
531	0.33
532	0.36
533	0.42
534	0.5
535	0.49
536	0.44
537	0.41
538	0.43
539	0.36
540	0.36
541	0.35
542	0.31
543	0.35
544	0.35
545	0.37
546	0.36
547	0.39
548	0.41
549	0.45
550	0.47
551	0.5
552	0.48
553	0.52
554	0.48
555	0.44
556	0.43
557	0.37
558	0.31
559	0.23
560	0.25
561	0.2
562	0.23
563	0.23
564	0.24
565	0.26
566	0.31
567	0.32
568	0.29
569	0.28
570	0.28
571	0.29
572	0.26
573	0.21
574	0.18
575	0.18
576	0.19
577	0.19
578	0.18
579	0.19
580	0.2
581	0.2
582	0.17
583	0.18
584	0.23
585	0.27
586	0.27
587	0.25
588	0.24
589	0.29
590	0.31
591	0.35
592	0.32
593	0.29
594	0.28

W3X9P4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer