Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X1Y1

Protein Details
Accession W3X1Y1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-54RPSINGQTRRGRPRTRALPDPNAPKRPRGRPRKGESGLPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-48RRGRPRTRALPDPNAPKRPRGRPRKG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pfy:PFICI_07614  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MPAPTSLEDGRYGTRPSINGQTRRGRPRTRALPDPNAPKRPRGRPRKGESGLPGVSGLPGTSDTSGQSKSQDVDQDSEDLSEVDDDTPDSSSKKTQANSATSAKSGKRKAEKAAGEDTQATRRKGCLAPFWLQIVKADGVEQTLKQAAQASVAGNIAIEAPDDVIESVVLAKNGIQEWHDLWVMMLNIFQSTPYDLFTWGLRESDKAQRHLIYRFLGRLLPHPMWEGDLSRLRYALQKAISLRVAGHLEPLGPLPLETAQAIVSANLDYVNRAALALSIWHSLEMDKQKVGGMFLKALRQVVESEGQDGFEHADNDKTLFQLSIEDIQAVHQALDSMRGTFSGLTVASHHELYSAYRRTARTRTLAPENKATLERWDRWSLMVRQADEASRQPDYPQRDRNTYKALPYWDSNTCDVRFWHSIHSDISSIKAIEVQDDSKHSPAPHSTKKVKIEDGVIDLTQDDDDDDVATAGIEPPQARHDGTGTSGRAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.3
4 0.38
5 0.44
6 0.48
7 0.54
8 0.61
9 0.66
10 0.75
11 0.8
12 0.78
13 0.76
14 0.8
15 0.82
16 0.8
17 0.81
18 0.79
19 0.8
20 0.8
21 0.83
22 0.81
23 0.81
24 0.76
25 0.75
26 0.75
27 0.76
28 0.79
29 0.79
30 0.81
31 0.82
32 0.87
33 0.89
34 0.84
35 0.81
36 0.75
37 0.73
38 0.62
39 0.52
40 0.44
41 0.33
42 0.29
43 0.21
44 0.16
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.14
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.22
58 0.27
59 0.26
60 0.27
61 0.27
62 0.27
63 0.25
64 0.24
65 0.2
66 0.14
67 0.12
68 0.1
69 0.09
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.15
79 0.2
80 0.25
81 0.25
82 0.31
83 0.38
84 0.41
85 0.45
86 0.47
87 0.43
88 0.4
89 0.43
90 0.41
91 0.42
92 0.43
93 0.45
94 0.49
95 0.52
96 0.57
97 0.61
98 0.61
99 0.58
100 0.59
101 0.52
102 0.45
103 0.43
104 0.38
105 0.37
106 0.39
107 0.35
108 0.29
109 0.29
110 0.33
111 0.33
112 0.35
113 0.34
114 0.34
115 0.37
116 0.38
117 0.4
118 0.36
119 0.33
120 0.3
121 0.25
122 0.2
123 0.16
124 0.14
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.14
134 0.12
135 0.12
136 0.14
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.05
145 0.05
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.14
191 0.22
192 0.26
193 0.26
194 0.28
195 0.3
196 0.33
197 0.33
198 0.33
199 0.27
200 0.25
201 0.23
202 0.21
203 0.2
204 0.18
205 0.2
206 0.21
207 0.19
208 0.18
209 0.18
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.14
214 0.12
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.19
221 0.19
222 0.2
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.2
227 0.2
228 0.17
229 0.15
230 0.14
231 0.14
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.11
271 0.14
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.16
276 0.16
277 0.17
278 0.15
279 0.12
280 0.14
281 0.15
282 0.17
283 0.16
284 0.17
285 0.16
286 0.14
287 0.13
288 0.12
289 0.15
290 0.13
291 0.14
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.09
298 0.1
299 0.08
300 0.1
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.12
316 0.11
317 0.09
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.1
338 0.11
339 0.13
340 0.2
341 0.2
342 0.21
343 0.26
344 0.28
345 0.33
346 0.39
347 0.41
348 0.39
349 0.41
350 0.46
351 0.52
352 0.57
353 0.55
354 0.56
355 0.52
356 0.5
357 0.46
358 0.4
359 0.38
360 0.37
361 0.37
362 0.36
363 0.38
364 0.36
365 0.36
366 0.43
367 0.39
368 0.4
369 0.4
370 0.36
371 0.35
372 0.36
373 0.35
374 0.31
375 0.31
376 0.26
377 0.23
378 0.22
379 0.22
380 0.27
381 0.34
382 0.39
383 0.45
384 0.47
385 0.55
386 0.59
387 0.62
388 0.65
389 0.6
390 0.56
391 0.52
392 0.51
393 0.46
394 0.45
395 0.44
396 0.41
397 0.41
398 0.4
399 0.39
400 0.36
401 0.34
402 0.32
403 0.34
404 0.32
405 0.3
406 0.34
407 0.3
408 0.32
409 0.31
410 0.32
411 0.27
412 0.24
413 0.25
414 0.2
415 0.19
416 0.16
417 0.18
418 0.15
419 0.16
420 0.18
421 0.18
422 0.18
423 0.23
424 0.26
425 0.24
426 0.28
427 0.26
428 0.28
429 0.35
430 0.41
431 0.46
432 0.53
433 0.59
434 0.64
435 0.72
436 0.74
437 0.7
438 0.64
439 0.6
440 0.54
441 0.51
442 0.45
443 0.36
444 0.3
445 0.25
446 0.22
447 0.17
448 0.13
449 0.09
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.08
460 0.1
461 0.1
462 0.12
463 0.15
464 0.18
465 0.18
466 0.19
467 0.2
468 0.19
469 0.23
470 0.29