Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3XC34

Protein Details
Accession W3XC34    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
404-432LDAKAQKKYLDKEKDKQMRKAQKKQTVRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-398REKTRKAKRD
407-428KAQKKYLDKEKDKQMRKAQKKQ
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, cyto 10.5, nucl 8.5, E.R. 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG pfy:PFICI_05524  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MADFLKNIIGGAKSEEPVPSADADFADFAEAPSPAPIPFEKPPGGATLNGNGPAVTDRPYTKWYNVHERHSLSEFKAEGVILAVIAVIFTLHFIGTKLNKAKSRAWIKAHAPTLENEFALVGFGGVPNVEQQQPEKLLKQKSLFEYATYATGRQNVAFMDVALTLKKRFNPIMTSVETVLGFFFDSFGSPVDSLEATIYPFDGKESAIVPNLPGAAELRTKDAKSGYDNFVWALVNKDNMKQLRDERYDLSITFTKDNSKLPIWVTCMSESAEITDALLTKDLAAAIEKAGDLFEALIISDQPLDKPTRVEETAPRKRLFLRYRLPSDNNYDNLLPLFNVFVRLPDHLAASGHFRPEVLRKVKNIRDETIKQIQKLSEDEKAEERAIEREKTRKAKRDAELNALDAKAQKKYLDKEKDKQMRKAQKKQTVRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.19
4 0.2
5 0.2
6 0.17
7 0.14
8 0.15
9 0.14
10 0.15
11 0.14
12 0.12
13 0.12
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.1
18 0.09
19 0.1
20 0.11
21 0.09
22 0.12
23 0.13
24 0.17
25 0.21
26 0.27
27 0.27
28 0.27
29 0.28
30 0.3
31 0.31
32 0.27
33 0.26
34 0.25
35 0.26
36 0.26
37 0.25
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.15
43 0.15
44 0.16
45 0.2
46 0.25
47 0.29
48 0.32
49 0.37
50 0.41
51 0.49
52 0.53
53 0.56
54 0.59
55 0.57
56 0.57
57 0.54
58 0.51
59 0.41
60 0.41
61 0.35
62 0.28
63 0.26
64 0.22
65 0.18
66 0.15
67 0.13
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.03
74 0.02
75 0.02
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.04
80 0.05
81 0.1
82 0.12
83 0.2
84 0.25
85 0.31
86 0.35
87 0.4
88 0.45
89 0.5
90 0.57
91 0.57
92 0.56
93 0.58
94 0.58
95 0.62
96 0.61
97 0.53
98 0.46
99 0.39
100 0.41
101 0.34
102 0.29
103 0.21
104 0.17
105 0.14
106 0.13
107 0.11
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.14
120 0.19
121 0.21
122 0.24
123 0.29
124 0.32
125 0.37
126 0.39
127 0.41
128 0.4
129 0.45
130 0.41
131 0.35
132 0.33
133 0.28
134 0.28
135 0.23
136 0.2
137 0.14
138 0.17
139 0.16
140 0.14
141 0.14
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.11
153 0.13
154 0.16
155 0.17
156 0.19
157 0.22
158 0.26
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.26
163 0.25
164 0.23
165 0.19
166 0.14
167 0.09
168 0.07
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.08
204 0.08
205 0.11
206 0.13
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.17
212 0.21
213 0.21
214 0.2
215 0.2
216 0.19
217 0.19
218 0.17
219 0.14
220 0.12
221 0.09
222 0.12
223 0.12
224 0.14
225 0.18
226 0.2
227 0.2
228 0.21
229 0.26
230 0.32
231 0.34
232 0.35
233 0.32
234 0.33
235 0.33
236 0.3
237 0.29
238 0.23
239 0.22
240 0.21
241 0.2
242 0.2
243 0.21
244 0.22
245 0.22
246 0.19
247 0.2
248 0.2
249 0.22
250 0.23
251 0.23
252 0.23
253 0.2
254 0.2
255 0.19
256 0.18
257 0.15
258 0.12
259 0.11
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.09
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.15
295 0.2
296 0.21
297 0.24
298 0.3
299 0.38
300 0.47
301 0.53
302 0.51
303 0.48
304 0.5
305 0.58
306 0.56
307 0.54
308 0.54
309 0.56
310 0.62
311 0.68
312 0.67
313 0.61
314 0.62
315 0.58
316 0.51
317 0.45
318 0.38
319 0.31
320 0.28
321 0.24
322 0.17
323 0.11
324 0.11
325 0.08
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.13
330 0.14
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.14
335 0.15
336 0.14
337 0.18
338 0.19
339 0.18
340 0.17
341 0.16
342 0.18
343 0.24
344 0.33
345 0.34
346 0.36
347 0.41
348 0.51
349 0.57
350 0.64
351 0.62
352 0.58
353 0.6
354 0.59
355 0.6
356 0.61
357 0.6
358 0.52
359 0.51
360 0.48
361 0.42
362 0.43
363 0.39
364 0.36
365 0.34
366 0.35
367 0.35
368 0.36
369 0.34
370 0.3
371 0.27
372 0.27
373 0.29
374 0.32
375 0.33
376 0.38
377 0.47
378 0.56
379 0.64
380 0.67
381 0.71
382 0.76
383 0.78
384 0.8
385 0.76
386 0.75
387 0.68
388 0.61
389 0.56
390 0.46
391 0.41
392 0.35
393 0.32
394 0.27
395 0.26
396 0.27
397 0.31
398 0.39
399 0.49
400 0.55
401 0.61
402 0.66
403 0.75
404 0.82
405 0.83
406 0.85
407 0.85
408 0.85
409 0.87
410 0.89
411 0.89
412 0.89