FuNGI

C1HC84

Protein Details

Accession

C1HC84

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
133-154	AAQPRWRPTKKDKDGKFLPPVE	Hydrophilic
306-334	RTTIYKLERGKKNDKSRRWKEVTHRRYHS	Basic
767-787	VQKGQNKRKREDDDRKIPKTN	Basic
969-992	ALTPHKRSLLQRRWWHTHKYRDIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
315-323	GKKNDKSRR

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 7, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	pbl:PAAG_08375 -
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MDIHRCRFVPYKPRAINALAFSHPPSADVSGRGVPTLRLAIGRANGDIEIWNPLRGAWLQESILRGGKDLSIEGLAWTQDPSEDGTNGSGFRIPGKLRLFSIGSSSVVTEWNLEEARPARHSSGNFGEIWCLAAQPRWRPTKKDKDGKFLPPVEGEYTGQHLAVGCADGSIVILSTQDGDLRYIRTIRPSTKKARVLSLTFQDRNTAVAGYTDSTIRIFDIRNGVILRTVSMGKGLVKGSKELLVWSVKCLPDGTIISGDSTGEIRFWDAKNYSLIQRIQGHLADVLDIAVSADGESVISGGADQRTTIYKLERGKKNDKSRRWKEVTHRRYHSHDVKAFAVYETRNISIVVSGGLDTVPVVVPLREYGSEHHRKLSNLPQVPQISSAPSPRLLMSWWDREVSLWYISRRFGNDGGLFDGMSHELLGKVLLKGKENLTSATLSPDGKFFVAATIAEVKMFNVRWRRGGSQPVLRFKKIDLPPSVARHGAKTVAISPNRQWLCLVRPNNQISLAKIVPSSDPNNNPCILPQLLDLDRIPRQIRHKEMYGTLGEYERSIRCIAFSEDSRIMASGDLAGCIDSWILEDVKASTHGTMLKVNGKPSTNSSDDKSSDDDDDSLAVLDGQRWIQTPSESPIPRLKAGILLLSFRPSNCSQPKDLTKGTTRVHVSCPSFSITERLMVLTAEHQLFEFEILKGKLSDWSRRNPKAYLPKEFSILKDRAMGAIWDIRKSRERLWLYGPTWMWMFDLSQDFPPQNDSANKDVANGAVQKGQNKRKREDDDRKIPKTNTGAGDRIPVSKSDVGLGRKMRKIVGGDESNEQWIDITRASERDDFLDEDEHKQYNQSSIANVSTLARLRREQNLAQPGAYGMDDEDVDTETNHHDQYLPNGMSTHLPSSSTNCNAKSQVAFAVVIDNKPQVNGDTALPQEKQGRQNIHSSGSDKLERKQATLSTLSAINPNSSIDLEVQVPALTPHKRSLLQRRWWHTHKYRDILGIVSLDEPDSRSDPNQSQEDGFNIEVAVVERPMWEIELPGRYVRDYDSY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.61
3	0.58
4	0.52
5	0.48
6	0.39
7	0.37
8	0.35
9	0.35
10	0.3
11	0.25
12	0.24
13	0.23
14	0.22
15	0.22
16	0.24
17	0.24
18	0.25
19	0.25
20	0.23
21	0.2
22	0.21
23	0.21
24	0.19
25	0.15
26	0.16
27	0.19
28	0.22
29	0.23
30	0.21
31	0.2
32	0.19
33	0.18
34	0.18
35	0.14
36	0.18
37	0.17
38	0.17
39	0.16
40	0.16
41	0.18
42	0.18
43	0.22
44	0.18
45	0.2
46	0.21
47	0.23
48	0.25
49	0.25
50	0.29
51	0.24
52	0.21
53	0.19
54	0.2
55	0.18
56	0.17
57	0.16
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.13
62	0.12
63	0.11
64	0.11
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.12
69	0.13
70	0.13
71	0.14
72	0.15
73	0.16
74	0.16
75	0.16
76	0.15
77	0.13
78	0.15
79	0.19
80	0.19
81	0.25
82	0.29
83	0.31
84	0.3
85	0.35
86	0.34
87	0.29
88	0.32
89	0.27
90	0.23
91	0.21
92	0.2
93	0.16
94	0.16
95	0.16
96	0.13
97	0.11
98	0.14
99	0.13
100	0.13
101	0.17
102	0.18
103	0.22
104	0.24
105	0.26
106	0.26
107	0.31
108	0.32
109	0.34
110	0.37
111	0.36
112	0.33
113	0.31
114	0.29
115	0.24
116	0.25
117	0.18
118	0.13
119	0.1
120	0.14
121	0.19
122	0.26
123	0.34
124	0.42
125	0.47
126	0.54
127	0.64
128	0.71
129	0.76
130	0.79
131	0.77
132	0.77
133	0.81
134	0.82
135	0.8
136	0.72
137	0.64
138	0.56
139	0.52
140	0.44
141	0.39
142	0.31
143	0.24
144	0.24
145	0.21
146	0.19
147	0.17
148	0.14
149	0.12
150	0.12
151	0.11
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.05
163	0.06
164	0.07
165	0.08
166	0.09
167	0.11
168	0.13
169	0.15
170	0.17
171	0.18
172	0.25
173	0.3
174	0.37
175	0.44
176	0.5
177	0.57
178	0.64
179	0.7
180	0.66
181	0.68
182	0.66
183	0.61
184	0.6
185	0.59
186	0.59
187	0.53
188	0.51
189	0.45
190	0.39
191	0.36
192	0.3
193	0.21
194	0.13
195	0.11
196	0.12
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.1
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.12
207	0.18
208	0.17
209	0.21
210	0.21
211	0.2
212	0.21
213	0.2
214	0.17
215	0.14
216	0.14
217	0.11
218	0.11
219	0.12
220	0.11
221	0.14
222	0.14
223	0.16
224	0.16
225	0.18
226	0.18
227	0.2
228	0.19
229	0.17
230	0.19
231	0.21
232	0.2
233	0.22
234	0.26
235	0.24
236	0.24
237	0.24
238	0.21
239	0.21
240	0.22
241	0.2
242	0.17
243	0.17
244	0.17
245	0.16
246	0.15
247	0.11
248	0.1
249	0.08
250	0.06
251	0.06
252	0.08
253	0.11
254	0.12
255	0.17
256	0.17
257	0.19
258	0.22
259	0.24
260	0.25
261	0.27
262	0.28
263	0.27
264	0.3
265	0.3
266	0.29
267	0.27
268	0.26
269	0.2
270	0.2
271	0.14
272	0.11
273	0.09
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.07
293	0.09
294	0.11
295	0.13
296	0.14
297	0.18
298	0.27
299	0.36
300	0.43
301	0.48
302	0.56
303	0.64
304	0.73
305	0.78
306	0.8
307	0.82
308	0.83
309	0.86
310	0.82
311	0.8
312	0.8
313	0.81
314	0.81
315	0.8
316	0.77
317	0.71
318	0.72
319	0.74
320	0.71
321	0.69
322	0.62
323	0.55
324	0.5
325	0.47
326	0.41
327	0.32
328	0.27
329	0.18
330	0.17
331	0.16
332	0.15
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.11
337	0.11
338	0.08
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.1
356	0.2
357	0.28
358	0.28
359	0.33
360	0.34
361	0.34
362	0.38
363	0.45
364	0.44
365	0.4
366	0.41
367	0.43
368	0.42
369	0.42
370	0.39
371	0.3
372	0.24
373	0.21
374	0.22
375	0.17
376	0.16
377	0.17
378	0.15
379	0.15
380	0.13
381	0.16
382	0.19
383	0.22
384	0.22
385	0.21
386	0.21
387	0.21
388	0.23
389	0.2
390	0.18
391	0.16
392	0.16
393	0.18
394	0.19
395	0.2
396	0.19
397	0.19
398	0.18
399	0.2
400	0.2
401	0.19
402	0.2
403	0.18
404	0.17
405	0.14
406	0.14
407	0.09
408	0.07
409	0.06
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.1
417	0.11
418	0.13
419	0.15
420	0.16
421	0.2
422	0.2
423	0.2
424	0.18
425	0.18
426	0.16
427	0.16
428	0.17
429	0.13
430	0.12
431	0.12
432	0.11
433	0.1
434	0.1
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.07
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.1
446	0.1
447	0.13
448	0.19
449	0.2
450	0.24
451	0.27
452	0.3
453	0.31
454	0.38
455	0.38
456	0.4
457	0.44
458	0.5
459	0.5
460	0.48
461	0.45
462	0.38
463	0.43
464	0.38
465	0.39
466	0.32
467	0.34
468	0.38
469	0.41
470	0.41
471	0.34
472	0.31
473	0.26
474	0.24
475	0.19
476	0.15
477	0.13
478	0.15
479	0.18
480	0.19
481	0.2
482	0.2
483	0.27
484	0.27
485	0.26
486	0.23
487	0.19
488	0.23
489	0.29
490	0.32
491	0.29
492	0.36
493	0.37
494	0.38
495	0.38
496	0.34
497	0.27
498	0.28
499	0.22
500	0.16
501	0.14
502	0.14
503	0.12
504	0.14
505	0.16
506	0.16
507	0.2
508	0.21
509	0.23
510	0.23
511	0.22
512	0.19
513	0.2
514	0.16
515	0.12
516	0.11
517	0.13
518	0.13
519	0.14
520	0.14
521	0.13
522	0.14
523	0.16
524	0.17
525	0.17
526	0.23
527	0.28
528	0.33
529	0.33
530	0.35
531	0.34
532	0.34
533	0.34
534	0.28
535	0.22
536	0.18
537	0.15
538	0.13
539	0.11
540	0.12
541	0.09
542	0.1
543	0.1
544	0.09
545	0.09
546	0.11
547	0.12
548	0.13
549	0.13
550	0.17
551	0.17
552	0.17
553	0.17
554	0.15
555	0.14
556	0.11
557	0.1
558	0.06
559	0.06
560	0.05
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.04
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.05
570	0.04
571	0.05
572	0.05
573	0.06
574	0.07
575	0.07
576	0.06
577	0.08
578	0.09
579	0.1
580	0.11
581	0.13
582	0.18
583	0.19
584	0.21
585	0.22
586	0.22
587	0.22
588	0.24
589	0.27
590	0.24
591	0.25
592	0.25
593	0.27
594	0.27
595	0.28
596	0.27
597	0.23
598	0.21
599	0.2
600	0.17
601	0.13
602	0.12
603	0.1
604	0.08
605	0.06
606	0.05
607	0.04
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.06
612	0.06
613	0.08
614	0.09
615	0.1
616	0.11
617	0.13
618	0.21
619	0.21
620	0.23
621	0.27
622	0.29
623	0.29
624	0.28
625	0.25
626	0.2
627	0.2
628	0.19
629	0.14
630	0.13
631	0.13
632	0.14
633	0.14
634	0.12
635	0.16
636	0.15
637	0.23
638	0.26
639	0.29
640	0.3
641	0.37
642	0.42
643	0.43
644	0.44
645	0.4
646	0.39
647	0.43
648	0.41
649	0.4
650	0.38
651	0.34
652	0.36
653	0.38
654	0.36
655	0.3
656	0.3
657	0.26
658	0.24
659	0.22
660	0.22
661	0.16
662	0.15
663	0.15
664	0.13
665	0.11
666	0.11
667	0.11
668	0.09
669	0.11
670	0.1
671	0.09
672	0.09
673	0.09
674	0.09
675	0.1
676	0.1
677	0.07
678	0.11
679	0.11
680	0.12
681	0.12
682	0.13
683	0.17
684	0.19
685	0.28
686	0.28
687	0.38
688	0.47
689	0.52
690	0.55
691	0.51
692	0.56
693	0.59
694	0.6
695	0.6
696	0.56
697	0.51
698	0.52
699	0.51
700	0.45
701	0.42
702	0.37
703	0.29
704	0.26
705	0.25
706	0.22
707	0.21
708	0.19
709	0.13
710	0.17
711	0.17
712	0.17
713	0.18
714	0.2
715	0.25
716	0.29
717	0.31
718	0.35
719	0.38
720	0.38
721	0.43
722	0.49
723	0.44
724	0.47
725	0.42
726	0.34
727	0.31
728	0.28
729	0.22
730	0.14
731	0.13
732	0.1
733	0.13
734	0.13
735	0.15
736	0.16
737	0.16
738	0.16
739	0.19
740	0.16
741	0.17
742	0.19
743	0.21
744	0.23
745	0.26
746	0.26
747	0.24
748	0.24
749	0.2
750	0.19
751	0.17
752	0.15
753	0.17
754	0.18
755	0.23
756	0.31
757	0.4
758	0.45
759	0.5
760	0.54
761	0.59
762	0.66
763	0.72
764	0.74
765	0.75
766	0.79
767	0.83
768	0.83
769	0.8
770	0.72
771	0.67
772	0.61
773	0.57
774	0.51
775	0.45
776	0.41
777	0.35
778	0.39
779	0.34
780	0.32
781	0.26
782	0.22
783	0.22
784	0.22
785	0.21
786	0.2
787	0.24
788	0.24
789	0.29
790	0.35
791	0.37
792	0.38
793	0.4
794	0.37
795	0.36
796	0.36
797	0.34
798	0.36
799	0.33
800	0.32
801	0.33
802	0.33
803	0.31
804	0.28
805	0.24
806	0.16
807	0.13
808	0.12
809	0.1
810	0.11
811	0.11
812	0.13
813	0.17
814	0.19
815	0.18
816	0.19
817	0.21
818	0.2
819	0.2
820	0.24
821	0.22
822	0.24
823	0.26
824	0.25
825	0.22
826	0.23
827	0.23
828	0.21
829	0.22
830	0.19
831	0.18
832	0.19
833	0.2
834	0.18
835	0.18
836	0.15
837	0.15
838	0.18
839	0.19
840	0.2
841	0.22
842	0.26
843	0.32
844	0.37
845	0.37
846	0.43
847	0.49
848	0.47
849	0.44
850	0.4
851	0.34
852	0.29
853	0.25
854	0.16
855	0.08
856	0.08
857	0.08
858	0.07
859	0.08
860	0.07
861	0.08
862	0.08
863	0.09
864	0.1
865	0.12
866	0.12
867	0.12
868	0.12
869	0.13
870	0.18
871	0.26
872	0.23
873	0.22
874	0.22
875	0.23
876	0.24
877	0.26
878	0.23
879	0.15
880	0.16
881	0.17
882	0.21
883	0.27
884	0.31
885	0.34
886	0.33
887	0.36
888	0.37
889	0.39
890	0.36
891	0.31
892	0.27
893	0.24
894	0.23
895	0.19
896	0.24
897	0.22
898	0.21
899	0.21
900	0.2
901	0.18
902	0.19
903	0.19
904	0.13
905	0.15
906	0.16
907	0.16
908	0.18
909	0.2
910	0.24
911	0.24
912	0.26
913	0.29
914	0.34
915	0.39
916	0.42
917	0.47
918	0.45
919	0.53
920	0.52
921	0.5
922	0.48
923	0.43
924	0.39
925	0.38
926	0.43
927	0.38
928	0.39
929	0.43
930	0.41
931	0.41
932	0.42
933	0.39
934	0.37
935	0.38
936	0.34
937	0.28
938	0.29
939	0.28
940	0.27
941	0.25
942	0.21
943	0.18
944	0.18
945	0.17
946	0.15
947	0.16
948	0.13
949	0.14
950	0.14
951	0.13
952	0.13
953	0.11
954	0.11
955	0.12
956	0.16
957	0.18
958	0.19
959	0.23
960	0.28
961	0.33
962	0.42
963	0.52
964	0.56
965	0.63
966	0.71
967	0.75
968	0.8
969	0.81
970	0.83
971	0.81
972	0.82
973	0.81
974	0.78
975	0.73
976	0.68
977	0.64
978	0.55
979	0.47
980	0.37
981	0.28
982	0.22
983	0.18
984	0.14
985	0.13
986	0.12
987	0.13
988	0.14
989	0.16
990	0.17
991	0.24
992	0.27
993	0.34
994	0.37
995	0.36
996	0.37
997	0.36
998	0.36
999	0.33
1000	0.29
1001	0.23
1002	0.18
1003	0.16
1004	0.14
1005	0.13
1006	0.12
1007	0.09
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.11
1011	0.11
1012	0.12
1013	0.11
1014	0.12
1015	0.16
1016	0.2
1017	0.22
1018	0.23
1019	0.24
1020	0.24
1021	0.25

C1HC84

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer