Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3XIF8

Protein Details
Accession W3XIF8    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-254EVEPRSRSRSRSRSRDSNRRRSYSGHydrophilic
262-290VDERTKRRSSRSQSRSYPRSRSPDSRRDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-244RSRSRSR
269-269R
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pfy:PFICI_03061  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MTHRADPSRFLDERHSAPLCPNGMNPATLLEKAMIERIIDSFYFKDACFGLNEADIVDRVVSHVTFVGGTYGSSQKPTPFLCLLFKLLQLGPGDDVLGEYLSFGGERFKYLRALAAFYIRLTRRSEDVYKTLEPFLEDRRKLRRKGAQGTTLTFVDQFVDDLLTKDRVCGTTLWQLTKRELLEDLEKLEPRVSPLGDIEDLLDELDQENGEEGQADSGENGASDEGEVEEVEPRSRSRSRSRSRDSNRRRSYSGDRDDRMDVDERTKRRSSRSQSRSYPRSRSPDSRRDGSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.35
4 0.37
5 0.41
6 0.36
7 0.32
8 0.29
9 0.28
10 0.27
11 0.27
12 0.24
13 0.21
14 0.21
15 0.2
16 0.2
17 0.14
18 0.14
19 0.14
20 0.16
21 0.14
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.13
29 0.14
30 0.16
31 0.14
32 0.16
33 0.14
34 0.15
35 0.14
36 0.15
37 0.14
38 0.12
39 0.13
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.09
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.09
58 0.11
59 0.11
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.19
64 0.2
65 0.22
66 0.21
67 0.23
68 0.24
69 0.25
70 0.28
71 0.24
72 0.24
73 0.22
74 0.2
75 0.21
76 0.18
77 0.17
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.09
82 0.09
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.04
91 0.06
92 0.06
93 0.08
94 0.1
95 0.11
96 0.13
97 0.13
98 0.17
99 0.15
100 0.16
101 0.15
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.2
106 0.17
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.19
111 0.23
112 0.27
113 0.24
114 0.27
115 0.29
116 0.28
117 0.28
118 0.26
119 0.22
120 0.19
121 0.18
122 0.22
123 0.25
124 0.25
125 0.28
126 0.38
127 0.44
128 0.45
129 0.52
130 0.52
131 0.52
132 0.6
133 0.62
134 0.6
135 0.55
136 0.55
137 0.49
138 0.42
139 0.33
140 0.24
141 0.18
142 0.11
143 0.09
144 0.07
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.13
158 0.19
159 0.21
160 0.24
161 0.26
162 0.27
163 0.27
164 0.31
165 0.27
166 0.21
167 0.2
168 0.19
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.18
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.14
180 0.12
181 0.12
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.11
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.08
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.18
222 0.22
223 0.27
224 0.35
225 0.45
226 0.54
227 0.64
228 0.72
229 0.77
230 0.84
231 0.89
232 0.89
233 0.9
234 0.89
235 0.85
236 0.79
237 0.75
238 0.75
239 0.74
240 0.74
241 0.71
242 0.64
243 0.61
244 0.61
245 0.55
246 0.48
247 0.42
248 0.33
249 0.32
250 0.38
251 0.37
252 0.42
253 0.47
254 0.47
255 0.52
256 0.6
257 0.62
258 0.66
259 0.73
260 0.76
261 0.8
262 0.87
263 0.88
264 0.87
265 0.85
266 0.83
267 0.82
268 0.81
269 0.81
270 0.81
271 0.81
272 0.8