Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X495

Protein Details
Accession W3X495    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1156-1175NNGRRGRVGQPSHRGRRSPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1159-1176RRGRVGQPSHRGRRSPRP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pfy:PFICI_07525  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSSARSEYLNLGHPIPATSQGRSASPTTTNSARSQSPIESSGASAVRSPFGMSGTLNPAGNKMAGTTRSGAGSPSHDLSASGRLFSKRAREIQAQEGVPGIPLNPWGGPPTSGNSTPLRENIPESPTDGFPDFAQLPSSENGPSGGRRARAGTVPSRFPGAAVGNGLLSIPTLNAQSSRVSPSQSPFNKSPSPGLSETSSGSLLSRLRAGSMPQRSPFNNIPGTSSPFGPTLFSGSWNPSSSGRERGNTLASIASVGSTNGPSSPAQSAFSKEGTGENDVHMRTLDYLGLAETPQPARAQLAPGYLPGLADFTKQANRFRSYSVNNKDKYADDEDDDYDDLASESQYAAALQDQLAATQAAIYSHNIAVQNFQNLAAQSIRPRARTVGGLDLTAAGSRGLRNFYHTPSRLDSSMTATEIRLPDEKDFEDLPQAVAAMNLGRSNSRNNGLLSAEEGLEGPTSALWLGSIPTSTTTSTLTEMFKQYGPISSVRVLTHKNCGFVNYERIDSAVSAKTAMNGKEIFPGAGPVRINFAKPPSASNTPGHDGVFPSPSPDPFAKGGDNAGSNPATATIDGAATASPTNAAPVIPPLHEMTPDILQIVKSLGATDEDTYNISLSLNEAVGFTNFIDEIPPVKEPTHTRVHDAPKLRDIRKRIDNQSLSQPEIENIAVDMLPEIAELASDYLGNTVVQKLFEHCSDSIRDAMLTEIAPHLAEIGVHKNGTWAAQKIIDVCKTPEQMNLIVRHIRPYTVPLFLDQYGNYVLQGCLKFGTPFNNFIFETMLSKMWDIGQGRYGARAMRACLESHHASKDQQRMLAGAIALNSVQLATNANGALLLTWFLDTCTFPQRRSVLAPQLVPYLVHLCTHKVAYLTVLKVINQKAEADARDTILKALFFTPKDHILEAILSDHACGATLIFKVLTTPFFDESIRSQVVENIKNVLVRIKAQPNQGYKRLMDEVGLSTRNGGGSRDHSISATERQRPASRQTQSHAQANAAAIQQNAQYNNQYMNPLSQTNTPGGYEMGFGVSRTEPSESAMPPFPQYGQQNTMYNNTNPAMVPGMQSMQYQQSMMQRGNPPMNNFFPTMPAAGFNGYNGPAPPMDQYRGQNMVNSSPIQPPGAPTGYGPPGFNMPMGMSSYPYNGGMQQNMPYMPDQQPINNGRRGRVGQPSHRGRRSPRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.29
4 0.25
5 0.24
6 0.28
7 0.28
8 0.29
9 0.31
10 0.31
11 0.27
12 0.28
13 0.3
14 0.31
15 0.33
16 0.36
17 0.36
18 0.39
19 0.37
20 0.37
21 0.37
22 0.35
23 0.34
24 0.32
25 0.31
26 0.27
27 0.25
28 0.27
29 0.24
30 0.22
31 0.21
32 0.2
33 0.19
34 0.18
35 0.19
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.13
40 0.16
41 0.21
42 0.23
43 0.23
44 0.22
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.18
49 0.14
50 0.17
51 0.17
52 0.2
53 0.22
54 0.22
55 0.23
56 0.23
57 0.22
58 0.19
59 0.21
60 0.23
61 0.22
62 0.21
63 0.2
64 0.2
65 0.21
66 0.27
67 0.24
68 0.21
69 0.23
70 0.24
71 0.26
72 0.3
73 0.37
74 0.36
75 0.42
76 0.47
77 0.51
78 0.55
79 0.6
80 0.64
81 0.55
82 0.48
83 0.43
84 0.36
85 0.28
86 0.23
87 0.16
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.2
98 0.24
99 0.24
100 0.27
101 0.29
102 0.3
103 0.32
104 0.33
105 0.32
106 0.28
107 0.31
108 0.33
109 0.32
110 0.3
111 0.29
112 0.29
113 0.26
114 0.28
115 0.25
116 0.21
117 0.18
118 0.22
119 0.21
120 0.18
121 0.19
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.19
126 0.14
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.16
131 0.19
132 0.23
133 0.24
134 0.25
135 0.28
136 0.29
137 0.32
138 0.36
139 0.39
140 0.4
141 0.42
142 0.41
143 0.42
144 0.38
145 0.33
146 0.32
147 0.25
148 0.21
149 0.19
150 0.18
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.09
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.1
163 0.12
164 0.14
165 0.19
166 0.2
167 0.22
168 0.25
169 0.27
170 0.36
171 0.39
172 0.44
173 0.42
174 0.47
175 0.48
176 0.47
177 0.5
178 0.43
179 0.44
180 0.39
181 0.38
182 0.34
183 0.31
184 0.3
185 0.26
186 0.22
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.13
194 0.15
195 0.16
196 0.19
197 0.24
198 0.31
199 0.36
200 0.36
201 0.42
202 0.41
203 0.47
204 0.48
205 0.46
206 0.43
207 0.38
208 0.4
209 0.38
210 0.43
211 0.38
212 0.34
213 0.29
214 0.25
215 0.25
216 0.21
217 0.18
218 0.17
219 0.16
220 0.17
221 0.18
222 0.2
223 0.24
224 0.24
225 0.25
226 0.23
227 0.27
228 0.27
229 0.33
230 0.33
231 0.31
232 0.33
233 0.34
234 0.34
235 0.3
236 0.28
237 0.2
238 0.17
239 0.15
240 0.12
241 0.1
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.14
252 0.14
253 0.16
254 0.17
255 0.21
256 0.21
257 0.22
258 0.2
259 0.17
260 0.19
261 0.19
262 0.21
263 0.18
264 0.17
265 0.2
266 0.2
267 0.19
268 0.17
269 0.15
270 0.13
271 0.13
272 0.11
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.13
285 0.14
286 0.16
287 0.15
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.16
292 0.14
293 0.13
294 0.1
295 0.1
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.11
300 0.17
301 0.2
302 0.26
303 0.3
304 0.34
305 0.34
306 0.36
307 0.42
308 0.41
309 0.49
310 0.53
311 0.55
312 0.52
313 0.53
314 0.52
315 0.45
316 0.45
317 0.41
318 0.33
319 0.26
320 0.27
321 0.26
322 0.26
323 0.25
324 0.19
325 0.13
326 0.11
327 0.09
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.05
348 0.06
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.14
356 0.15
357 0.16
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.15
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.21
367 0.23
368 0.23
369 0.24
370 0.24
371 0.25
372 0.26
373 0.26
374 0.25
375 0.23
376 0.22
377 0.21
378 0.19
379 0.17
380 0.15
381 0.12
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.1
387 0.1
388 0.16
389 0.18
390 0.22
391 0.3
392 0.32
393 0.34
394 0.35
395 0.37
396 0.32
397 0.31
398 0.28
399 0.23
400 0.23
401 0.2
402 0.17
403 0.15
404 0.18
405 0.17
406 0.18
407 0.16
408 0.16
409 0.16
410 0.18
411 0.18
412 0.17
413 0.17
414 0.16
415 0.16
416 0.15
417 0.14
418 0.11
419 0.11
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.08
429 0.11
430 0.14
431 0.15
432 0.18
433 0.17
434 0.19
435 0.18
436 0.17
437 0.16
438 0.14
439 0.11
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.06
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.1
462 0.11
463 0.13
464 0.13
465 0.13
466 0.15
467 0.15
468 0.15
469 0.15
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.14
474 0.15
475 0.15
476 0.17
477 0.16
478 0.18
479 0.19
480 0.19
481 0.27
482 0.26
483 0.26
484 0.24
485 0.25
486 0.26
487 0.25
488 0.3
489 0.22
490 0.22
491 0.2
492 0.2
493 0.19
494 0.15
495 0.16
496 0.1
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.12
501 0.14
502 0.15
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.16
507 0.16
508 0.14
509 0.11
510 0.13
511 0.11
512 0.13
513 0.13
514 0.1
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.13
519 0.15
520 0.16
521 0.16
522 0.18
523 0.2
524 0.23
525 0.26
526 0.27
527 0.28
528 0.27
529 0.28
530 0.26
531 0.21
532 0.18
533 0.16
534 0.16
535 0.12
536 0.12
537 0.12
538 0.12
539 0.14
540 0.13
541 0.15
542 0.14
543 0.16
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.13
548 0.13
549 0.1
550 0.11
551 0.09
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.06
557 0.06
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.08
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.1
580 0.1
581 0.09
582 0.09
583 0.08
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.06
594 0.07
595 0.07
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.06
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.04
615 0.05
616 0.05
617 0.06
618 0.07
619 0.08
620 0.08
621 0.09
622 0.12
623 0.14
624 0.19
625 0.26
626 0.26
627 0.29
628 0.35
629 0.4
630 0.42
631 0.45
632 0.42
633 0.41
634 0.48
635 0.47
636 0.45
637 0.44
638 0.46
639 0.5
640 0.55
641 0.53
642 0.55
643 0.54
644 0.52
645 0.57
646 0.52
647 0.44
648 0.37
649 0.32
650 0.23
651 0.22
652 0.19
653 0.1
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.05
658 0.05
659 0.03
660 0.03
661 0.03
662 0.03
663 0.03
664 0.03
665 0.03
666 0.03
667 0.03
668 0.03
669 0.03
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.05
674 0.06
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.09
679 0.11
680 0.11
681 0.14
682 0.13
683 0.15
684 0.16
685 0.17
686 0.15
687 0.14
688 0.13
689 0.1
690 0.1
691 0.09
692 0.07
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.05
698 0.05
699 0.04
700 0.04
701 0.05
702 0.08
703 0.09
704 0.09
705 0.09
706 0.1
707 0.1
708 0.12
709 0.13
710 0.11
711 0.11
712 0.13
713 0.13
714 0.15
715 0.18
716 0.18
717 0.17
718 0.18
719 0.21
720 0.22
721 0.22
722 0.22
723 0.21
724 0.22
725 0.25
726 0.26
727 0.24
728 0.26
729 0.26
730 0.28
731 0.26
732 0.23
733 0.19
734 0.21
735 0.21
736 0.19
737 0.2
738 0.17
739 0.19
740 0.19
741 0.2
742 0.16
743 0.15
744 0.13
745 0.13
746 0.12
747 0.1
748 0.09
749 0.12
750 0.13
751 0.11
752 0.1
753 0.11
754 0.12
755 0.13
756 0.19
757 0.17
758 0.22
759 0.22
760 0.25
761 0.24
762 0.24
763 0.24
764 0.18
765 0.18
766 0.15
767 0.15
768 0.12
769 0.12
770 0.12
771 0.1
772 0.14
773 0.13
774 0.13
775 0.15
776 0.17
777 0.17
778 0.18
779 0.18
780 0.15
781 0.16
782 0.17
783 0.15
784 0.17
785 0.18
786 0.17
787 0.17
788 0.22
789 0.23
790 0.23
791 0.26
792 0.23
793 0.25
794 0.31
795 0.38
796 0.34
797 0.32
798 0.31
799 0.28
800 0.27
801 0.26
802 0.19
803 0.12
804 0.1
805 0.09
806 0.08
807 0.07
808 0.06
809 0.04
810 0.04
811 0.04
812 0.05
813 0.06
814 0.07
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.07
819 0.07
820 0.05
821 0.05
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.05
826 0.06
827 0.07
828 0.09
829 0.17
830 0.19
831 0.19
832 0.25
833 0.27
834 0.28
835 0.33
836 0.37
837 0.37
838 0.39
839 0.4
840 0.35
841 0.35
842 0.33
843 0.27
844 0.22
845 0.17
846 0.13
847 0.13
848 0.13
849 0.13
850 0.15
851 0.15
852 0.15
853 0.13
854 0.13
855 0.15
856 0.19
857 0.17
858 0.2
859 0.2
860 0.2
861 0.25
862 0.26
863 0.24
864 0.21
865 0.21
866 0.19
867 0.22
868 0.22
869 0.19
870 0.19
871 0.18
872 0.19
873 0.19
874 0.17
875 0.15
876 0.14
877 0.12
878 0.14
879 0.17
880 0.16
881 0.19
882 0.21
883 0.24
884 0.26
885 0.25
886 0.22
887 0.19
888 0.19
889 0.17
890 0.15
891 0.11
892 0.09
893 0.09
894 0.08
895 0.07
896 0.07
897 0.06
898 0.05
899 0.07
900 0.07
901 0.08
902 0.07
903 0.07
904 0.09
905 0.1
906 0.11
907 0.11
908 0.14
909 0.15
910 0.16
911 0.17
912 0.18
913 0.19
914 0.24
915 0.21
916 0.19
917 0.18
918 0.21
919 0.28
920 0.3
921 0.28
922 0.25
923 0.26
924 0.26
925 0.26
926 0.25
927 0.2
928 0.19
929 0.25
930 0.3
931 0.34
932 0.4
933 0.47
934 0.52
935 0.57
936 0.6
937 0.57
938 0.49
939 0.5
940 0.46
941 0.39
942 0.31
943 0.26
944 0.24
945 0.24
946 0.25
947 0.19
948 0.17
949 0.17
950 0.18
951 0.16
952 0.14
953 0.13
954 0.15
955 0.21
956 0.22
957 0.22
958 0.21
959 0.22
960 0.24
961 0.3
962 0.33
963 0.35
964 0.37
965 0.42
966 0.46
967 0.48
968 0.52
969 0.53
970 0.53
971 0.51
972 0.53
973 0.57
974 0.57
975 0.6
976 0.54
977 0.45
978 0.4
979 0.36
980 0.35
981 0.26
982 0.22
983 0.16
984 0.16
985 0.17
986 0.18
987 0.19
988 0.18
989 0.19
990 0.19
991 0.22
992 0.23
993 0.23
994 0.2
995 0.22
996 0.23
997 0.22
998 0.23
999 0.24
1000 0.24
1001 0.24
1002 0.24
1003 0.21
1004 0.19
1005 0.18
1006 0.16
1007 0.13
1008 0.11
1009 0.11
1010 0.1
1011 0.1
1012 0.11
1013 0.12
1014 0.12
1015 0.13
1016 0.15
1017 0.13
1018 0.16
1019 0.21
1020 0.19
1021 0.23
1022 0.26
1023 0.25
1024 0.25
1025 0.26
1026 0.24
1027 0.27
1028 0.3
1029 0.31
1030 0.32
1031 0.36
1032 0.37
1033 0.38
1034 0.42
1035 0.4
1036 0.37
1037 0.36
1038 0.31
1039 0.28
1040 0.24
1041 0.23
1042 0.21
1043 0.17
1044 0.18
1045 0.15
1046 0.17
1047 0.16
1048 0.17
1049 0.18
1050 0.18
1051 0.19
1052 0.17
1053 0.19
1054 0.23
1055 0.27
1056 0.27
1057 0.33
1058 0.34
1059 0.4
1060 0.47
1061 0.48
1062 0.47
1063 0.48
1064 0.52
1065 0.47
1066 0.44
1067 0.38
1068 0.33
1069 0.31
1070 0.27
1071 0.22
1072 0.19
1073 0.17
1074 0.16
1075 0.16
1076 0.14
1077 0.15
1078 0.14
1079 0.15
1080 0.14
1081 0.15
1082 0.13
1083 0.14
1084 0.18
1085 0.2
1086 0.22
1087 0.27
1088 0.29
1089 0.33
1090 0.38
1091 0.38
1092 0.38
1093 0.35
1094 0.36
1095 0.34
1096 0.33
1097 0.3
1098 0.29
1099 0.3
1100 0.28
1101 0.26
1102 0.24
1103 0.27
1104 0.27
1105 0.25
1106 0.22
1107 0.27
1108 0.3
1109 0.31
1110 0.29
1111 0.24
1112 0.26
1113 0.26
1114 0.25
1115 0.2
1116 0.15
1117 0.15
1118 0.18
1119 0.17
1120 0.15
1121 0.15
1122 0.17
1123 0.18
1124 0.18
1125 0.17
1126 0.18
1127 0.21
1128 0.23
1129 0.24
1130 0.25
1131 0.27
1132 0.26
1133 0.27
1134 0.24
1135 0.26
1136 0.26
1137 0.28
1138 0.27
1139 0.26
1140 0.35
1141 0.4
1142 0.45
1143 0.47
1144 0.46
1145 0.44
1146 0.5
1147 0.52
1148 0.49
1149 0.52
1150 0.55
1151 0.58
1152 0.66
1153 0.74
1154 0.76
1155 0.8
1156 0.81