Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JP86

Protein Details
Accession C4JP86    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MGSSQKRKNEKKKDFQKAKLKVGKAKPKAANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-28KRKNEKKKDFQKAKLKVGKAKPK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG ure:UREG_04468  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSSQKRKNEKKKDFQKAKLKVGKAKPKAANFTDTSFKSKSIVLNQQSLSAAAPSATAQFSHSLSLLGSKSDTQRKEALSNLTTAIASRPVHSPLPQPVSVILPSLLPLILDGSNGVRTQLLKLLKVLPEADMEGHASLMLPYIRAGMTHLAADIRLSAVEILSWLVSVAGQEVVSCAGGWIKTLNCFLSILGWHTEESAKWSSNRASFGKAGSDGKPMVKILQALADFLRAGMCDLDLMTVAEQEQGVSICDLSFPLLHTAQHLLPTKSSPFAYLNLFGQPKDEEGEMYESTEDRVRIFAQRFQQPVQRGVEAAKKDGGEVGRASTGVTKVMKESKNRQAPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.93
3 0.93
4 0.91
5 0.91
6 0.89
7 0.85
8 0.83
9 0.83
10 0.84
11 0.81
12 0.81
13 0.78
14 0.77
15 0.79
16 0.72
17 0.69
18 0.61
19 0.57
20 0.55
21 0.49
22 0.47
23 0.4
24 0.37
25 0.32
26 0.32
27 0.33
28 0.34
29 0.41
30 0.4
31 0.45
32 0.45
33 0.46
34 0.43
35 0.38
36 0.3
37 0.21
38 0.17
39 0.1
40 0.1
41 0.07
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.09
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.14
57 0.2
58 0.28
59 0.29
60 0.29
61 0.33
62 0.35
63 0.37
64 0.39
65 0.39
66 0.32
67 0.32
68 0.29
69 0.25
70 0.22
71 0.2
72 0.16
73 0.15
74 0.14
75 0.14
76 0.16
77 0.18
78 0.2
79 0.21
80 0.25
81 0.27
82 0.32
83 0.31
84 0.29
85 0.27
86 0.28
87 0.26
88 0.23
89 0.16
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.08
94 0.06
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.14
108 0.15
109 0.14
110 0.16
111 0.19
112 0.19
113 0.2
114 0.2
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.16
190 0.19
191 0.21
192 0.26
193 0.23
194 0.24
195 0.23
196 0.24
197 0.23
198 0.22
199 0.22
200 0.19
201 0.2
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.15
207 0.14
208 0.13
209 0.1
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.15
249 0.15
250 0.22
251 0.25
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.26
256 0.26
257 0.25
258 0.22
259 0.19
260 0.21
261 0.23
262 0.22
263 0.22
264 0.25
265 0.26
266 0.22
267 0.23
268 0.21
269 0.19
270 0.19
271 0.18
272 0.12
273 0.13
274 0.18
275 0.16
276 0.16
277 0.16
278 0.14
279 0.15
280 0.18
281 0.16
282 0.12
283 0.14
284 0.15
285 0.21
286 0.24
287 0.29
288 0.33
289 0.4
290 0.43
291 0.45
292 0.5
293 0.47
294 0.5
295 0.49
296 0.42
297 0.36
298 0.36
299 0.39
300 0.34
301 0.33
302 0.3
303 0.26
304 0.25
305 0.29
306 0.26
307 0.22
308 0.21
309 0.21
310 0.18
311 0.18
312 0.19
313 0.18
314 0.18
315 0.19
316 0.2
317 0.18
318 0.23
319 0.32
320 0.36
321 0.41
322 0.5
323 0.56