FuNGI

W3WLS8

Protein Details

Accession

W3WLS8

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
126-146	SDKDTKPTKKAEKPSSAKKST	Hydrophilic
372-391	QYVRKPKPVRQQPENLKARF	Hydrophilic
473-495	EEPSPPKKKSKATDKAAKRAKVS	Hydrophilic
548-576	ATPSKTPASTKSKKDKKSKADDTPKALTQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
477-494	PPKKKSKATDKAAKRAKV
560-564	KKDKK

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
KEGG	pfy:PFICI_14692 -
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPSKSLGSLSAMRDAIQKKTAAKASSLAGAASSLKSAAPVDDSSDSNSSGSSDSDSDSGSDSDSGIEEAKKKLDAKNAAKKAAATKTQPPAATATNLKKTSTKKPAADTSSSDDSTSDSDSGSDSDKDTKPTKKAEKPSSAKKSTTVKKAASDSSTSSSGSDSDSDSDSDSDAGAKVQSIASAVATKAAHANTALPIRNSPKNEDADEDSSSDSESESESDAKAVTRVNGTSDNTELAKPEWLTKSDFMLRKASTDNPGKEVSEFLSKSSLEGKQVWYFTAPASLPITVIKDMEIDLAKAQSGGAILNHKGDSYGLDLEPYTTSSQIQLLIPSKGGEKYNTLNRGIDSTVHLRRIAEFGGSSKVSSTATDQYVRKPKPVRQQPENLKARFTPIGVPTKKPTPFQATKSKQVSDSSSSSDSDSDVEMADASALPPSVLSKKTEAAGTNGKSKRKQPSDSSSSGSDSSSSESDEEPSPPKKKSKATDKAAKRAKVSPVKELVKPTTNSPAPAVQAENIDVPSSLGKKSKTKSTPIPPPTVGRTLADTHATPSKTPASTKSKKDKKSKADDTPKALTQTPIPPPSYGIGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.34
3	0.34
4	0.33
5	0.34
6	0.31
7	0.38
8	0.44
9	0.39
10	0.38
11	0.36
12	0.34
13	0.35
14	0.32
15	0.25
16	0.18
17	0.18
18	0.17
19	0.15
20	0.13
21	0.09
22	0.08
23	0.1
24	0.1
25	0.1
26	0.12
27	0.12
28	0.16
29	0.18
30	0.19
31	0.22
32	0.23
33	0.23
34	0.2
35	0.19
36	0.16
37	0.14
38	0.14
39	0.13
40	0.12
41	0.13
42	0.13
43	0.14
44	0.13
45	0.14
46	0.14
47	0.13
48	0.12
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.1
54	0.13
55	0.14
56	0.16
57	0.18
58	0.22
59	0.25
60	0.29
61	0.36
62	0.43
63	0.51
64	0.59
65	0.64
66	0.63
67	0.61
68	0.59
69	0.57
70	0.55
71	0.51
72	0.45
73	0.47
74	0.51
75	0.55
76	0.53
77	0.46
78	0.42
79	0.38
80	0.38
81	0.37
82	0.37
83	0.4
84	0.41
85	0.41
86	0.44
87	0.47
88	0.53
89	0.56
90	0.57
91	0.53
92	0.59
93	0.66
94	0.66
95	0.65
96	0.58
97	0.55
98	0.52
99	0.47
100	0.41
101	0.32
102	0.27
103	0.25
104	0.23
105	0.16
106	0.1
107	0.1
108	0.11
109	0.12
110	0.13
111	0.12
112	0.12
113	0.18
114	0.2
115	0.25
116	0.3
117	0.36
118	0.38
119	0.47
120	0.56
121	0.58
122	0.67
123	0.71
124	0.76
125	0.78
126	0.83
127	0.84
128	0.79
129	0.72
130	0.68
131	0.68
132	0.65
133	0.67
134	0.63
135	0.56
136	0.55
137	0.58
138	0.56
139	0.49
140	0.43
141	0.37
142	0.34
143	0.32
144	0.27
145	0.23
146	0.19
147	0.17
148	0.15
149	0.13
150	0.1
151	0.11
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.12
156	0.11
157	0.1
158	0.09
159	0.08
160	0.07
161	0.07
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.1
173	0.1
174	0.1
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.11
179	0.12
180	0.11
181	0.16
182	0.17
183	0.15
184	0.18
185	0.22
186	0.28
187	0.29
188	0.31
189	0.32
190	0.34
191	0.34
192	0.34
193	0.34
194	0.31
195	0.3
196	0.26
197	0.21
198	0.18
199	0.17
200	0.14
201	0.09
202	0.07
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.08
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.09
215	0.09
216	0.11
217	0.15
218	0.16
219	0.16
220	0.16
221	0.16
222	0.15
223	0.15
224	0.14
225	0.11
226	0.12
227	0.11
228	0.15
229	0.15
230	0.16
231	0.19
232	0.19
233	0.22
234	0.26
235	0.28
236	0.26
237	0.3
238	0.28
239	0.27
240	0.29
241	0.28
242	0.28
243	0.32
244	0.31
245	0.28
246	0.29
247	0.28
248	0.26
249	0.24
250	0.19
251	0.18
252	0.17
253	0.15
254	0.16
255	0.16
256	0.16
257	0.19
258	0.18
259	0.14
260	0.16
261	0.18
262	0.18
263	0.19
264	0.19
265	0.16
266	0.15
267	0.13
268	0.14
269	0.11
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.1
275	0.11
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.08
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.05
293	0.06
294	0.07
295	0.08
296	0.09
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.1
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.08
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.1
317	0.12
318	0.12
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.13
323	0.14
324	0.12
325	0.13
326	0.17
327	0.24
328	0.27
329	0.27
330	0.25
331	0.25
332	0.25
333	0.23
334	0.2
335	0.16
336	0.19
337	0.2
338	0.21
339	0.21
340	0.2
341	0.2
342	0.21
343	0.18
344	0.13
345	0.1
346	0.1
347	0.13
348	0.13
349	0.12
350	0.1
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.13
355	0.13
356	0.15
357	0.21
358	0.21
359	0.28
360	0.37
361	0.38
362	0.41
363	0.43
364	0.48
365	0.53
366	0.63
367	0.64
368	0.62
369	0.71
370	0.74
371	0.79
372	0.81
373	0.71
374	0.63
375	0.54
376	0.51
377	0.42
378	0.33
379	0.27
380	0.24
381	0.34
382	0.33
383	0.36
384	0.35
385	0.42
386	0.44
387	0.4
388	0.4
389	0.4
390	0.44
391	0.47
392	0.55
393	0.53
394	0.59
395	0.62
396	0.59
397	0.52
398	0.49
399	0.47
400	0.41
401	0.38
402	0.33
403	0.3
404	0.29
405	0.27
406	0.24
407	0.2
408	0.16
409	0.14
410	0.1
411	0.08
412	0.08
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.06
423	0.1
424	0.12
425	0.14
426	0.16
427	0.18
428	0.19
429	0.23
430	0.22
431	0.23
432	0.29
433	0.3
434	0.37
435	0.4
436	0.44
437	0.46
438	0.52
439	0.58
440	0.58
441	0.63
442	0.62
443	0.67
444	0.69
445	0.69
446	0.65
447	0.57
448	0.51
449	0.45
450	0.36
451	0.27
452	0.2
453	0.19
454	0.16
455	0.14
456	0.13
457	0.13
458	0.15
459	0.16
460	0.18
461	0.2
462	0.27
463	0.3
464	0.34
465	0.4
466	0.45
467	0.52
468	0.59
469	0.65
470	0.69
471	0.74
472	0.8
473	0.82
474	0.85
475	0.85
476	0.8
477	0.73
478	0.69
479	0.69
480	0.68
481	0.62
482	0.6
483	0.61
484	0.6
485	0.6
486	0.6
487	0.56
488	0.54
489	0.52
490	0.47
491	0.47
492	0.45
493	0.43
494	0.39
495	0.37
496	0.31
497	0.32
498	0.3
499	0.22
500	0.22
501	0.21
502	0.2
503	0.17
504	0.16
505	0.13
506	0.12
507	0.14
508	0.15
509	0.16
510	0.19
511	0.23
512	0.31
513	0.35
514	0.45
515	0.48
516	0.55
517	0.62
518	0.68
519	0.74
520	0.73
521	0.76
522	0.69
523	0.68
524	0.66
525	0.6
526	0.52
527	0.43
528	0.4
529	0.35
530	0.34
531	0.32
532	0.27
533	0.26
534	0.3
535	0.3
536	0.27
537	0.28
538	0.32
539	0.31
540	0.33
541	0.38
542	0.42
543	0.5
544	0.6
545	0.66
546	0.7
547	0.77
548	0.85
549	0.87
550	0.87
551	0.9
552	0.9
553	0.9
554	0.91
555	0.9
556	0.87
557	0.83
558	0.77
559	0.69
560	0.61
561	0.52
562	0.46
563	0.46
564	0.47
565	0.47
566	0.44
567	0.41
568	0.42

W3WLS8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer