FuNGI

C4JYG7

Protein Details

Accession

C4JYG7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-123	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
410-444	RRRRQTEERRNANAKRRKEQERQRAEENPRKRPRK

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 8, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	ure:UREG_07218 -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSTKYPKIISAVVEELPQEFNGEEIPVDTTKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPSNEGEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEADEKKAEFAKLLRKQNRGKGDTELAEEVVNKTWDSNVITPGTPFMDILSAALRYWVAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFIRSQRSCSEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPHFRVLREDVFFQESKARTCRLCGQQGHVAEACTGKAKEKSGEFDEKQKGSPLKPFIWLHVSVLREYLAAEMFVPNQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRENGIDTLIAIWRDNIPLMGGYLTKDGHVDLKRAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQTEERRNANAKRRKEQERQRAEENPRKRPRKSLDNDMSMPSSRRGKEMDGGAPADMPLFIPSKGQLPRAERELTHAMVVNRGAVYKANMANKSAAAALKSQLISGSENGTSNVDVNVESSIASSTKASPLGKRKADALEADTTTEQENSEKPPADEDQLPEDSVRLWEQGYADRYYEQKFNVDPKDIEFRHKVAKSYVEGLCWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDLDQMDIQFNKGKPFRPFEQLMGVLPAASNHAIPDIFRDLMSDPASEIIDFYPEDFPIDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKRLLAAMAKRYHRLTEAERARNEMGRDTLFISDRHPLYKDIVANFYSKKQGVPNLKLNMRVSEGLGGEVERDGAYIPHSSLVAAINDVELPSLDQDRSISVLYDIPKSIHTHKSMLLRGVVFNPPVLDRTDIEVTKNKAQHSGRAFGGAPLHSGNGRGRGRISYAGDRPNPFAAHLDPNFKPPHNVNGPPGSGRGGPPQFDRGRSRYPQSQQSRGGNYGGYGGQSDSYSQRDSYQPPARGRGSYQPGSYGRDTYQDRQYGYQDRSQPSNRSGRGGGGSGYYRGGGRGQQYSSQTGHYGRNDGYGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.45
3	0.46
4	0.46
5	0.41
6	0.38
7	0.35
8	0.3
9	0.27
10	0.25
11	0.23
12	0.21
13	0.19
14	0.15
15	0.11
16	0.1
17	0.1
18	0.1
19	0.09
20	0.08
21	0.11
22	0.11
23	0.13
24	0.14
25	0.18
26	0.25
27	0.3
28	0.32
29	0.31
30	0.34
31	0.37
32	0.38
33	0.39
34	0.34
35	0.33
36	0.3
37	0.28
38	0.25
39	0.2
40	0.18
41	0.12
42	0.09
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.37
54	0.44
55	0.51
56	0.52
57	0.54
58	0.55
59	0.56
60	0.49
61	0.43
62	0.36
63	0.3
64	0.27
65	0.21
66	0.16
67	0.14
68	0.13
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.13
73	0.13
74	0.17
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.46
80	0.45
81	0.46
82	0.45
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.45
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.82
105	0.79
106	0.76
107	0.77
108	0.77
109	0.72
110	0.73
111	0.65
112	0.59
113	0.64
114	0.58
115	0.49
116	0.44
117	0.39
118	0.33
119	0.37
120	0.35
121	0.28
122	0.31
123	0.4
124	0.42
125	0.52
126	0.56
127	0.59
128	0.67
129	0.73
130	0.79
131	0.72
132	0.66
133	0.61
134	0.6
135	0.54
136	0.49
137	0.42
138	0.32
139	0.29
140	0.27
141	0.22
142	0.19
143	0.17
144	0.13
145	0.12
146	0.12
147	0.15
148	0.18
149	0.19
150	0.2
151	0.21
152	0.21
153	0.21
154	0.22
155	0.2
156	0.16
157	0.14
158	0.11
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.08
165	0.09
166	0.08
167	0.07
168	0.09
169	0.12
170	0.12
171	0.13
172	0.16
173	0.2
174	0.27
175	0.27
176	0.29
177	0.28
178	0.31
179	0.36
180	0.33
181	0.29
182	0.26
183	0.32
184	0.28
185	0.29
186	0.25
187	0.21
188	0.24
189	0.24
190	0.21
191	0.15
192	0.15
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.09
197	0.09
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.13
203	0.17
204	0.26
205	0.27
206	0.28
207	0.31
208	0.34
209	0.37
210	0.4
211	0.45
212	0.42
213	0.51
214	0.53
215	0.53
216	0.57
217	0.53
218	0.46
219	0.38
220	0.32
221	0.24
222	0.22
223	0.18
224	0.11
225	0.1
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.06
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.07
237	0.08
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.18
242	0.2
243	0.24
244	0.25
245	0.26
246	0.25
247	0.28
248	0.27
249	0.24
250	0.28
251	0.24
252	0.26
253	0.28
254	0.28
255	0.24
256	0.28
257	0.36
258	0.37
259	0.44
260	0.42
261	0.44
262	0.47
263	0.48
264	0.48
265	0.39
266	0.32
267	0.25
268	0.23
269	0.18
270	0.15
271	0.15
272	0.14
273	0.17
274	0.18
275	0.22
276	0.24
277	0.28
278	0.31
279	0.39
280	0.38
281	0.44
282	0.48
283	0.45
284	0.44
285	0.45
286	0.42
287	0.36
288	0.41
289	0.38
290	0.33
291	0.39
292	0.38
293	0.35
294	0.37
295	0.35
296	0.31
297	0.29
298	0.28
299	0.21
300	0.21
301	0.18
302	0.13
303	0.13
304	0.11
305	0.07
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.1
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.1
316	0.13
317	0.16
318	0.14
319	0.15
320	0.16
321	0.17
322	0.17
323	0.18
324	0.15
325	0.11
326	0.1
327	0.09
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.08
344	0.12
345	0.15
346	0.16
347	0.15
348	0.16
349	0.16
350	0.15
351	0.15
352	0.1
353	0.05
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.13
375	0.14
376	0.16
377	0.16
378	0.21
379	0.22
380	0.22
381	0.22
382	0.18
383	0.18
384	0.18
385	0.18
386	0.15
387	0.14
388	0.14
389	0.14
390	0.11
391	0.11
392	0.13
393	0.13
394	0.2
395	0.26
396	0.29
397	0.37
398	0.39
399	0.44
400	0.5
401	0.59
402	0.62
403	0.67
404	0.72
405	0.71
406	0.76
407	0.78
408	0.78
409	0.75
410	0.7
411	0.68
412	0.68
413	0.69
414	0.72
415	0.75
416	0.76
417	0.78
418	0.76
419	0.73
420	0.73
421	0.73
422	0.72
423	0.69
424	0.69
425	0.69
426	0.71
427	0.67
428	0.68
429	0.67
430	0.69
431	0.68
432	0.68
433	0.66
434	0.64
435	0.64
436	0.56
437	0.51
438	0.41
439	0.36
440	0.28
441	0.26
442	0.2
443	0.21
444	0.21
445	0.2
446	0.23
447	0.25
448	0.25
449	0.21
450	0.21
451	0.19
452	0.17
453	0.15
454	0.11
455	0.08
456	0.06
457	0.05
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.07
462	0.12
463	0.14
464	0.17
465	0.2
466	0.23
467	0.25
468	0.29
469	0.3
470	0.24
471	0.28
472	0.28
473	0.24
474	0.21
475	0.21
476	0.17
477	0.17
478	0.17
479	0.12
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.06
484	0.07
485	0.1
486	0.13
487	0.17
488	0.17
489	0.18
490	0.18
491	0.18
492	0.17
493	0.15
494	0.12
495	0.08
496	0.09
497	0.08
498	0.1
499	0.1
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.09
504	0.09
505	0.1
506	0.08
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.08
511	0.08
512	0.07
513	0.06
514	0.05
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.07
526	0.1
527	0.11
528	0.16
529	0.24
530	0.31
531	0.32
532	0.33
533	0.34
534	0.33
535	0.34
536	0.3
537	0.24
538	0.2
539	0.19
540	0.19
541	0.16
542	0.15
543	0.13
544	0.13
545	0.1
546	0.07
547	0.08
548	0.1
549	0.14
550	0.14
551	0.14
552	0.16
553	0.17
554	0.19
555	0.2
556	0.18
557	0.19
558	0.18
559	0.19
560	0.16
561	0.15
562	0.12
563	0.12
564	0.11
565	0.07
566	0.06
567	0.07
568	0.08
569	0.12
570	0.14
571	0.14
572	0.14
573	0.15
574	0.17
575	0.18
576	0.19
577	0.16
578	0.15
579	0.16
580	0.22
581	0.24
582	0.25
583	0.23
584	0.23
585	0.32
586	0.3
587	0.33
588	0.3
589	0.29
590	0.34
591	0.35
592	0.34
593	0.27
594	0.3
595	0.27
596	0.31
597	0.29
598	0.22
599	0.21
600	0.2
601	0.17
602	0.13
603	0.12
604	0.06
605	0.05
606	0.06
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.08
612	0.09
613	0.14
614	0.17
615	0.16
616	0.19
617	0.2
618	0.25
619	0.28
620	0.3
621	0.27
622	0.24
623	0.24
624	0.2
625	0.2
626	0.15
627	0.12
628	0.09
629	0.07
630	0.08
631	0.1
632	0.09
633	0.08
634	0.08
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.09
639	0.11
640	0.12
641	0.18
642	0.2
643	0.25
644	0.29
645	0.35
646	0.38
647	0.4
648	0.41
649	0.37
650	0.39
651	0.35
652	0.31
653	0.26
654	0.23
655	0.16
656	0.13
657	0.12
658	0.08
659	0.07
660	0.07
661	0.05
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.1
666	0.11
667	0.11
668	0.11
669	0.12
670	0.12
671	0.15
672	0.16
673	0.13
674	0.1
675	0.11
676	0.12
677	0.1
678	0.1
679	0.07
680	0.07
681	0.07
682	0.08
683	0.08
684	0.08
685	0.09
686	0.09
687	0.09
688	0.1
689	0.13
690	0.14
691	0.13
692	0.16
693	0.15
694	0.17
695	0.18
696	0.16
697	0.15
698	0.14
699	0.14
700	0.16
701	0.17
702	0.15
703	0.14
704	0.13
705	0.12
706	0.12
707	0.12
708	0.08
709	0.07
710	0.09
711	0.09
712	0.09
713	0.11
714	0.15
715	0.22
716	0.28
717	0.31
718	0.32
719	0.33
720	0.35
721	0.33
722	0.33
723	0.3
724	0.34
725	0.41
726	0.45
727	0.45
728	0.48
729	0.47
730	0.46
731	0.42
732	0.34
733	0.28
734	0.21
735	0.22
736	0.19
737	0.2
738	0.18
739	0.18
740	0.17
741	0.2
742	0.2
743	0.21
744	0.21
745	0.2
746	0.22
747	0.26
748	0.28
749	0.24
750	0.26
751	0.26
752	0.27
753	0.27
754	0.26
755	0.27
756	0.23
757	0.23
758	0.24
759	0.31
760	0.37
761	0.42
762	0.48
763	0.51
764	0.53
765	0.56
766	0.54
767	0.48
768	0.42
769	0.36
770	0.28
771	0.24
772	0.22
773	0.17
774	0.15
775	0.13
776	0.1
777	0.09
778	0.09
779	0.06
780	0.05
781	0.05
782	0.05
783	0.07
784	0.08
785	0.08
786	0.08
787	0.09
788	0.08
789	0.09
790	0.11
791	0.09
792	0.09
793	0.08
794	0.08
795	0.08
796	0.08
797	0.07
798	0.05
799	0.05
800	0.07
801	0.09
802	0.08
803	0.08
804	0.09
805	0.1
806	0.12
807	0.11
808	0.1
809	0.09
810	0.13
811	0.15
812	0.17
813	0.17
814	0.16
815	0.17
816	0.21
817	0.25
818	0.29
819	0.3
820	0.3
821	0.34
822	0.41
823	0.42
824	0.41
825	0.39
826	0.34
827	0.32
828	0.33
829	0.31
830	0.24
831	0.21
832	0.19
833	0.17
834	0.17
835	0.17
836	0.16
837	0.14
838	0.19
839	0.24
840	0.23
841	0.26
842	0.31
843	0.34
844	0.39
845	0.41
846	0.37
847	0.4
848	0.41
849	0.46
850	0.45
851	0.45
852	0.38
853	0.38
854	0.37
855	0.31
856	0.33
857	0.25
858	0.22
859	0.18
860	0.18
861	0.15
862	0.17
863	0.18
864	0.23
865	0.24
866	0.24
867	0.25
868	0.26
869	0.29
870	0.32
871	0.35
872	0.34
873	0.39
874	0.45
875	0.49
876	0.5
877	0.49
878	0.48
879	0.43
880	0.36
881	0.33
882	0.28
883	0.31
884	0.32
885	0.35
886	0.32
887	0.37
888	0.41
889	0.39
890	0.4
891	0.34
892	0.41
893	0.42
894	0.46
895	0.46
896	0.48
897	0.49
898	0.45
899	0.44
900	0.37
901	0.31
902	0.29
903	0.32
904	0.29
905	0.29
906	0.31
907	0.39
908	0.4
909	0.44
910	0.49
911	0.46
912	0.52
913	0.55
914	0.59
915	0.6
916	0.63
917	0.68
918	0.69
919	0.71
920	0.71
921	0.73
922	0.71
923	0.64
924	0.59
925	0.49
926	0.41
927	0.35
928	0.27
929	0.2
930	0.14
931	0.12
932	0.12
933	0.12
934	0.14
935	0.14
936	0.16
937	0.18
938	0.18
939	0.21
940	0.25
941	0.28
942	0.36
943	0.42
944	0.46
945	0.49
946	0.56
947	0.56
948	0.54
949	0.54
950	0.54
951	0.54
952	0.52
953	0.48
954	0.47
955	0.47
956	0.5
957	0.48
958	0.41
959	0.34
960	0.37
961	0.42
962	0.4
963	0.46
964	0.45
965	0.45
966	0.45
967	0.51
968	0.51
969	0.5
970	0.51
971	0.5
972	0.5
973	0.56
974	0.59
975	0.58
976	0.58
977	0.64
978	0.59
979	0.56
980	0.53
981	0.49
982	0.46
983	0.41
984	0.34
985	0.28
986	0.28
987	0.24
988	0.24
989	0.2
990	0.17
991	0.16
992	0.18
993	0.18
994	0.21
995	0.25
996	0.27
997	0.32
998	0.36
999	0.39
1000	0.39
1001	0.37
1002	0.36
1003	0.34
1004	0.38
1005	0.36
1006	0.37
1007	0.33
1008	0.39

C4JYG7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer