Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3XDS6

Protein Details
Accession W3XDS6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-49LIDRVTKPEPKARRRAKSKKSREQTSVISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-42KPEPKARRRAKSKKSR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002711  HNH  
IPR003615  HNH_nuc  
Gene Ontology GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG pfy:PFICI_02230  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01844  HNH  
CDD cd00085  HNHc  
Amino Acid Sequences MIPDDQQKNYDLFRDCLSSVLIDRVTKPEPKARRRAKSKKSREQTSVISSTTQEEESNKLQDTEELGDFVEYIAAETFESLPEELKTIEHHDYAQDTDLQARYSLPLTGDDVGTLIPALDPSVSESLLTYGIADKGRGQGAPEFLAPVLTAFISAIAAPPPAPSSTRTTACEICGRDWIPLTYHHLIPRFVHAKAVKRGWHREDDLQNVAWLCRACHSFVHKFASHEDLARYHYTVDLLLEQDEIVQFAKWVSRLRWKGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.27
4 0.26
5 0.21
6 0.18
7 0.21
8 0.2
9 0.18
10 0.19
11 0.23
12 0.26
13 0.29
14 0.32
15 0.37
16 0.45
17 0.53
18 0.62
19 0.68
20 0.75
21 0.81
22 0.88
23 0.9
24 0.91
25 0.93
26 0.93
27 0.93
28 0.91
29 0.86
30 0.81
31 0.76
32 0.73
33 0.65
34 0.55
35 0.46
36 0.38
37 0.34
38 0.3
39 0.24
40 0.17
41 0.15
42 0.19
43 0.2
44 0.23
45 0.21
46 0.2
47 0.19
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.17
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.08
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.12
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.11
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.04
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.08
150 0.1
151 0.16
152 0.2
153 0.23
154 0.25
155 0.28
156 0.28
157 0.3
158 0.32
159 0.28
160 0.24
161 0.26
162 0.25
163 0.22
164 0.22
165 0.21
166 0.17
167 0.17
168 0.23
169 0.22
170 0.23
171 0.26
172 0.27
173 0.28
174 0.28
175 0.34
176 0.29
177 0.26
178 0.31
179 0.31
180 0.37
181 0.42
182 0.47
183 0.45
184 0.49
185 0.58
186 0.56
187 0.59
188 0.56
189 0.57
190 0.57
191 0.56
192 0.53
193 0.45
194 0.41
195 0.34
196 0.3
197 0.25
198 0.2
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.21
204 0.28
205 0.32
206 0.37
207 0.43
208 0.41
209 0.41
210 0.42
211 0.43
212 0.37
213 0.33
214 0.31
215 0.25
216 0.27
217 0.28
218 0.26
219 0.2
220 0.2
221 0.18
222 0.16
223 0.16
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.11
237 0.14
238 0.19
239 0.23
240 0.33