FuNGI

W3XE44

Protein Details

Accession

W3XE44

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
187-206	QNLKDRSRIRHPSKRNLKLV	Hydrophilic
371-393	YPVMQRSQIRPQRNKNIARKIGI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	pfy:PFICI_05352 -
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MASSSRSGENRPIHQDFIARIRYSNALPPPPIPPKLLDIPNTGLASGQYTAPGFASRLAREQPLNIEADAELGMPLDLVGMPGIFDGDESSIQAPAQAPQPHLHDKPLLRSLQQLGKPKTDNAAVSFLRRTEYISSSASKSHGSGPLRAMNTAPARRQVKRKSPEPDKDSPAYVKRKIDQSFSIAEQNLKDRSRIRHPSKRNLKLVDSFPLLPDLEAFPDSGAYVTIKFLTNPVGKATKYDTRLLNGVFRPIERTEAEELAIQAARDAYERDPQNNPKPADNIHYDYYLNDTEANGKKFRQRFDVDNPNRDDESLYPHKHDSDGCFQFNRLRAYETAQESELNHWSKYDEELIIAFNEESTSLHQKAAYYYPVMQRSQIRPQRNKNIARKIGITDEDEQIIDQLDITVDEPTEQIKDKVERFKHDPYWPETAEEEEVVMEEEEGHHNGHADEEEEVNGRSRSPPAHSDEELDADGDEED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.5
3	0.44
4	0.45
5	0.46
6	0.38
7	0.35
8	0.35
9	0.37
10	0.35
11	0.38
12	0.37
13	0.35
14	0.37
15	0.38
16	0.43
17	0.47
18	0.48
19	0.43
20	0.38
21	0.38
22	0.44
23	0.48
24	0.43
25	0.41
26	0.42
27	0.45
28	0.43
29	0.36
30	0.29
31	0.23
32	0.22
33	0.18
34	0.14
35	0.11
36	0.11
37	0.11
38	0.11
39	0.12
40	0.1
41	0.14
42	0.19
43	0.18
44	0.23
45	0.25
46	0.28
47	0.29
48	0.3
49	0.3
50	0.28
51	0.29
52	0.24
53	0.22
54	0.18
55	0.18
56	0.16
57	0.11
58	0.08
59	0.06
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.04
74	0.06
75	0.06
76	0.07
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.17
84	0.19
85	0.2
86	0.23
87	0.29
88	0.35
89	0.35
90	0.37
91	0.36
92	0.35
93	0.4
94	0.44
95	0.4
96	0.34
97	0.36
98	0.38
99	0.4
100	0.43
101	0.46
102	0.44
103	0.48
104	0.49
105	0.46
106	0.45
107	0.4
108	0.36
109	0.29
110	0.33
111	0.27
112	0.28
113	0.28
114	0.25
115	0.23
116	0.21
117	0.21
118	0.18
119	0.19
120	0.2
121	0.21
122	0.23
123	0.23
124	0.24
125	0.23
126	0.2
127	0.19
128	0.19
129	0.23
130	0.23
131	0.25
132	0.27
133	0.32
134	0.32
135	0.31
136	0.27
137	0.27
138	0.31
139	0.32
140	0.3
141	0.32
142	0.36
143	0.41
144	0.5
145	0.54
146	0.57
147	0.61
148	0.68
149	0.7
150	0.75
151	0.8
152	0.78
153	0.76
154	0.71
155	0.65
156	0.6
157	0.55
158	0.52
159	0.49
160	0.47
161	0.44
162	0.41
163	0.47
164	0.47
165	0.46
166	0.4
167	0.37
168	0.34
169	0.32
170	0.32
171	0.25
172	0.24
173	0.21
174	0.22
175	0.24
176	0.22
177	0.22
178	0.23
179	0.28
180	0.37
181	0.46
182	0.52
183	0.57
184	0.64
185	0.72
186	0.78
187	0.82
188	0.79
189	0.72
190	0.67
191	0.63
192	0.57
193	0.51
194	0.42
195	0.34
196	0.27
197	0.25
198	0.21
199	0.15
200	0.14
201	0.1
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.04
211	0.04
212	0.05
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.07
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.15
221	0.17
222	0.16
223	0.18
224	0.21
225	0.21
226	0.23
227	0.27
228	0.25
229	0.24
230	0.26
231	0.26
232	0.26
233	0.21
234	0.21
235	0.17
236	0.17
237	0.18
238	0.17
239	0.19
240	0.14
241	0.17
242	0.16
243	0.16
244	0.17
245	0.14
246	0.14
247	0.12
248	0.12
249	0.08
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.14
257	0.15
258	0.18
259	0.23
260	0.3
261	0.37
262	0.44
263	0.44
264	0.39
265	0.4
266	0.39
267	0.38
268	0.36
269	0.32
270	0.26
271	0.26
272	0.24
273	0.22
274	0.24
275	0.19
276	0.15
277	0.11
278	0.1
279	0.16
280	0.2
281	0.22
282	0.21
283	0.22
284	0.29
285	0.33
286	0.35
287	0.36
288	0.35
289	0.39
290	0.46
291	0.56
292	0.55
293	0.59
294	0.59
295	0.55
296	0.51
297	0.45
298	0.37
299	0.26
300	0.29
301	0.29
302	0.28
303	0.27
304	0.28
305	0.28
306	0.29
307	0.3
308	0.27
309	0.28
310	0.31
311	0.31
312	0.31
313	0.31
314	0.34
315	0.37
316	0.36
317	0.27
318	0.25
319	0.24
320	0.27
321	0.33
322	0.31
323	0.28
324	0.25
325	0.25
326	0.23
327	0.25
328	0.28
329	0.23
330	0.2
331	0.18
332	0.18
333	0.18
334	0.19
335	0.19
336	0.13
337	0.12
338	0.12
339	0.13
340	0.12
341	0.12
342	0.1
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.1
348	0.15
349	0.16
350	0.17
351	0.18
352	0.18
353	0.21
354	0.24
355	0.22
356	0.18
357	0.22
358	0.27
359	0.32
360	0.32
361	0.33
362	0.36
363	0.4
364	0.48
365	0.52
366	0.56
367	0.6
368	0.7
369	0.77
370	0.79
371	0.84
372	0.83
373	0.86
374	0.83
375	0.77
376	0.7
377	0.62
378	0.58
379	0.51
380	0.45
381	0.37
382	0.32
383	0.29
384	0.26
385	0.22
386	0.17
387	0.15
388	0.11
389	0.08
390	0.06
391	0.05
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.1
400	0.12
401	0.12
402	0.17
403	0.23
404	0.29
405	0.39
406	0.44
407	0.49
408	0.54
409	0.61
410	0.64
411	0.64
412	0.65
413	0.6
414	0.63
415	0.56
416	0.52
417	0.45
418	0.4
419	0.35
420	0.28
421	0.23
422	0.15
423	0.14
424	0.13
425	0.12
426	0.08
427	0.06
428	0.08
429	0.1
430	0.12
431	0.12
432	0.11
433	0.12
434	0.12
435	0.13
436	0.12
437	0.11
438	0.11
439	0.12
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.16
444	0.15
445	0.16
446	0.16
447	0.19
448	0.22
449	0.26
450	0.32
451	0.36
452	0.43
453	0.43
454	0.45
455	0.43
456	0.43
457	0.38
458	0.31
459	0.24

W3XE44

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer