Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3WSG7

Protein Details
Accession W3WSG7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-245AASAGKTKRERERKQKAVVDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-105PRGGSRGGRGARQRGGRGGGY
233-237RERER
254-289RPRGGARGGRGGPRGGRGEGRGRGEGRGRGAPRGGR
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 9.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pfy:PFICI_11499  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVASKNLFDLLGNDIEDGEANKGPVKTVDKIAPRTTKRDVEPVAPSKPASANTGRRGPGGNEGAFRDRNAGHSANQRRTTDEAPRGGSRGGRGARQRGGRGGGYPRDRDDRHTKGLASGSEKQAAQSWGAQEGAAEQKDEQAGEEIAQTELKEAIAEDGEGIENPAEPENKNISYEDYLAQQAEKKLALGGSLNVRKANEGSKTDKKWSAAKELVKDESEDFIAASAGKTKRERERKQKAVVDIDHSFVEQDRPRGGARGGRGGPRGGRGEGRGRGEGRGRGAPRGGRSENPAVNPSDKNAFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.12
7 0.1
8 0.11
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.2
13 0.24
14 0.24
15 0.29
16 0.36
17 0.39
18 0.45
19 0.52
20 0.57
21 0.56
22 0.6
23 0.61
24 0.61
25 0.57
26 0.6
27 0.55
28 0.51
29 0.56
30 0.55
31 0.51
32 0.46
33 0.43
34 0.36
35 0.36
36 0.32
37 0.29
38 0.31
39 0.36
40 0.4
41 0.47
42 0.45
43 0.44
44 0.44
45 0.41
46 0.41
47 0.38
48 0.34
49 0.29
50 0.31
51 0.34
52 0.33
53 0.31
54 0.27
55 0.21
56 0.23
57 0.25
58 0.24
59 0.23
60 0.32
61 0.4
62 0.45
63 0.51
64 0.49
65 0.47
66 0.5
67 0.5
68 0.49
69 0.47
70 0.42
71 0.4
72 0.4
73 0.39
74 0.35
75 0.33
76 0.25
77 0.26
78 0.24
79 0.26
80 0.29
81 0.33
82 0.38
83 0.41
84 0.42
85 0.37
86 0.39
87 0.34
88 0.32
89 0.33
90 0.34
91 0.34
92 0.34
93 0.34
94 0.38
95 0.37
96 0.41
97 0.44
98 0.42
99 0.43
100 0.44
101 0.41
102 0.37
103 0.39
104 0.35
105 0.31
106 0.3
107 0.26
108 0.27
109 0.27
110 0.24
111 0.24
112 0.23
113 0.18
114 0.16
115 0.14
116 0.12
117 0.13
118 0.12
119 0.09
120 0.09
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.1
157 0.13
158 0.13
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.16
163 0.17
164 0.15
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.15
180 0.17
181 0.18
182 0.19
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.22
187 0.2
188 0.21
189 0.28
190 0.35
191 0.39
192 0.43
193 0.45
194 0.44
195 0.45
196 0.44
197 0.45
198 0.44
199 0.44
200 0.45
201 0.45
202 0.46
203 0.4
204 0.38
205 0.31
206 0.26
207 0.22
208 0.16
209 0.12
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.12
215 0.13
216 0.18
217 0.21
218 0.27
219 0.37
220 0.48
221 0.58
222 0.63
223 0.73
224 0.77
225 0.84
226 0.83
227 0.8
228 0.77
229 0.7
230 0.65
231 0.55
232 0.48
233 0.38
234 0.32
235 0.26
236 0.18
237 0.22
238 0.18
239 0.2
240 0.19
241 0.21
242 0.22
243 0.25
244 0.26
245 0.24
246 0.25
247 0.31
248 0.33
249 0.36
250 0.37
251 0.37
252 0.38
253 0.38
254 0.38
255 0.32
256 0.32
257 0.31
258 0.37
259 0.4
260 0.42
261 0.42
262 0.4
263 0.42
264 0.44
265 0.44
266 0.41
267 0.43
268 0.4
269 0.39
270 0.43
271 0.44
272 0.43
273 0.48
274 0.47
275 0.42
276 0.47
277 0.52
278 0.51
279 0.5
280 0.48
281 0.43
282 0.44
283 0.42
284 0.39
285 0.37
286 0.32
287 0.33
288 0.32