Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X426

Protein Details
Accession W3X426    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-50GPRDRDYDRRRDYDRRSDRRDDRRDDRRRDDRSHRHRSRSGSPBasic
240-259GGVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-109GGRGPRDRDYDRRRDYDRRSDRRDDRRDDRRRDDRSHRHRSRSGSPGRSDRRDRDRGGARDRGDAPSDRYRDRDRERGHGRDRDRDREHGDRDRDRDRDSDRRRR
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pfy:PFICI_08339  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MERRGGRGPRDRDYDRRRDYDRRSDRRDDRRDDRRRDDRSHRHRSRSGSPGRSDRRDRDRGGARDRGDAPSDRYRDRDRERGHGRDRDRDREHGDRDRDRDRDSDRRRRDDREQESRHDSRDAEDLRFGKETARDATSRKDLRSEHESPLPSRPKNDRNTPLSFRVGKNDEDVPRPSREDESRGRATSEDRGDAMDEDGEVDEEEEEVEVDDGLAAMQAMMGFGGFGTTKNTKVVGNNVGGVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.74
3 0.75
4 0.74
5 0.75
6 0.78
7 0.79
8 0.8
9 0.8
10 0.8
11 0.82
12 0.85
13 0.86
14 0.87
15 0.85
16 0.84
17 0.85
18 0.87
19 0.86
20 0.86
21 0.86
22 0.84
23 0.83
24 0.85
25 0.85
26 0.85
27 0.87
28 0.86
29 0.85
30 0.83
31 0.81
32 0.78
33 0.77
34 0.76
35 0.73
36 0.7
37 0.72
38 0.74
39 0.75
40 0.74
41 0.73
42 0.72
43 0.72
44 0.69
45 0.67
46 0.69
47 0.68
48 0.67
49 0.66
50 0.58
51 0.56
52 0.55
53 0.49
54 0.42
55 0.37
56 0.36
57 0.37
58 0.39
59 0.34
60 0.37
61 0.4
62 0.46
63 0.5
64 0.54
65 0.49
66 0.56
67 0.61
68 0.65
69 0.68
70 0.67
71 0.64
72 0.65
73 0.67
74 0.67
75 0.63
76 0.6
77 0.59
78 0.58
79 0.6
80 0.58
81 0.6
82 0.56
83 0.57
84 0.57
85 0.54
86 0.48
87 0.47
88 0.45
89 0.49
90 0.53
91 0.58
92 0.6
93 0.66
94 0.69
95 0.7
96 0.73
97 0.73
98 0.72
99 0.73
100 0.69
101 0.65
102 0.68
103 0.63
104 0.56
105 0.47
106 0.38
107 0.29
108 0.32
109 0.28
110 0.21
111 0.23
112 0.22
113 0.22
114 0.22
115 0.2
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.14
120 0.16
121 0.15
122 0.16
123 0.19
124 0.26
125 0.27
126 0.25
127 0.28
128 0.26
129 0.3
130 0.37
131 0.36
132 0.31
133 0.34
134 0.35
135 0.32
136 0.4
137 0.42
138 0.35
139 0.36
140 0.41
141 0.44
142 0.49
143 0.57
144 0.56
145 0.55
146 0.61
147 0.61
148 0.58
149 0.55
150 0.52
151 0.44
152 0.43
153 0.39
154 0.33
155 0.31
156 0.33
157 0.3
158 0.3
159 0.33
160 0.29
161 0.29
162 0.3
163 0.29
164 0.28
165 0.28
166 0.3
167 0.33
168 0.37
169 0.4
170 0.39
171 0.38
172 0.34
173 0.34
174 0.35
175 0.31
176 0.25
177 0.21
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.18
182 0.11
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.02
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.02
210 0.02
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.15
218 0.17
219 0.18
220 0.21
221 0.27
222 0.27
223 0.27
224 0.31
225 0.32
226 0.34
227 0.33
228 0.35
229 0.35
230 0.33
231 0.36
232 0.39
233 0.46
234 0.53
235 0.63
236 0.67
237 0.72
238 0.76
239 0.8
240 0.81
241 0.78
242 0.72
243 0.64
244 0.57
245 0.54
246 0.5
247 0.45
248 0.39