Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3WHL1

Protein Details
Accession W3WHL1    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-370NKQNGAKGGKKAKKAAKPKKTKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-33PKSKGGAATTKRKAA
40-65VVKKTKAVKADTPAKKATKASKPAKK
131-139KSKKAGKGG
238-238K
241-276PSNKIEANKLKKPLSEGEWAAKISKENNKRAQKAKK
344-370PAKANKQNGAKGGKKAKKAAKPKKTKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pfy:PFICI_15025  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELRSRRASSSSQKSTPKSKGGAATTKRKAADDASPVVVKKTKAVKADTPAKKATKASKPAKKVEEPAEPVAADDEHPFSDDDEQDNDQALALAGVSDSEDEAAVDESAAFKEGQDVGKAPVSSKAVEKSKKAGKGGKQDKAVVYIGRIPHGFYERQMHEYFGQFGDISRLRLSRNKKTGQSKHFAFIEFADESTAEYVVKSMNNYLLFGHLLKCRIVPNAQVHDDLFKGAGKRYKAIPSNKIEANKLKKPLSEGEWAAKISKENNKRAQKAKKLSALGYDFDAPQLKDAVAPTAGALEAAEEEAPKAIEAAPPAAESEAPAEEDVGDGIESLDGDKVVKQPAKANKQNGAKGGKKAKKAAKPKKTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.7
3 0.71
4 0.74
5 0.74
6 0.71
7 0.64
8 0.61
9 0.61
10 0.6
11 0.64
12 0.63
13 0.66
14 0.64
15 0.67
16 0.63
17 0.56
18 0.51
19 0.45
20 0.45
21 0.4
22 0.38
23 0.36
24 0.37
25 0.36
26 0.37
27 0.37
28 0.3
29 0.3
30 0.35
31 0.36
32 0.4
33 0.45
34 0.48
35 0.54
36 0.64
37 0.64
38 0.61
39 0.63
40 0.61
41 0.59
42 0.58
43 0.59
44 0.58
45 0.61
46 0.66
47 0.68
48 0.72
49 0.77
50 0.79
51 0.75
52 0.72
53 0.69
54 0.68
55 0.64
56 0.59
57 0.52
58 0.44
59 0.39
60 0.33
61 0.26
62 0.17
63 0.14
64 0.12
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.18
76 0.17
77 0.13
78 0.12
79 0.1
80 0.06
81 0.05
82 0.04
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.03
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.07
99 0.06
100 0.05
101 0.08
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.16
108 0.17
109 0.15
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.19
114 0.23
115 0.28
116 0.31
117 0.33
118 0.36
119 0.41
120 0.45
121 0.47
122 0.47
123 0.47
124 0.55
125 0.61
126 0.6
127 0.57
128 0.55
129 0.51
130 0.48
131 0.42
132 0.31
133 0.24
134 0.21
135 0.18
136 0.17
137 0.17
138 0.13
139 0.14
140 0.16
141 0.16
142 0.14
143 0.2
144 0.2
145 0.24
146 0.24
147 0.24
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.15
152 0.14
153 0.1
154 0.1
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.2
162 0.27
163 0.31
164 0.38
165 0.42
166 0.48
167 0.58
168 0.65
169 0.65
170 0.66
171 0.59
172 0.55
173 0.51
174 0.45
175 0.35
176 0.26
177 0.23
178 0.16
179 0.14
180 0.11
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.23
209 0.28
210 0.29
211 0.28
212 0.27
213 0.26
214 0.25
215 0.2
216 0.14
217 0.1
218 0.1
219 0.12
220 0.16
221 0.16
222 0.18
223 0.21
224 0.28
225 0.34
226 0.4
227 0.45
228 0.46
229 0.51
230 0.52
231 0.51
232 0.48
233 0.49
234 0.5
235 0.48
236 0.49
237 0.46
238 0.43
239 0.44
240 0.44
241 0.4
242 0.39
243 0.35
244 0.32
245 0.32
246 0.32
247 0.29
248 0.25
249 0.22
250 0.22
251 0.28
252 0.33
253 0.4
254 0.49
255 0.57
256 0.63
257 0.72
258 0.76
259 0.78
260 0.79
261 0.78
262 0.76
263 0.7
264 0.65
265 0.63
266 0.55
267 0.46
268 0.39
269 0.32
270 0.25
271 0.23
272 0.24
273 0.17
274 0.15
275 0.15
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.1
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.09
326 0.11
327 0.19
328 0.22
329 0.23
330 0.31
331 0.41
332 0.52
333 0.58
334 0.62
335 0.64
336 0.7
337 0.73
338 0.73
339 0.71
340 0.66
341 0.67
342 0.71
343 0.69
344 0.68
345 0.72
346 0.74
347 0.75
348 0.81
349 0.83
350 0.83