FuNGI

C4JV24

Protein Details

Accession

C4JV24

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
268-288	VIILKDKKKRVGERREKKTIG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
121-127	RERKKRE
135-139	RRKMK
273-285	DKKKRVGERREKK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, mito_nucl 11.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001623 DnaJ_domain IPR018253 DnaJ_domain_CS IPR034254 DNAJC17_RRM IPR036869 J_dom_sf IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	ure:UREG_04977 -
Pfam	View protein in Pfam PF00226 DnaJ
PROSITE	View protein in PROSITE PS00636 DNAJ_1 PS50076 DNAJ_2 PS50102 RRM
CDD	cd06257 DnaJ cd12429 RRM_DNAJC17

Amino Acid Sequences

MVKATHEVINFNYLSALRPISQQYTENVEKSTAWFLMAPSDDLKAHAASSHDFYALLDISPAAADTEIRRAYRRTALKYHPDKLQDPKPADIEKFHLLQIAYDVLSDPSIRQLYDNAREARERKKRENEMLEGVRRKMKEDLEARERGVKRPFGATGLGRPVDLDDAEAQLEEKIRRLAEDGRRRRQQKEELMRREVLEEEERREQEREERERAALKEREGQSSVGGTAVPEIERAVKIRWIREEQGLDLDKERLEKMFSAFGNVESVIILKDKKKRVGERREKKTIGTGIIVFSSIVGAHAAVEDSKKQPGSDWDTVESVFWASNKEPDLESYRAPSSASNPQPESPSKPRSAPKPRSFNFPGLNTPAATIGSGTGKAPSFASFSSAANVSSTTKANLGPNSPSFEEITLMRLKNAQRKRLEEQLKKEDEEAAAVEPENDIRKSVKPSDDRTITVPKDYFTAELPPPFAQPCL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.2
3	0.21
4	0.15
5	0.19
6	0.23
7	0.26
8	0.28
9	0.28
10	0.29
11	0.35
12	0.38
13	0.36
14	0.34
15	0.31
16	0.28
17	0.29
18	0.3
19	0.21
20	0.18
21	0.17
22	0.16
23	0.2
24	0.21
25	0.2
26	0.17
27	0.19
28	0.18
29	0.18
30	0.2
31	0.15
32	0.14
33	0.14
34	0.15
35	0.15
36	0.19
37	0.19
38	0.17
39	0.17
40	0.16
41	0.18
42	0.16
43	0.14
44	0.1
45	0.09
46	0.08
47	0.08
48	0.08
49	0.05
50	0.05
51	0.06
52	0.07
53	0.15
54	0.18
55	0.19
56	0.22
57	0.24
58	0.29
59	0.37
60	0.43
61	0.43
62	0.48
63	0.55
64	0.64
65	0.7
66	0.7
67	0.68
68	0.65
69	0.63
70	0.63
71	0.63
72	0.61
73	0.56
74	0.55
75	0.54
76	0.52
77	0.49
78	0.43
79	0.39
80	0.34
81	0.32
82	0.29
83	0.27
84	0.22
85	0.21
86	0.2
87	0.16
88	0.12
89	0.11
90	0.11
91	0.08
92	0.09
93	0.09
94	0.08
95	0.11
96	0.12
97	0.12
98	0.12
99	0.16
100	0.22
101	0.29
102	0.36
103	0.33
104	0.35
105	0.39
106	0.42
107	0.48
108	0.51
109	0.53
110	0.55
111	0.63
112	0.69
113	0.74
114	0.78
115	0.73
116	0.71
117	0.7
118	0.68
119	0.62
120	0.55
121	0.51
122	0.44
123	0.41
124	0.37
125	0.33
126	0.34
127	0.36
128	0.42
129	0.44
130	0.46
131	0.45
132	0.49
133	0.48
134	0.45
135	0.44
136	0.39
137	0.33
138	0.34
139	0.33
140	0.27
141	0.29
142	0.24
143	0.23
144	0.25
145	0.23
146	0.2
147	0.19
148	0.18
149	0.15
150	0.14
151	0.11
152	0.07
153	0.07
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.1
159	0.09
160	0.1
161	0.11
162	0.11
163	0.12
164	0.14
165	0.21
166	0.28
167	0.39
168	0.47
169	0.54
170	0.62
171	0.65
172	0.68
173	0.68
174	0.68
175	0.67
176	0.69
177	0.71
178	0.69
179	0.7
180	0.67
181	0.59
182	0.51
183	0.41
184	0.33
185	0.28
186	0.23
187	0.22
188	0.25
189	0.26
190	0.27
191	0.27
192	0.25
193	0.26
194	0.33
195	0.35
196	0.34
197	0.35
198	0.35
199	0.38
200	0.39
201	0.39
202	0.33
203	0.29
204	0.32
205	0.33
206	0.34
207	0.31
208	0.3
209	0.22
210	0.2
211	0.19
212	0.11
213	0.09
214	0.06
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.05
221	0.06
222	0.07
223	0.07
224	0.11
225	0.13
226	0.15
227	0.19
228	0.22
229	0.24
230	0.27
231	0.27
232	0.23
233	0.27
234	0.26
235	0.22
236	0.2
237	0.18
238	0.15
239	0.15
240	0.15
241	0.1
242	0.09
243	0.1
244	0.1
245	0.14
246	0.13
247	0.15
248	0.15
249	0.15
250	0.15
251	0.14
252	0.12
253	0.08
254	0.08
255	0.06
256	0.06
257	0.08
258	0.11
259	0.18
260	0.23
261	0.3
262	0.37
263	0.46
264	0.55
265	0.66
266	0.72
267	0.76
268	0.8
269	0.83
270	0.77
271	0.68
272	0.64
273	0.56
274	0.47
275	0.38
276	0.3
277	0.21
278	0.2
279	0.2
280	0.13
281	0.09
282	0.07
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.03
287	0.03
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.05
292	0.07
293	0.09
294	0.11
295	0.12
296	0.12
297	0.13
298	0.2
299	0.27
300	0.3
301	0.31
302	0.3
303	0.3
304	0.3
305	0.29
306	0.22
307	0.14
308	0.1
309	0.08
310	0.09
311	0.09
312	0.12
313	0.13
314	0.14
315	0.14
316	0.16
317	0.22
318	0.21
319	0.22
320	0.22
321	0.22
322	0.21
323	0.21
324	0.19
325	0.18
326	0.25
327	0.29
328	0.31
329	0.32
330	0.33
331	0.37
332	0.39
333	0.43
334	0.42
335	0.44
336	0.42
337	0.46
338	0.5
339	0.57
340	0.65
341	0.68
342	0.69
343	0.73
344	0.72
345	0.75
346	0.74
347	0.71
348	0.65
349	0.58
350	0.53
351	0.47
352	0.46
353	0.37
354	0.33
355	0.26
356	0.2
357	0.17
358	0.12
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.12
367	0.12
368	0.13
369	0.12
370	0.15
371	0.14
372	0.14
373	0.16
374	0.16
375	0.15
376	0.13
377	0.15
378	0.14
379	0.15
380	0.15
381	0.14
382	0.15
383	0.18
384	0.21
385	0.23
386	0.24
387	0.27
388	0.29
389	0.33
390	0.32
391	0.31
392	0.28
393	0.26
394	0.24
395	0.19
396	0.21
397	0.21
398	0.21
399	0.2
400	0.24
401	0.29
402	0.37
403	0.45
404	0.5
405	0.51
406	0.58
407	0.63
408	0.69
409	0.74
410	0.73
411	0.74
412	0.76
413	0.74
414	0.68
415	0.63
416	0.56
417	0.46
418	0.39
419	0.31
420	0.22
421	0.18
422	0.16
423	0.15
424	0.12
425	0.14
426	0.16
427	0.15
428	0.15
429	0.17
430	0.21
431	0.29
432	0.35
433	0.42
434	0.46
435	0.52
436	0.6
437	0.62
438	0.6
439	0.58
440	0.61
441	0.54
442	0.53
443	0.47
444	0.38
445	0.36
446	0.35
447	0.31
448	0.23
449	0.28
450	0.25
451	0.27
452	0.3
453	0.28
454	0.3

C4JV24

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer