Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JHK6

Protein Details
Accession C4JHK6    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-97PTPPAASKPKKAPKPATAKDAPRSSKKRPRDVADKGATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-90IPKLKLKFGGPKPAPAPTPPAASKPKKAPKPATAKDAPRSSKKRPRD
108-134VKRIKFSSKPLPSIRLKSKGEPPRRPR
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG ure:UREG_01369  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MSGKPPGKPSLKLTFSKPKVPQLPKQASPPSASPPPATTPGSAIPKLKLKFGGPKPAPAPTPPAASKPKKAPKPATAKDAPRSSKKRPRDVADKGATSVTASTPAPAVKRIKFSSKPLPSIRLKSKGEPPRRPRGVGYDSGASDTEIDPALEEEFILRMPPGEDCDYVRQAVEEKRFGPRSQGGADISFKALTRDGRRAIVTVRGRMYAASLVDLPCVIEAMKSWDRRAWYKSADICQMLLVLGPVKSEDEAKTYPLPKDAEEGPPEFEVMDYNQYMREESGYQEEYDDEQDAEGEADETAYVHPGAQDEMAGLFEDDLAAEMEAALAAHAEASSMPTSAIAEENQAIGGVVEAEPETEAEMGTPKPATGGETSGDEDESEESSPEDGNEDMDEDALEQQRQLQQQREEIAELEALVRAETLKWEQMPNPILKAKVGRRVQSLKQELELKKVSVGEGNADD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.63
3 0.68
4 0.66
5 0.66
6 0.69
7 0.73
8 0.73
9 0.74
10 0.78
11 0.73
12 0.76
13 0.74
14 0.67
15 0.63
16 0.58
17 0.54
18 0.52
19 0.5
20 0.43
21 0.39
22 0.41
23 0.41
24 0.4
25 0.34
26 0.31
27 0.35
28 0.39
29 0.39
30 0.36
31 0.35
32 0.41
33 0.41
34 0.42
35 0.39
36 0.37
37 0.44
38 0.48
39 0.55
40 0.49
41 0.55
42 0.54
43 0.56
44 0.53
45 0.45
46 0.45
47 0.37
48 0.42
49 0.37
50 0.41
51 0.46
52 0.5
53 0.55
54 0.58
55 0.65
56 0.67
57 0.75
58 0.76
59 0.76
60 0.81
61 0.79
62 0.78
63 0.76
64 0.75
65 0.73
66 0.74
67 0.7
68 0.69
69 0.71
70 0.73
71 0.75
72 0.77
73 0.79
74 0.78
75 0.8
76 0.8
77 0.81
78 0.81
79 0.78
80 0.7
81 0.6
82 0.52
83 0.44
84 0.34
85 0.27
86 0.17
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.14
93 0.19
94 0.24
95 0.25
96 0.32
97 0.35
98 0.42
99 0.45
100 0.51
101 0.56
102 0.57
103 0.62
104 0.58
105 0.63
106 0.6
107 0.64
108 0.65
109 0.63
110 0.59
111 0.57
112 0.63
113 0.65
114 0.69
115 0.71
116 0.71
117 0.73
118 0.75
119 0.72
120 0.64
121 0.63
122 0.58
123 0.51
124 0.47
125 0.39
126 0.35
127 0.33
128 0.31
129 0.22
130 0.18
131 0.14
132 0.12
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.09
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.18
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.15
157 0.17
158 0.21
159 0.23
160 0.21
161 0.21
162 0.28
163 0.31
164 0.3
165 0.32
166 0.3
167 0.3
168 0.29
169 0.3
170 0.24
171 0.24
172 0.25
173 0.2
174 0.18
175 0.15
176 0.13
177 0.11
178 0.12
179 0.15
180 0.17
181 0.21
182 0.22
183 0.24
184 0.24
185 0.25
186 0.24
187 0.28
188 0.27
189 0.25
190 0.25
191 0.23
192 0.23
193 0.22
194 0.21
195 0.15
196 0.12
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.1
209 0.16
210 0.17
211 0.18
212 0.19
213 0.22
214 0.25
215 0.28
216 0.25
217 0.23
218 0.27
219 0.3
220 0.31
221 0.32
222 0.29
223 0.26
224 0.21
225 0.19
226 0.14
227 0.1
228 0.07
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.07
236 0.07
237 0.1
238 0.11
239 0.13
240 0.16
241 0.19
242 0.19
243 0.21
244 0.22
245 0.18
246 0.21
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.22
251 0.2
252 0.19
253 0.19
254 0.15
255 0.13
256 0.1
257 0.08
258 0.1
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.08
267 0.09
268 0.14
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.14
273 0.13
274 0.14
275 0.13
276 0.09
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.02
318 0.03
319 0.03
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.09
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.1
357 0.12
358 0.12
359 0.14
360 0.16
361 0.15
362 0.15
363 0.13
364 0.12
365 0.11
366 0.11
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.11
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.15
387 0.2
388 0.26
389 0.3
390 0.35
391 0.37
392 0.42
393 0.46
394 0.44
395 0.41
396 0.36
397 0.31
398 0.24
399 0.2
400 0.15
401 0.13
402 0.1
403 0.09
404 0.08
405 0.07
406 0.08
407 0.11
408 0.13
409 0.16
410 0.19
411 0.22
412 0.24
413 0.32
414 0.37
415 0.37
416 0.39
417 0.39
418 0.37
419 0.38
420 0.44
421 0.44
422 0.48
423 0.52
424 0.51
425 0.57
426 0.63
427 0.67
428 0.69
429 0.69
430 0.62
431 0.61
432 0.65
433 0.58
434 0.59
435 0.56
436 0.46
437 0.41
438 0.39
439 0.35
440 0.3
441 0.29