FuNGI

W3WWB0

Protein Details

Accession

W3WWB0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
40-59	SSNMAKTKKVSKKEAPSAAS	Hydrophilic
82-118	DAHREFKKHRADKGWKSEADKKKKKDQKKGHHSLVSV	Basic
382-403	PDPTTFKHNNRGKNGNKRPQNE	Hydrophilic
436-464	LIVTRGKGFTKEKNKKKRGAYRGGPLDIN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
87-111	FKKHRADKGWKSEADKKKKKDQKKG
442-455	KGFTKEKNKKKRGA

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
KEGG	pfy:PFICI_10156 -
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MPANSQSTSVNSTSGPPAWLFSNNSNSTSTTAAASATNSSSNMAKTKKVSKKEAPSAASAGAPPAQLMDLVEDFLSGSGFADAHREFKKHRADKGWKSEADKKKKKDQKKGHHSLVSVFQTWETFSNKDATPAVAKKEILEVTKVSSSSESDSSSDSDSDSDSDSDSGKDVDMADAPAANDDSDSSSSSSSSSSSSDSSDSDSDSDDEAAKAPAKPATTNRLKRKAKSDSESSSSSSESDSDSSSDSEDEKPKVKKVKTASSDSSSSSSDSSDSSDSSDSDSSDDEAAKVKTEAAQDSSDSSDSSDSDSSSDSDSDSESEAEVAAKVPLPESDSDSSSSSDSDSDAEDVKKEVKKESAANGTGSDTSATLGKASPEFAPLPPDPTTFKHNNRGKNGNKRPQNEPFSRIKKDVYVHNELSSNAYIQDGYGQKAHEDLIVTRGKGFTKEKNKKKRGAYRGGPLDINRSQSFKFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.23
3	0.19
4	0.2
5	0.21
6	0.24
7	0.26
8	0.27
9	0.35
10	0.36
11	0.38
12	0.38
13	0.37
14	0.34
15	0.32
16	0.27
17	0.18
18	0.16
19	0.15
20	0.14
21	0.14
22	0.14
23	0.13
24	0.14
25	0.13
26	0.14
27	0.15
28	0.17
29	0.22
30	0.23
31	0.26
32	0.31
33	0.42
34	0.49
35	0.56
36	0.63
37	0.66
38	0.74
39	0.79
40	0.81
41	0.74
42	0.68
43	0.63
44	0.54
45	0.45
46	0.35
47	0.27
48	0.2
49	0.17
50	0.13
51	0.11
52	0.09
53	0.09
54	0.09
55	0.1
56	0.08
57	0.09
58	0.09
59	0.08
60	0.08
61	0.08
62	0.08
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.05
68	0.1
69	0.11
70	0.16
71	0.19
72	0.21
73	0.23
74	0.32
75	0.43
76	0.44
77	0.51
78	0.57
79	0.64
80	0.72
81	0.8
82	0.8
83	0.73
84	0.74
85	0.76
86	0.76
87	0.77
88	0.76
89	0.73
90	0.75
91	0.81
92	0.84
93	0.85
94	0.86
95	0.86
96	0.88
97	0.91
98	0.9
99	0.85
100	0.76
101	0.68
102	0.65
103	0.57
104	0.47
105	0.37
106	0.28
107	0.23
108	0.23
109	0.23
110	0.18
111	0.15
112	0.14
113	0.19
114	0.18
115	0.2
116	0.2
117	0.18
118	0.21
119	0.23
120	0.26
121	0.25
122	0.25
123	0.23
124	0.27
125	0.27
126	0.22
127	0.22
128	0.19
129	0.18
130	0.21
131	0.2
132	0.16
133	0.15
134	0.15
135	0.16
136	0.17
137	0.15
138	0.14
139	0.15
140	0.15
141	0.16
142	0.15
143	0.12
144	0.11
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.08
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.05
168	0.05
169	0.07
170	0.07
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.1
182	0.11
183	0.11
184	0.11
185	0.13
186	0.12
187	0.12
188	0.11
189	0.11
190	0.11
191	0.1
192	0.1
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.12
203	0.15
204	0.22
205	0.31
206	0.4
207	0.47
208	0.56
209	0.6
210	0.62
211	0.67
212	0.68
213	0.65
214	0.62
215	0.59
216	0.53
217	0.53
218	0.51
219	0.44
220	0.35
221	0.29
222	0.24
223	0.17
224	0.14
225	0.1
226	0.1
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.09
234	0.12
235	0.14
236	0.15
237	0.2
238	0.22
239	0.26
240	0.34
241	0.33
242	0.36
243	0.4
244	0.47
245	0.47
246	0.52
247	0.51
248	0.47
249	0.48
250	0.43
251	0.39
252	0.3
253	0.25
254	0.19
255	0.15
256	0.12
257	0.1
258	0.11
259	0.09
260	0.09
261	0.1
262	0.1
263	0.1
264	0.11
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.08
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.11
279	0.13
280	0.14
281	0.14
282	0.14
283	0.14
284	0.15
285	0.16
286	0.14
287	0.12
288	0.11
289	0.09
290	0.09
291	0.11
292	0.1
293	0.08
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.09
317	0.1
318	0.14
319	0.15
320	0.16
321	0.18
322	0.19
323	0.19
324	0.18
325	0.17
326	0.13
327	0.11
328	0.1
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.12
336	0.17
337	0.19
338	0.2
339	0.22
340	0.24
341	0.27
342	0.31
343	0.36
344	0.38
345	0.38
346	0.37
347	0.35
348	0.32
349	0.29
350	0.25
351	0.19
352	0.11
353	0.09
354	0.1
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.09
359	0.1
360	0.11
361	0.11
362	0.13
363	0.15
364	0.15
365	0.2
366	0.19
367	0.22
368	0.22
369	0.24
370	0.24
371	0.25
372	0.33
373	0.35
374	0.41
375	0.48
376	0.53
377	0.6
378	0.64
379	0.71
380	0.73
381	0.76
382	0.81
383	0.8
384	0.83
385	0.79
386	0.79
387	0.79
388	0.79
389	0.73
390	0.69
391	0.69
392	0.69
393	0.7
394	0.65
395	0.57
396	0.54
397	0.52
398	0.55
399	0.52
400	0.52
401	0.48
402	0.48
403	0.47
404	0.41
405	0.41
406	0.33
407	0.26
408	0.18
409	0.16
410	0.13
411	0.12
412	0.18
413	0.15
414	0.17
415	0.18
416	0.18
417	0.18
418	0.19
419	0.2
420	0.15
421	0.15
422	0.14
423	0.19
424	0.23
425	0.23
426	0.23
427	0.25
428	0.24
429	0.29
430	0.34
431	0.37
432	0.44
433	0.55
434	0.64
435	0.73
436	0.81
437	0.84
438	0.89
439	0.9
440	0.89
441	0.89
442	0.87
443	0.86
444	0.86
445	0.81
446	0.74
447	0.65
448	0.62
449	0.54
450	0.53
451	0.44
452	0.39
453	0.35

W3WWB0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer