Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W3X261

Protein Details
Accession W3X261    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-78AGGEKPKRGRGRPPKNGVSKVVKVPSGRPRGRPPKDPNAPPKPKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-130GGEKPKRGRGRPPKNGVSKVVKVPSGRPRGRPPKDPNAPPKPKPAAATTAATGTGRRGRPRKSDAAATPKKSATPKKAASATKPAGSGRRGRPRKS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG pfy:PFICI_07638  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MAPSRTRARPTGREQRATAKKDEPITAAESGVAAGGEKPKRGRGRPPKNGVSKVVKVPSGRPRGRPPKDPNAPPKPKPAAATTAATGTGRRGRPRKSDAAATPKKSATPKKAASATKPAGSGRRGRPRKSEPIEEPEDSGAEEIVEGAESPEEDGGESLKPMLRLQSQSLRRDWRRDSSPQRDSSHPLDAGIDTGAEADVEVGDALDGEEVPAAEEEEDDDEDAVAEDDDDAEVMLKSMIRPLAAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.74
3 0.75
4 0.7
5 0.66
6 0.61
7 0.57
8 0.55
9 0.55
10 0.46
11 0.39
12 0.38
13 0.33
14 0.27
15 0.22
16 0.17
17 0.14
18 0.12
19 0.09
20 0.05
21 0.06
22 0.13
23 0.14
24 0.18
25 0.2
26 0.28
27 0.37
28 0.41
29 0.51
30 0.56
31 0.65
32 0.73
33 0.8
34 0.81
35 0.82
36 0.82
37 0.78
38 0.75
39 0.68
40 0.64
41 0.59
42 0.53
43 0.45
44 0.48
45 0.5
46 0.53
47 0.52
48 0.51
49 0.58
50 0.66
51 0.7
52 0.73
53 0.72
54 0.72
55 0.78
56 0.8
57 0.8
58 0.8
59 0.82
60 0.75
61 0.76
62 0.7
63 0.64
64 0.58
65 0.51
66 0.45
67 0.4
68 0.38
69 0.29
70 0.24
71 0.22
72 0.2
73 0.17
74 0.14
75 0.18
76 0.19
77 0.25
78 0.31
79 0.36
80 0.43
81 0.5
82 0.54
83 0.5
84 0.54
85 0.53
86 0.57
87 0.59
88 0.54
89 0.51
90 0.44
91 0.44
92 0.44
93 0.45
94 0.41
95 0.43
96 0.42
97 0.44
98 0.51
99 0.5
100 0.47
101 0.49
102 0.44
103 0.37
104 0.36
105 0.32
106 0.28
107 0.29
108 0.32
109 0.32
110 0.4
111 0.44
112 0.45
113 0.53
114 0.56
115 0.64
116 0.62
117 0.61
118 0.55
119 0.56
120 0.58
121 0.5
122 0.44
123 0.34
124 0.29
125 0.22
126 0.18
127 0.1
128 0.05
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.11
150 0.13
151 0.15
152 0.19
153 0.28
154 0.33
155 0.37
156 0.42
157 0.49
158 0.5
159 0.55
160 0.55
161 0.54
162 0.53
163 0.59
164 0.64
165 0.64
166 0.68
167 0.69
168 0.68
169 0.64
170 0.63
171 0.58
172 0.54
173 0.44
174 0.36
175 0.3
176 0.26
177 0.23
178 0.17
179 0.13
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.11
226 0.12