Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JDE3

Protein Details
Accession C4JDE3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
355-374STAFPKKKAKSRKPAPAPGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-93RR
315-317KRK
340-351LRKPRKVAVKEE
355-371STAFPKKKAKSRKPAPA
Subcellular Location(s) mito 23, nucl 1, cyto 1, plas 1, cyto_nucl 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR004036  Endonuclease-III-like_CS2  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR000445  HhH_motif  
IPR030841  NTH1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000703  F:oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG ure:UREG_00309  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00633  HHH  
PF00730  HhH-GPD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01155  ENDONUCLEASE_III_2  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MRSPSLNSAATSTFNGLSGRGSLSNWWMADSVELSVYAGVQCSVVKRVRQISPVVKEMLGWQMGVLKEMVGGERGECPGRLSGRLPSGEGRRRRWGPDGGGLRWARFGIRLVRAGGVWWCLQRPSWSCFCVSCLIKWSKSASSRRPESVLFVCPEALWAWRTWPGGGWSWSPCGGAWGGASRLKSFSGRQSTQHMHACLSLVPRLRLPTGFVCVMGASRLSKRMTNPVDSLSTRRVTRRTAASSTTSSYFDSSRGTRRTLATHTAIVKEEVVSDVEARNGNGSEDDDSSILSEANTADIEDLLKPEPSPQSTSRKRKRSSAVKTEDGVATNGAPSPKTQLRKPRKVAVKEESAQSTAFPKKKAKSRKPAPAPGSIPPPPNWEEMYSLIKDMRLKNPTAPVDTMGCAELYWRNSTEQERRFHILVALMLSSQTKDTVTAVAMHRLHTELGPEHDDRDANTPDTKAVAQWDTSTHSTARSTLTIANILRVPAPRLNQLIHSVGFHNLKTKYLQTTASLLQAHHDSDIPRTAADLMSLPGVGPKMAYLCMSSAWGVDDGIGVDVHVHRITNLWGWVRTKTPEETRVVLEAWLPRDKWREINWLLVGLGQTVCLPVGRRCGECALAGTGLCKGEIKGKAAVSVKRESKVKMEIKMEDEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.16
4 0.16
5 0.15
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.16
10 0.19
11 0.23
12 0.22
13 0.22
14 0.19
15 0.18
16 0.19
17 0.17
18 0.15
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.1
30 0.16
31 0.2
32 0.23
33 0.29
34 0.37
35 0.41
36 0.45
37 0.51
38 0.54
39 0.55
40 0.57
41 0.53
42 0.45
43 0.4
44 0.38
45 0.36
46 0.27
47 0.2
48 0.16
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.16
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.12
61 0.14
62 0.15
63 0.14
64 0.16
65 0.19
66 0.21
67 0.23
68 0.23
69 0.26
70 0.31
71 0.32
72 0.32
73 0.33
74 0.41
75 0.47
76 0.53
77 0.53
78 0.57
79 0.6
80 0.63
81 0.63
82 0.61
83 0.57
84 0.58
85 0.58
86 0.5
87 0.54
88 0.5
89 0.44
90 0.38
91 0.33
92 0.25
93 0.2
94 0.22
95 0.21
96 0.25
97 0.27
98 0.27
99 0.28
100 0.27
101 0.27
102 0.24
103 0.2
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.17
109 0.23
110 0.25
111 0.29
112 0.32
113 0.32
114 0.33
115 0.32
116 0.33
117 0.34
118 0.31
119 0.27
120 0.3
121 0.34
122 0.34
123 0.36
124 0.37
125 0.37
126 0.43
127 0.51
128 0.51
129 0.55
130 0.6
131 0.6
132 0.59
133 0.53
134 0.5
135 0.45
136 0.41
137 0.33
138 0.28
139 0.25
140 0.22
141 0.22
142 0.17
143 0.15
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.17
151 0.18
152 0.21
153 0.23
154 0.24
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.22
159 0.19
160 0.16
161 0.14
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.17
172 0.18
173 0.24
174 0.3
175 0.32
176 0.34
177 0.4
178 0.43
179 0.46
180 0.5
181 0.42
182 0.34
183 0.32
184 0.31
185 0.25
186 0.23
187 0.21
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.2
192 0.21
193 0.19
194 0.2
195 0.19
196 0.2
197 0.19
198 0.18
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.09
206 0.13
207 0.14
208 0.17
209 0.19
210 0.28
211 0.3
212 0.33
213 0.33
214 0.31
215 0.34
216 0.33
217 0.34
218 0.29
219 0.29
220 0.27
221 0.29
222 0.3
223 0.29
224 0.33
225 0.36
226 0.37
227 0.37
228 0.38
229 0.38
230 0.37
231 0.36
232 0.33
233 0.27
234 0.22
235 0.2
236 0.17
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.21
241 0.23
242 0.24
243 0.26
244 0.27
245 0.3
246 0.31
247 0.33
248 0.28
249 0.29
250 0.29
251 0.27
252 0.26
253 0.23
254 0.2
255 0.15
256 0.13
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.09
293 0.11
294 0.11
295 0.16
296 0.19
297 0.29
298 0.39
299 0.5
300 0.56
301 0.64
302 0.65
303 0.69
304 0.74
305 0.74
306 0.74
307 0.74
308 0.71
309 0.65
310 0.62
311 0.57
312 0.48
313 0.38
314 0.29
315 0.18
316 0.12
317 0.09
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.11
323 0.15
324 0.19
325 0.23
326 0.32
327 0.43
328 0.53
329 0.57
330 0.61
331 0.65
332 0.68
333 0.71
334 0.66
335 0.62
336 0.55
337 0.52
338 0.45
339 0.37
340 0.31
341 0.24
342 0.23
343 0.22
344 0.23
345 0.24
346 0.28
347 0.33
348 0.42
349 0.52
350 0.58
351 0.62
352 0.69
353 0.77
354 0.8
355 0.83
356 0.79
357 0.75
358 0.68
359 0.6
360 0.57
361 0.49
362 0.43
363 0.34
364 0.35
365 0.29
366 0.29
367 0.27
368 0.21
369 0.2
370 0.21
371 0.23
372 0.19
373 0.18
374 0.16
375 0.16
376 0.19
377 0.2
378 0.24
379 0.24
380 0.25
381 0.27
382 0.34
383 0.34
384 0.33
385 0.3
386 0.25
387 0.23
388 0.23
389 0.2
390 0.14
391 0.12
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.13
399 0.16
400 0.22
401 0.29
402 0.33
403 0.35
404 0.38
405 0.41
406 0.4
407 0.38
408 0.34
409 0.26
410 0.2
411 0.17
412 0.13
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.12
425 0.13
426 0.19
427 0.19
428 0.19
429 0.19
430 0.19
431 0.19
432 0.15
433 0.16
434 0.11
435 0.14
436 0.17
437 0.16
438 0.17
439 0.17
440 0.17
441 0.16
442 0.21
443 0.2
444 0.18
445 0.19
446 0.19
447 0.18
448 0.19
449 0.18
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.17
457 0.19
458 0.2
459 0.17
460 0.17
461 0.17
462 0.18
463 0.19
464 0.15
465 0.15
466 0.15
467 0.16
468 0.19
469 0.19
470 0.19
471 0.18
472 0.18
473 0.18
474 0.17
475 0.2
476 0.19
477 0.21
478 0.23
479 0.25
480 0.25
481 0.25
482 0.28
483 0.27
484 0.24
485 0.23
486 0.2
487 0.22
488 0.23
489 0.21
490 0.23
491 0.21
492 0.23
493 0.24
494 0.26
495 0.25
496 0.26
497 0.28
498 0.24
499 0.27
500 0.27
501 0.29
502 0.27
503 0.22
504 0.22
505 0.22
506 0.2
507 0.17
508 0.18
509 0.14
510 0.16
511 0.2
512 0.18
513 0.16
514 0.16
515 0.16
516 0.14
517 0.14
518 0.12
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.08
523 0.08
524 0.09
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.08
532 0.09
533 0.1
534 0.11
535 0.1
536 0.09
537 0.1
538 0.1
539 0.09
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.08
544 0.07
545 0.05
546 0.07
547 0.07
548 0.1
549 0.1
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.13
554 0.15
555 0.19
556 0.2
557 0.23
558 0.26
559 0.28
560 0.31
561 0.32
562 0.33
563 0.35
564 0.39
565 0.42
566 0.45
567 0.45
568 0.44
569 0.43
570 0.39
571 0.33
572 0.29
573 0.26
574 0.26
575 0.28
576 0.27
577 0.29
578 0.35
579 0.37
580 0.41
581 0.42
582 0.47
583 0.45
584 0.51
585 0.47
586 0.43
587 0.4
588 0.35
589 0.29
590 0.21
591 0.19
592 0.11
593 0.1
594 0.09
595 0.09
596 0.09
597 0.11
598 0.13
599 0.22
600 0.25
601 0.26
602 0.29
603 0.32
604 0.33
605 0.31
606 0.31
607 0.25
608 0.22
609 0.21
610 0.19
611 0.18
612 0.17
613 0.16
614 0.14
615 0.12
616 0.18
617 0.22
618 0.25
619 0.28
620 0.28
621 0.34
622 0.4
623 0.44
624 0.41
625 0.46
626 0.48
627 0.49
628 0.53
629 0.49
630 0.49
631 0.55
632 0.56
633 0.55
634 0.56
635 0.55