Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JW47

Protein Details
Accession C4JW47    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-201LSFWNRKKLLHRFANARRRHPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9, plas 7, cyto_mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR004589  DNA_helicase_ATP-dep_RecQ  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
KEGG ure:UREG_06789  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51375  PPR  
CDD cd17920  DEXHc_RecQ  
Amino Acid Sequences MAGYCKKHSPCARRLFSNSSDSFPTDSPPPQLPIDSTNVQQTSQPPSPPTISEPPGILGLRRSEALIYHALRSELPPEVPINPRAYLAARRNQHPNYRDLFTFFHNVFGYVEGTKGLMVILSNPNADMQIFGGGGLRDSIEDNLEAPGVRRLISLLQDDSIPTKVVFRAYRCLPSPRVSYLSFWNRKKLLHRFANARRRHPNDSLRYLSVIEDMCSAGLPLKMSLWTAAVTLAAKSSDKVSRKSFQSALGLWRRMEYEGKAESNSVAFNILFDLAIKAGQFNVAEKIVLEMHNRGVDFSRFGKVARIFYWGLRGDANGVRQAYHDFVNAGQIVDTTVLNCVMSALIRTGHIGLAEKMYDNMKNAHLKLIESPDDSHAALPPLPSDNYLAYRQANKYRSRIYSMASYLHDKLPKHHRAIQAAVPLIPDSKTFHIFLSYHAFVSGDLEKFLTFLQDLENTFKLPPQGMVYLFLFEGFARHGATKDSHWNYRRLTCAWEAFLRDLKVSEEEDFPRVRERISKLEWKAPLSPDQLESLNTLDESDQEDSTHLDYDLDEDDPLGVKEVLTLRAEDFDIIGDEDPEEGEDHFNARGVFLGRKLVIAILQAHFACGGPKAIVPPSAQYYGDGMKHQRVDVDFTLRRVFGKKAFRPLQREVIQAVIEGHDVFLQAATSFGKSICYQLPAVISHGITIVVSPLLSLMVDQVSTLEANGIPVATINSTTPQSKRKAITADILSGHPIIRLLYVTPEYCQTEAFRKHVKQVHSQGELNRIAIDEAHCVSEWGHDFRPAYKALSWFRRELQNPTVPITALTATATKRVRDDIISLLGLDPTTLRKFCTSSARPNIHYEVRYIPEHSYDSEEPVIDRTHDLLSWLKAIHDRRIARFAAQTQGPNDQVKPQPPPMSGIIYVPVRAMSSDLAERLSASISPKIKAVAYHAGLPASERASIQTVWTAPFKTRSKDAGKSEHPAFYIVVATNAFGMGIDNPQVRFVVHWTPPRSFEGFVQESGRAGRDGHAAVSLVYYSPEERERVIERILRDCNAGMLDATMISAGLPMVDDTAADHKRAYDNLSEEMKNKFRNRHTVLESFEKVVRYCEDTARCKHEIIREFSGDLELETSEPSGQRFPGEVSGTTGPGCDYACDFCKEGPKALDRKKQSIAYGLHRYPAQIGNESGIHARTYEDGNRLSWLRVLANMYGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.76
3 0.72
4 0.72
5 0.64
6 0.57
7 0.53
8 0.47
9 0.43
10 0.36
11 0.34
12 0.29
13 0.3
14 0.3
15 0.31
16 0.32
17 0.31
18 0.32
19 0.31
20 0.3
21 0.34
22 0.32
23 0.3
24 0.34
25 0.33
26 0.32
27 0.33
28 0.32
29 0.34
30 0.36
31 0.39
32 0.33
33 0.37
34 0.39
35 0.38
36 0.42
37 0.41
38 0.39
39 0.37
40 0.36
41 0.33
42 0.34
43 0.33
44 0.27
45 0.22
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.21
50 0.18
51 0.18
52 0.21
53 0.24
54 0.22
55 0.23
56 0.24
57 0.24
58 0.24
59 0.25
60 0.24
61 0.2
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.23
66 0.27
67 0.3
68 0.31
69 0.28
70 0.28
71 0.28
72 0.3
73 0.34
74 0.37
75 0.41
76 0.43
77 0.47
78 0.56
79 0.61
80 0.67
81 0.61
82 0.61
83 0.58
84 0.57
85 0.53
86 0.48
87 0.43
88 0.38
89 0.4
90 0.33
91 0.32
92 0.28
93 0.28
94 0.25
95 0.24
96 0.22
97 0.15
98 0.15
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.07
104 0.05
105 0.05
106 0.09
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.12
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.15
140 0.19
141 0.22
142 0.19
143 0.19
144 0.19
145 0.2
146 0.2
147 0.18
148 0.16
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.2
153 0.24
154 0.25
155 0.32
156 0.35
157 0.42
158 0.43
159 0.48
160 0.46
161 0.48
162 0.49
163 0.46
164 0.46
165 0.41
166 0.4
167 0.43
168 0.5
169 0.53
170 0.52
171 0.55
172 0.53
173 0.56
174 0.63
175 0.64
176 0.63
177 0.63
178 0.67
179 0.69
180 0.77
181 0.82
182 0.8
183 0.79
184 0.79
185 0.76
186 0.77
187 0.75
188 0.75
189 0.74
190 0.75
191 0.71
192 0.62
193 0.57
194 0.5
195 0.42
196 0.36
197 0.27
198 0.19
199 0.15
200 0.13
201 0.12
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.12
224 0.19
225 0.22
226 0.28
227 0.33
228 0.39
229 0.43
230 0.49
231 0.47
232 0.45
233 0.45
234 0.43
235 0.45
236 0.46
237 0.45
238 0.39
239 0.38
240 0.34
241 0.32
242 0.32
243 0.24
244 0.23
245 0.24
246 0.25
247 0.25
248 0.24
249 0.22
250 0.2
251 0.19
252 0.13
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.13
278 0.15
279 0.17
280 0.17
281 0.16
282 0.17
283 0.16
284 0.18
285 0.18
286 0.19
287 0.17
288 0.18
289 0.24
290 0.25
291 0.27
292 0.24
293 0.27
294 0.25
295 0.26
296 0.32
297 0.26
298 0.24
299 0.21
300 0.2
301 0.19
302 0.2
303 0.22
304 0.18
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.19
309 0.17
310 0.15
311 0.14
312 0.11
313 0.11
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.14
348 0.17
349 0.22
350 0.22
351 0.25
352 0.24
353 0.23
354 0.25
355 0.28
356 0.26
357 0.23
358 0.24
359 0.21
360 0.22
361 0.22
362 0.19
363 0.15
364 0.14
365 0.13
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.15
374 0.17
375 0.18
376 0.18
377 0.23
378 0.26
379 0.32
380 0.37
381 0.38
382 0.42
383 0.47
384 0.47
385 0.48
386 0.45
387 0.4
388 0.39
389 0.37
390 0.34
391 0.29
392 0.3
393 0.26
394 0.29
395 0.3
396 0.25
397 0.29
398 0.36
399 0.41
400 0.43
401 0.48
402 0.49
403 0.5
404 0.53
405 0.51
406 0.45
407 0.39
408 0.34
409 0.27
410 0.22
411 0.19
412 0.15
413 0.12
414 0.1
415 0.12
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.17
420 0.17
421 0.19
422 0.23
423 0.21
424 0.19
425 0.18
426 0.18
427 0.14
428 0.17
429 0.18
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.08
437 0.05
438 0.05
439 0.07
440 0.09
441 0.1
442 0.13
443 0.14
444 0.14
445 0.14
446 0.15
447 0.14
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.12
452 0.12
453 0.14
454 0.13
455 0.13
456 0.13
457 0.12
458 0.1
459 0.07
460 0.08
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.09
467 0.1
468 0.12
469 0.21
470 0.24
471 0.31
472 0.33
473 0.38
474 0.39
475 0.42
476 0.43
477 0.35
478 0.35
479 0.31
480 0.3
481 0.27
482 0.26
483 0.23
484 0.22
485 0.23
486 0.2
487 0.17
488 0.16
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.14
493 0.13
494 0.14
495 0.17
496 0.17
497 0.16
498 0.18
499 0.17
500 0.16
501 0.19
502 0.22
503 0.26
504 0.3
505 0.38
506 0.36
507 0.42
508 0.44
509 0.41
510 0.4
511 0.36
512 0.36
513 0.3
514 0.29
515 0.23
516 0.23
517 0.21
518 0.18
519 0.17
520 0.13
521 0.1
522 0.09
523 0.08
524 0.06
525 0.07
526 0.08
527 0.09
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.1
533 0.1
534 0.08
535 0.06
536 0.06
537 0.07
538 0.08
539 0.07
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.04
548 0.06
549 0.07
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.08
557 0.07
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.07
577 0.08
578 0.09
579 0.08
580 0.11
581 0.09
582 0.1
583 0.1
584 0.08
585 0.07
586 0.08
587 0.09
588 0.07
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.07
595 0.06
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.07
600 0.07
601 0.09
602 0.09
603 0.1
604 0.13
605 0.14
606 0.14
607 0.13
608 0.14
609 0.14
610 0.15
611 0.15
612 0.13
613 0.15
614 0.16
615 0.15
616 0.16
617 0.14
618 0.17
619 0.17
620 0.23
621 0.21
622 0.21
623 0.23
624 0.21
625 0.21
626 0.19
627 0.2
628 0.2
629 0.28
630 0.3
631 0.39
632 0.46
633 0.51
634 0.55
635 0.57
636 0.59
637 0.52
638 0.5
639 0.41
640 0.35
641 0.3
642 0.24
643 0.2
644 0.11
645 0.09
646 0.07
647 0.07
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.04
652 0.04
653 0.03
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.05
658 0.05
659 0.07
660 0.07
661 0.1
662 0.1
663 0.12
664 0.12
665 0.12
666 0.14
667 0.13
668 0.14
669 0.13
670 0.11
671 0.1
672 0.1
673 0.08
674 0.07
675 0.06
676 0.05
677 0.04
678 0.03
679 0.03
680 0.03
681 0.03
682 0.03
683 0.03
684 0.03
685 0.03
686 0.03
687 0.03
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.03
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.04
702 0.04
703 0.06
704 0.08
705 0.1
706 0.13
707 0.19
708 0.22
709 0.27
710 0.29
711 0.32
712 0.34
713 0.34
714 0.38
715 0.33
716 0.32
717 0.28
718 0.27
719 0.23
720 0.2
721 0.18
722 0.11
723 0.1
724 0.07
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.07
729 0.09
730 0.09
731 0.1
732 0.12
733 0.13
734 0.13
735 0.14
736 0.13
737 0.19
738 0.22
739 0.26
740 0.31
741 0.31
742 0.38
743 0.43
744 0.45
745 0.46
746 0.52
747 0.55
748 0.52
749 0.53
750 0.48
751 0.5
752 0.47
753 0.38
754 0.29
755 0.22
756 0.17
757 0.16
758 0.14
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.09
763 0.09
764 0.09
765 0.12
766 0.13
767 0.15
768 0.15
769 0.17
770 0.18
771 0.19
772 0.22
773 0.19
774 0.19
775 0.18
776 0.23
777 0.27
778 0.35
779 0.36
780 0.36
781 0.38
782 0.43
783 0.43
784 0.43
785 0.44
786 0.42
787 0.4
788 0.41
789 0.38
790 0.3
791 0.28
792 0.24
793 0.17
794 0.12
795 0.11
796 0.1
797 0.1
798 0.16
799 0.18
800 0.17
801 0.18
802 0.2
803 0.2
804 0.19
805 0.21
806 0.18
807 0.19
808 0.18
809 0.17
810 0.15
811 0.14
812 0.12
813 0.1
814 0.07
815 0.08
816 0.11
817 0.11
818 0.12
819 0.14
820 0.15
821 0.19
822 0.29
823 0.3
824 0.37
825 0.47
826 0.51
827 0.51
828 0.54
829 0.56
830 0.51
831 0.46
832 0.39
833 0.34
834 0.32
835 0.31
836 0.29
837 0.25
838 0.23
839 0.23
840 0.22
841 0.24
842 0.2
843 0.22
844 0.21
845 0.2
846 0.18
847 0.18
848 0.18
849 0.13
850 0.13
851 0.12
852 0.11
853 0.11
854 0.13
855 0.13
856 0.14
857 0.15
858 0.14
859 0.14
860 0.18
861 0.21
862 0.25
863 0.31
864 0.33
865 0.34
866 0.4
867 0.39
868 0.36
869 0.37
870 0.34
871 0.32
872 0.31
873 0.3
874 0.27
875 0.31
876 0.31
877 0.29
878 0.28
879 0.28
880 0.3
881 0.32
882 0.35
883 0.37
884 0.39
885 0.38
886 0.41
887 0.37
888 0.36
889 0.32
890 0.28
891 0.25
892 0.21
893 0.21
894 0.17
895 0.15
896 0.11
897 0.1
898 0.11
899 0.07
900 0.09
901 0.1
902 0.1
903 0.11
904 0.1
905 0.11
906 0.1
907 0.1
908 0.09
909 0.11
910 0.16
911 0.17
912 0.18
913 0.19
914 0.2
915 0.2
916 0.19
917 0.22
918 0.24
919 0.24
920 0.27
921 0.27
922 0.25
923 0.24
924 0.25
925 0.22
926 0.15
927 0.14
928 0.11
929 0.11
930 0.14
931 0.14
932 0.14
933 0.15
934 0.15
935 0.16
936 0.18
937 0.18
938 0.17
939 0.26
940 0.29
941 0.3
942 0.34
943 0.4
944 0.45
945 0.52
946 0.56
947 0.57
948 0.57
949 0.6
950 0.58
951 0.53
952 0.47
953 0.4
954 0.34
955 0.25
956 0.23
957 0.17
958 0.15
959 0.12
960 0.11
961 0.1
962 0.09
963 0.08
964 0.05
965 0.06
966 0.05
967 0.06
968 0.09
969 0.11
970 0.12
971 0.13
972 0.13
973 0.12
974 0.13
975 0.15
976 0.2
977 0.24
978 0.32
979 0.35
980 0.38
981 0.41
982 0.44
983 0.43
984 0.37
985 0.33
986 0.34
987 0.33
988 0.32
989 0.31
990 0.27
991 0.26
992 0.26
993 0.24
994 0.16
995 0.14
996 0.14
997 0.15
998 0.16
999 0.15
1000 0.15
1001 0.14
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.12
1005 0.08
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.08
1009 0.11
1010 0.13
1011 0.14
1012 0.15
1013 0.19
1014 0.22
1015 0.24
1016 0.28
1017 0.3
1018 0.3
1019 0.36
1020 0.38
1021 0.34
1022 0.33
1023 0.3
1024 0.27
1025 0.23
1026 0.21
1027 0.14
1028 0.11
1029 0.1
1030 0.08
1031 0.08
1032 0.06
1033 0.05
1034 0.04
1035 0.04
1036 0.04
1037 0.03
1038 0.04
1039 0.04
1040 0.05
1041 0.04
1042 0.04
1043 0.06
1044 0.14
1045 0.16
1046 0.16
1047 0.16
1048 0.18
1049 0.21
1050 0.23
1051 0.24
1052 0.22
1053 0.24
1054 0.3
1055 0.35
1056 0.34
1057 0.34
1058 0.39
1059 0.42
1060 0.45
1061 0.48
1062 0.51
1063 0.53
1064 0.62
1065 0.66
1066 0.69
1067 0.69
1068 0.67
1069 0.66
1070 0.65
1071 0.6
1072 0.53
1073 0.49
1074 0.42
1075 0.36
1076 0.33
1077 0.3
1078 0.27
1079 0.27
1080 0.32
1081 0.37
1082 0.41
1083 0.48
1084 0.52
1085 0.51
1086 0.48
1087 0.5
1088 0.52
1089 0.52
1090 0.52
1091 0.52
1092 0.48
1093 0.46
1094 0.45
1095 0.42
1096 0.33
1097 0.25
1098 0.18
1099 0.12
1100 0.1
1101 0.1
1102 0.1
1103 0.1
1104 0.11
1105 0.12
1106 0.14
1107 0.14
1108 0.15
1109 0.16
1110 0.18
1111 0.22
1112 0.24
1113 0.23
1114 0.26
1115 0.27
1116 0.26
1117 0.25
1118 0.23
1119 0.17
1120 0.15
1121 0.15
1122 0.11
1123 0.11
1124 0.15
1125 0.18
1126 0.21
1127 0.22
1128 0.24
1129 0.33
1130 0.34
1131 0.38
1132 0.39
1133 0.44
1134 0.52
1135 0.6
1136 0.67
1137 0.65
1138 0.7
1139 0.71
1140 0.7
1141 0.65
1142 0.63
1143 0.6
1144 0.59
1145 0.62
1146 0.56
1147 0.53
1148 0.48
1149 0.46
1150 0.42
1151 0.41
1152 0.36
1153 0.3
1154 0.29
1155 0.29
1156 0.29
1157 0.29
1158 0.27
1159 0.22
1160 0.19
1161 0.15
1162 0.15
1163 0.14
1164 0.18
1165 0.22
1166 0.25
1167 0.26
1168 0.26
1169 0.31
1170 0.31
1171 0.31
1172 0.28
1173 0.26
1174 0.22
1175 0.24
1176 0.26