Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2JIT0

Protein Details
Accession A0A0A2JIT0    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
398-420ESEKESKKALKKAKKTPLPESDSHydrophilic
508-536LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
404-412KKALKKAKK
514-526KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002637  Ham1p-like  
IPR027502  ITPase  
IPR029001  ITPase-like_fam  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0035870  F:dITP diphosphatase activity  
GO:0036220  F:ITP diphosphatase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0036222  F:XTP diphosphatase activity  
GO:0009204  P:deoxyribonucleoside triphosphate catabolic process  
GO:0009117  P:nucleotide metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01725  Ham1p_like  
PF05022  SRP40_C  
CDD cd00515  HAM1  
Amino Acid Sequences MSSTTINFITGNKNKLAETRAILGDTVQLSNQNVEILEIQGSLEEIARDKCRKAAIAVNGPVLTEDSALEFRALKGLPGPYIKWFYSALGDDGLCKLLAAYDDKAATAVCTFAFSAGPGSEPHLFQGCTEGKIVDKRGEGGFGFDPIFEVEGQTYAEMSFAYKTESSKTTKSIPPQLIASVAAFLSENFPETSTAFTKEAKSGKKSDAKNVPSLLELFQASEQGSSVKKSASNSSSSSSSSGSDSDSDVEMGDAARSSSPSSSSSSSDSDADDEDDDKSPAAPTPAPAQVKKSAGVKRKAESSSESSSSSDSDSSSSEDDSPKAKKAKTSPTPKEASSSSDSSSSSSDSSSSDSDSSSSSSSSSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSSDSSSESESESESEKESKKALKKAKKTPLPESDSSSDSESSSSGSNTVAPTPETEIKPVKKVEEAVKTSSSSASPAHGNGPVKKKHTGARPTPLALLSELPHDHPSNDYMSYAYADRAWKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIAPGTTSYKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.38
3 0.4
4 0.35
5 0.33
6 0.34
7 0.33
8 0.32
9 0.3
10 0.26
11 0.26
12 0.23
13 0.2
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.17
19 0.14
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.08
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.09
33 0.13
34 0.2
35 0.24
36 0.24
37 0.28
38 0.31
39 0.32
40 0.34
41 0.38
42 0.4
43 0.46
44 0.48
45 0.48
46 0.44
47 0.42
48 0.38
49 0.31
50 0.22
51 0.13
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.15
60 0.14
61 0.12
62 0.15
63 0.17
64 0.2
65 0.22
66 0.24
67 0.25
68 0.3
69 0.3
70 0.28
71 0.27
72 0.24
73 0.25
74 0.25
75 0.21
76 0.18
77 0.18
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.11
82 0.1
83 0.08
84 0.07
85 0.09
86 0.11
87 0.12
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.12
94 0.09
95 0.09
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.12
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.15
113 0.23
114 0.21
115 0.2
116 0.2
117 0.19
118 0.19
119 0.23
120 0.26
121 0.22
122 0.21
123 0.23
124 0.22
125 0.24
126 0.21
127 0.21
128 0.18
129 0.16
130 0.16
131 0.13
132 0.13
133 0.11
134 0.12
135 0.08
136 0.08
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.05
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.14
152 0.18
153 0.21
154 0.23
155 0.26
156 0.29
157 0.33
158 0.38
159 0.43
160 0.42
161 0.4
162 0.39
163 0.36
164 0.31
165 0.27
166 0.21
167 0.13
168 0.1
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.12
180 0.12
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.21
186 0.27
187 0.28
188 0.31
189 0.32
190 0.38
191 0.44
192 0.45
193 0.49
194 0.53
195 0.51
196 0.52
197 0.49
198 0.43
199 0.36
200 0.34
201 0.26
202 0.18
203 0.15
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.11
216 0.12
217 0.18
218 0.19
219 0.22
220 0.22
221 0.24
222 0.24
223 0.23
224 0.23
225 0.18
226 0.17
227 0.14
228 0.13
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.08
248 0.11
249 0.12
250 0.13
251 0.15
252 0.16
253 0.17
254 0.16
255 0.15
256 0.13
257 0.11
258 0.11
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.11
272 0.16
273 0.18
274 0.19
275 0.21
276 0.24
277 0.25
278 0.26
279 0.3
280 0.31
281 0.37
282 0.44
283 0.44
284 0.42
285 0.47
286 0.46
287 0.41
288 0.38
289 0.36
290 0.33
291 0.31
292 0.3
293 0.24
294 0.24
295 0.22
296 0.19
297 0.14
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.15
308 0.16
309 0.2
310 0.24
311 0.24
312 0.28
313 0.34
314 0.44
315 0.5
316 0.59
317 0.6
318 0.63
319 0.65
320 0.6
321 0.56
322 0.47
323 0.42
324 0.36
325 0.31
326 0.24
327 0.23
328 0.23
329 0.21
330 0.21
331 0.17
332 0.13
333 0.11
334 0.11
335 0.09
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.12
358 0.12
359 0.12
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.13
384 0.12
385 0.13
386 0.17
387 0.18
388 0.19
389 0.22
390 0.28
391 0.33
392 0.41
393 0.5
394 0.55
395 0.63
396 0.72
397 0.79
398 0.8
399 0.8
400 0.8
401 0.8
402 0.77
403 0.7
404 0.66
405 0.59
406 0.52
407 0.47
408 0.4
409 0.3
410 0.23
411 0.21
412 0.15
413 0.13
414 0.12
415 0.11
416 0.09
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.13
424 0.18
425 0.24
426 0.23
427 0.26
428 0.32
429 0.34
430 0.39
431 0.4
432 0.37
433 0.34
434 0.38
435 0.41
436 0.44
437 0.45
438 0.43
439 0.44
440 0.42
441 0.4
442 0.37
443 0.29
444 0.22
445 0.19
446 0.17
447 0.16
448 0.16
449 0.18
450 0.21
451 0.26
452 0.31
453 0.38
454 0.42
455 0.45
456 0.48
457 0.5
458 0.52
459 0.57
460 0.6
461 0.6
462 0.64
463 0.66
464 0.63
465 0.61
466 0.55
467 0.47
468 0.38
469 0.31
470 0.22
471 0.21
472 0.2
473 0.2
474 0.23
475 0.22
476 0.22
477 0.22
478 0.23
479 0.21
480 0.21
481 0.19
482 0.15
483 0.16
484 0.17
485 0.16
486 0.15
487 0.15
488 0.17
489 0.18
490 0.2
491 0.2
492 0.19
493 0.21
494 0.25
495 0.29
496 0.34
497 0.36
498 0.36
499 0.41
500 0.42
501 0.46
502 0.5
503 0.52
504 0.55
505 0.63
506 0.71
507 0.77
508 0.86
509 0.87
510 0.9
511 0.91
512 0.9
513 0.9
514 0.89
515 0.89
516 0.88
517 0.82
518 0.72
519 0.62
520 0.57
521 0.47
522 0.38
523 0.28
524 0.2
525 0.2
526 0.2