Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2JHD1

Protein Details
Accession A0A0A2JHD1    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-69PVGSTYSSSRRPRREDDRYDRTRRDDGRSYRRSRSPERRYRGRDRPRDRDAYRRRDLPBasic
73-159RDEDTYRPARRDRSRERRRDDDHDVRRRSRDRDYRSRRDDSRDRDRRRIDDSADLKPKSRRDDSRDRAPSRRSRSRTREPSKPSTPABasic
177-196EAWKQKQAAEREKKQKEQASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-155RTRRDDGRSYRRSRSPERRYRGRDRPRDRDAYRRRDLPVDRRDEDTYRPARRDRSRERRRDDDHDVRRRSRDRDYRSRRDDSRDRDRRRIDDSADLKPKSRRDDSRDRAPSRRSRSRTREPSKP
179-190WKQKQAAEREKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17953  DEADc_DDX46  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MARHGDTRSPSPVGSTYSSSRRPRREDDRYDRTRRDDGRSYRRSRSPERRYRGRDRPRDRDAYRRRDLPVDRRDEDTYRPARRDRSRERRRDDDHDVRRRSRDRDYRSRRDDSRDRDRRRIDDSADLKPKSRRDDSRDRAPSRRSRSRTREPSKPSTPAPTAQTDEQKKAERLAKLEAWKQKQAAEREKKQKEQASVDPKKILEAIDRKSVVSPGPAAFPGKLKFDPKAIVKSSTTSTAAPAVLGTDVAVPTSVKPPSVTKPIAPSAAPATLSGPLKAKGNVSGFGLGARQISETEKPSASKTLGFGDADEESTRKKLEKLPTAPLDVGGQVDDVVEDDDVDMQVEGTEEHAAAEARAAAERRDTRLQSQNDDVHMEESTDAQADSTPMEVDDDEEIDPLDAFMAELQDSAPPERKIGATFAKKTDHQQPEAMFGDDEDVDVTAVGDEKAEDVLALAAMKKKKREMPDIDHTKIEYEPFRKEFYTEPSNLAEMTEEEVANLRLELDGIKVRGRDVPKPVQKWSQCGLGVQTLDVVHKLGWENLTSIQAQAIPTIMSGRDVIGVAKTGSGKTGAFLVPMFRHIKDQRPLASTDGPISMILSPTRELATQIHKDCKPFLKALGLRAVCAYGGAPIKDQIAELKRGAEIIVCTAGRLIDLLAANQGRVLNLRRITYVVLDEGDRMFDMGFGPQVVKIMASIRPDRQTVLFSATFPKSMEALARKTLNEPVEITVGGKSVVAPEITQIVEVRNNDQKFFRLLELLGNLYEDDANEDYRTLIFVDRQEAADDLLKQLMYKGYPCMSIHGGKDQIDRDSTIQEFKAGIFPILVATSVAARGLDVKQLKLVVNYDAPNHLEDYVHRAGRTGRAGNTGTAVTFVTEEQDRYALDIAKALRQSGQEVPEPLQKLVDGFNEKVKSGKEKNFSRHGFGGKGLDRLNMERETARLRERKAYKTGDDMDDEEDKLETEQESDDRFNKALSAVRSAAEPAVPAATPSVSMPGVPKGIDLDGKIVVHRTERAPANASKNPLDKVGSAVADIHARLSRAGVMRSGVPIDNRGPDAGAFHATLEINDFPQKARWAVTNRTNVAKILEASGTSITTKGNFYAAGKEPSPGELPKLYILVEGETEISVTTAIHELRRLLKDATLAASEGEARAPVGGRYNVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.33
4 0.38
5 0.48
6 0.54
7 0.61
8 0.66
9 0.7
10 0.74
11 0.79
12 0.82
13 0.84
14 0.85
15 0.86
16 0.87
17 0.89
18 0.86
19 0.81
20 0.8
21 0.75
22 0.73
23 0.72
24 0.73
25 0.74
26 0.78
27 0.79
28 0.78
29 0.8
30 0.8
31 0.81
32 0.81
33 0.82
34 0.82
35 0.85
36 0.87
37 0.88
38 0.9
39 0.91
40 0.91
41 0.9
42 0.9
43 0.9
44 0.88
45 0.89
46 0.84
47 0.84
48 0.83
49 0.82
50 0.8
51 0.76
52 0.7
53 0.69
54 0.73
55 0.72
56 0.72
57 0.7
58 0.64
59 0.63
60 0.64
61 0.58
62 0.55
63 0.54
64 0.54
65 0.52
66 0.56
67 0.57
68 0.62
69 0.69
70 0.74
71 0.76
72 0.78
73 0.82
74 0.86
75 0.89
76 0.89
77 0.87
78 0.85
79 0.84
80 0.84
81 0.83
82 0.83
83 0.83
84 0.79
85 0.81
86 0.79
87 0.74
88 0.74
89 0.74
90 0.73
91 0.76
92 0.81
93 0.82
94 0.84
95 0.87
96 0.82
97 0.81
98 0.81
99 0.79
100 0.8
101 0.8
102 0.8
103 0.81
104 0.82
105 0.78
106 0.75
107 0.73
108 0.65
109 0.64
110 0.61
111 0.61
112 0.62
113 0.57
114 0.55
115 0.55
116 0.57
117 0.55
118 0.6
119 0.59
120 0.6
121 0.7
122 0.73
123 0.78
124 0.82
125 0.8
126 0.78
127 0.78
128 0.79
129 0.78
130 0.81
131 0.77
132 0.77
133 0.81
134 0.84
135 0.86
136 0.84
137 0.84
138 0.82
139 0.85
140 0.82
141 0.78
142 0.71
143 0.68
144 0.64
145 0.59
146 0.54
147 0.5
148 0.46
149 0.45
150 0.51
151 0.48
152 0.49
153 0.49
154 0.51
155 0.47
156 0.5
157 0.51
158 0.46
159 0.43
160 0.45
161 0.46
162 0.46
163 0.52
164 0.54
165 0.54
166 0.55
167 0.54
168 0.52
169 0.53
170 0.56
171 0.59
172 0.61
173 0.65
174 0.71
175 0.77
176 0.79
177 0.8
178 0.78
179 0.74
180 0.71
181 0.7
182 0.7
183 0.7
184 0.67
185 0.62
186 0.56
187 0.5
188 0.44
189 0.36
190 0.33
191 0.33
192 0.33
193 0.37
194 0.38
195 0.37
196 0.36
197 0.37
198 0.29
199 0.24
200 0.23
201 0.16
202 0.18
203 0.18
204 0.19
205 0.18
206 0.22
207 0.22
208 0.23
209 0.26
210 0.27
211 0.27
212 0.29
213 0.35
214 0.35
215 0.41
216 0.39
217 0.4
218 0.38
219 0.39
220 0.37
221 0.35
222 0.32
223 0.24
224 0.23
225 0.21
226 0.2
227 0.17
228 0.14
229 0.11
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.14
243 0.18
244 0.23
245 0.31
246 0.32
247 0.3
248 0.35
249 0.38
250 0.39
251 0.34
252 0.31
253 0.26
254 0.26
255 0.23
256 0.18
257 0.16
258 0.18
259 0.19
260 0.18
261 0.17
262 0.16
263 0.18
264 0.2
265 0.19
266 0.21
267 0.22
268 0.22
269 0.22
270 0.22
271 0.19
272 0.18
273 0.17
274 0.12
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.11
280 0.13
281 0.16
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.22
286 0.25
287 0.23
288 0.21
289 0.2
290 0.2
291 0.21
292 0.2
293 0.18
294 0.17
295 0.16
296 0.16
297 0.15
298 0.12
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.12
303 0.15
304 0.21
305 0.29
306 0.39
307 0.42
308 0.5
309 0.52
310 0.54
311 0.51
312 0.44
313 0.36
314 0.26
315 0.22
316 0.13
317 0.1
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.13
348 0.16
349 0.2
350 0.26
351 0.27
352 0.32
353 0.4
354 0.42
355 0.4
356 0.44
357 0.42
358 0.38
359 0.38
360 0.32
361 0.24
362 0.22
363 0.18
364 0.12
365 0.1
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.05
396 0.06
397 0.08
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.15
402 0.15
403 0.15
404 0.19
405 0.25
406 0.27
407 0.29
408 0.32
409 0.34
410 0.35
411 0.38
412 0.44
413 0.41
414 0.37
415 0.38
416 0.35
417 0.37
418 0.38
419 0.34
420 0.24
421 0.18
422 0.17
423 0.13
424 0.13
425 0.07
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.04
444 0.08
445 0.12
446 0.15
447 0.18
448 0.22
449 0.28
450 0.34
451 0.43
452 0.47
453 0.51
454 0.6
455 0.65
456 0.62
457 0.58
458 0.52
459 0.43
460 0.36
461 0.3
462 0.24
463 0.18
464 0.21
465 0.22
466 0.25
467 0.23
468 0.24
469 0.25
470 0.26
471 0.3
472 0.26
473 0.27
474 0.25
475 0.26
476 0.24
477 0.21
478 0.15
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.07
488 0.05
489 0.04
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.07
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.1
498 0.15
499 0.17
500 0.2
501 0.25
502 0.33
503 0.39
504 0.42
505 0.45
506 0.49
507 0.48
508 0.48
509 0.44
510 0.4
511 0.33
512 0.31
513 0.28
514 0.22
515 0.21
516 0.16
517 0.15
518 0.1
519 0.09
520 0.09
521 0.08
522 0.05
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.08
528 0.09
529 0.09
530 0.11
531 0.1
532 0.09
533 0.08
534 0.09
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.06
547 0.06
548 0.05
549 0.06
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.08
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.09
563 0.08
564 0.12
565 0.13
566 0.12
567 0.18
568 0.19
569 0.27
570 0.29
571 0.33
572 0.33
573 0.33
574 0.34
575 0.31
576 0.31
577 0.24
578 0.21
579 0.18
580 0.14
581 0.12
582 0.11
583 0.09
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.08
590 0.07
591 0.08
592 0.1
593 0.16
594 0.21
595 0.23
596 0.28
597 0.29
598 0.3
599 0.32
600 0.34
601 0.31
602 0.26
603 0.25
604 0.27
605 0.27
606 0.29
607 0.33
608 0.29
609 0.26
610 0.25
611 0.24
612 0.15
613 0.14
614 0.11
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.09
623 0.11
624 0.12
625 0.14
626 0.14
627 0.14
628 0.14
629 0.14
630 0.14
631 0.1
632 0.08
633 0.06
634 0.08
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.06
640 0.06
641 0.05
642 0.05
643 0.06
644 0.06
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.09
649 0.09
650 0.07
651 0.09
652 0.11
653 0.14
654 0.16
655 0.17
656 0.17
657 0.17
658 0.18
659 0.17
660 0.16
661 0.11
662 0.1
663 0.09
664 0.09
665 0.08
666 0.08
667 0.07
668 0.06
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.04
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.07
682 0.09
683 0.12
684 0.15
685 0.18
686 0.2
687 0.21
688 0.22
689 0.21
690 0.2
691 0.18
692 0.2
693 0.17
694 0.16
695 0.2
696 0.19
697 0.19
698 0.18
699 0.18
700 0.13
701 0.13
702 0.16
703 0.15
704 0.16
705 0.2
706 0.21
707 0.21
708 0.22
709 0.26
710 0.23
711 0.21
712 0.19
713 0.17
714 0.16
715 0.16
716 0.15
717 0.1
718 0.1
719 0.09
720 0.07
721 0.06
722 0.06
723 0.07
724 0.06
725 0.06
726 0.06
727 0.08
728 0.08
729 0.08
730 0.08
731 0.08
732 0.11
733 0.12
734 0.15
735 0.2
736 0.21
737 0.22
738 0.23
739 0.23
740 0.22
741 0.24
742 0.21
743 0.15
744 0.15
745 0.16
746 0.16
747 0.15
748 0.12
749 0.11
750 0.1
751 0.09
752 0.08
753 0.06
754 0.07
755 0.07
756 0.08
757 0.08
758 0.08
759 0.08
760 0.08
761 0.09
762 0.07
763 0.07
764 0.09
765 0.1
766 0.12
767 0.13
768 0.14
769 0.14
770 0.13
771 0.13
772 0.14
773 0.13
774 0.11
775 0.11
776 0.1
777 0.1
778 0.11
779 0.11
780 0.09
781 0.1
782 0.12
783 0.12
784 0.16
785 0.16
786 0.18
787 0.19
788 0.22
789 0.22
790 0.24
791 0.26
792 0.24
793 0.28
794 0.26
795 0.25
796 0.23
797 0.23
798 0.19
799 0.2
800 0.19
801 0.18
802 0.16
803 0.16
804 0.15
805 0.14
806 0.16
807 0.14
808 0.13
809 0.1
810 0.1
811 0.1
812 0.09
813 0.09
814 0.05
815 0.05
816 0.05
817 0.05
818 0.05
819 0.04
820 0.04
821 0.06
822 0.07
823 0.13
824 0.14
825 0.14
826 0.15
827 0.18
828 0.19
829 0.18
830 0.19
831 0.16
832 0.18
833 0.19
834 0.19
835 0.19
836 0.19
837 0.18
838 0.18
839 0.16
840 0.12
841 0.12
842 0.18
843 0.21
844 0.21
845 0.2
846 0.2
847 0.22
848 0.27
849 0.32
850 0.28
851 0.24
852 0.28
853 0.29
854 0.29
855 0.28
856 0.23
857 0.18
858 0.15
859 0.13
860 0.09
861 0.08
862 0.08
863 0.08
864 0.09
865 0.1
866 0.1
867 0.11
868 0.1
869 0.11
870 0.13
871 0.13
872 0.12
873 0.15
874 0.15
875 0.18
876 0.19
877 0.18
878 0.18
879 0.17
880 0.21
881 0.22
882 0.24
883 0.23
884 0.24
885 0.27
886 0.3
887 0.31
888 0.28
889 0.24
890 0.2
891 0.18
892 0.19
893 0.21
894 0.2
895 0.19
896 0.26
897 0.27
898 0.27
899 0.29
900 0.28
901 0.32
902 0.35
903 0.42
904 0.44
905 0.51
906 0.58
907 0.66
908 0.66
909 0.64
910 0.61
911 0.57
912 0.49
913 0.44
914 0.44
915 0.36
916 0.37
917 0.32
918 0.29
919 0.27
920 0.28
921 0.3
922 0.23
923 0.23
924 0.2
925 0.21
926 0.23
927 0.25
928 0.31
929 0.32
930 0.34
931 0.42
932 0.48
933 0.53
934 0.56
935 0.59
936 0.54
937 0.56
938 0.58
939 0.52
940 0.48
941 0.42
942 0.38
943 0.34
944 0.31
945 0.23
946 0.18
947 0.15
948 0.13
949 0.13
950 0.09
951 0.08
952 0.1
953 0.11
954 0.14
955 0.17
956 0.19
957 0.2
958 0.21
959 0.2
960 0.19
961 0.19
962 0.21
963 0.2
964 0.24
965 0.22
966 0.22
967 0.23
968 0.23
969 0.22
970 0.16
971 0.14
972 0.1
973 0.1
974 0.09
975 0.09
976 0.09
977 0.08
978 0.08
979 0.08
980 0.11
981 0.09
982 0.1
983 0.12
984 0.14
985 0.15
986 0.14
987 0.14
988 0.13
989 0.15
990 0.16
991 0.15
992 0.15
993 0.16
994 0.16
995 0.16
996 0.17
997 0.16
998 0.17
999 0.2
1000 0.2
1001 0.25
1002 0.28
1003 0.31
1004 0.34
1005 0.38
1006 0.44
1007 0.45
1008 0.48
1009 0.46
1010 0.46
1011 0.44
1012 0.42
1013 0.38
1014 0.31
1015 0.3
1016 0.3
1017 0.24
1018 0.21
1019 0.2
1020 0.18
1021 0.18
1022 0.17
1023 0.16
1024 0.13
1025 0.14
1026 0.13
1027 0.14
1028 0.17
1029 0.18
1030 0.2
1031 0.19
1032 0.19
1033 0.2
1034 0.21
1035 0.23
1036 0.2
1037 0.18
1038 0.21
1039 0.22
1040 0.24
1041 0.24
1042 0.23
1043 0.21
1044 0.19
1045 0.19
1046 0.17
1047 0.17
1048 0.14
1049 0.13
1050 0.15
1051 0.14
1052 0.14
1053 0.15
1054 0.14
1055 0.14
1056 0.17
1057 0.18
1058 0.16
1059 0.21
1060 0.24
1061 0.22
1062 0.24
1063 0.29
1064 0.33
1065 0.41
1066 0.49
1067 0.53
1068 0.54
1069 0.57
1070 0.56
1071 0.5
1072 0.46
1073 0.41
1074 0.32
1075 0.26
1076 0.23
1077 0.18
1078 0.18
1079 0.18
1080 0.16
1081 0.14
1082 0.13
1083 0.12
1084 0.12
1085 0.14
1086 0.13
1087 0.13
1088 0.14
1089 0.15
1090 0.21
1091 0.26
1092 0.29
1093 0.28
1094 0.29
1095 0.29
1096 0.3
1097 0.33
1098 0.26
1099 0.26
1100 0.23
1101 0.24
1102 0.25
1103 0.25
1104 0.22
1105 0.2
1106 0.2
1107 0.16
1108 0.15
1109 0.13
1110 0.12
1111 0.11
1112 0.11
1113 0.09
1114 0.08
1115 0.07
1116 0.06
1117 0.07
1118 0.1
1119 0.12
1120 0.13
1121 0.15
1122 0.19
1123 0.26
1124 0.29
1125 0.31
1126 0.29
1127 0.3
1128 0.31
1129 0.32
1130 0.31
1131 0.25
1132 0.22
1133 0.19
1134 0.18
1135 0.17
1136 0.14
1137 0.12
1138 0.09
1139 0.08
1140 0.09
1141 0.1
1142 0.1
1143 0.16