Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2JNP3

Protein Details
Accession A0A0A2JNP3    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-50NLPLRTADAERKRKSKKDASAASPSKKRKQSSSSKATPHQLHydrophilic
347-385VHLEASPKKEKKEKKEKKTEKTEKKEKKSKSSKSKSKDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-39RKRKSKKDASAASPSKKRKQ
353-384PKKEKKEKKEKKTEKTEKKEKKSKSSKSKSKD
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.166, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAIDAMEIDNLPLRTADAERKRKSKKDASAASPSKKRKQSSSSKATPHQLQDSPPESPFTLTTATLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYFPPLKGVVLAYSNASISSKPPAHPRASSDLNPQPLTLATTADEYGVLYVYLTATFLVFRPKRGQTLDGWVNVQSEGFLGAVVFNLFSVGVERKRLPSNWKWVPPGEEAETPALTDDDSGSDKDMADFDAEKECFKPATLSAEEIAIDGEEEDESAHTGYFQSVSGHRVNGSVRFRVVDVDVIPGSERDRGFLSIEGTMLSVEEEERLLESERQGQSLPPSFFSSPQKVSGSIPVMNVPAASAVQELSTVDVHLEASPKKEKKEKKEKKTEKTEKKEKKSKSSKSKSKDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.17
3 0.26
4 0.33
5 0.43
6 0.5
7 0.6
8 0.69
9 0.75
10 0.81
11 0.82
12 0.81
13 0.82
14 0.83
15 0.8
16 0.82
17 0.83
18 0.82
19 0.8
20 0.79
21 0.78
22 0.77
23 0.75
24 0.73
25 0.74
26 0.76
27 0.78
28 0.8
29 0.79
30 0.79
31 0.81
32 0.79
33 0.75
34 0.7
35 0.66
36 0.58
37 0.53
38 0.53
39 0.5
40 0.45
41 0.39
42 0.36
43 0.3
44 0.29
45 0.26
46 0.2
47 0.19
48 0.16
49 0.16
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.14
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.11
61 0.11
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.05
78 0.04
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.09
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.12
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.08
99 0.08
100 0.14
101 0.16
102 0.18
103 0.26
104 0.32
105 0.35
106 0.37
107 0.4
108 0.4
109 0.43
110 0.43
111 0.43
112 0.42
113 0.43
114 0.41
115 0.36
116 0.3
117 0.25
118 0.24
119 0.17
120 0.12
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.14
140 0.14
141 0.17
142 0.22
143 0.24
144 0.28
145 0.3
146 0.32
147 0.24
148 0.32
149 0.34
150 0.29
151 0.28
152 0.25
153 0.23
154 0.21
155 0.19
156 0.1
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.04
171 0.07
172 0.07
173 0.1
174 0.11
175 0.14
176 0.16
177 0.18
178 0.24
179 0.27
180 0.36
181 0.41
182 0.45
183 0.44
184 0.43
185 0.45
186 0.4
187 0.37
188 0.3
189 0.24
190 0.21
191 0.2
192 0.18
193 0.14
194 0.13
195 0.1
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.09
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.13
227 0.12
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.09
246 0.13
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.16
251 0.17
252 0.22
253 0.24
254 0.23
255 0.22
256 0.22
257 0.22
258 0.21
259 0.21
260 0.16
261 0.13
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.14
270 0.12
271 0.14
272 0.15
273 0.16
274 0.17
275 0.18
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.11
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.09
291 0.11
292 0.12
293 0.2
294 0.2
295 0.22
296 0.21
297 0.22
298 0.26
299 0.32
300 0.32
301 0.26
302 0.3
303 0.3
304 0.35
305 0.4
306 0.41
307 0.36
308 0.39
309 0.39
310 0.35
311 0.36
312 0.38
313 0.35
314 0.3
315 0.29
316 0.25
317 0.24
318 0.23
319 0.21
320 0.14
321 0.11
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.13
337 0.13
338 0.18
339 0.28
340 0.32
341 0.38
342 0.47
343 0.56
344 0.63
345 0.73
346 0.79
347 0.8
348 0.88
349 0.92
350 0.93
351 0.95
352 0.95
353 0.95
354 0.95
355 0.95
356 0.95
357 0.95
358 0.94
359 0.92
360 0.92
361 0.91
362 0.91
363 0.92
364 0.92
365 0.91