Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JD94

Protein Details
Accession C4JD94    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-197QEEQERRRRSRANKHKREISIDSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-191RRRRSRANKHKR
661-738AGPPRGGPGPGPGRAPAPTRGRGRGNNFSRPGNRGPGGPPPGMYPPKPNSGFPPGKPLPRGGAGGLQPPPGPRRFPER
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0030695  F:GTPase regulator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ure:UREG_00289  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
cd09397  LIM1_UF1  
Amino Acid Sequences MATGLDDFLPKIKCSNCQAEVELSAMGDHVCSTAPQPTTEEPGQSSPPRPDLSRLDGPLARVGRMAPPPPIDPLAASECPAGVIRLACVNLRQTVHFSSYVCQHLQVAFPPFPRPASRASAKNRSRSRTLVKGDRVQSPLATSPSESTADHIDSRLDQSLPALPALILSQDDQEQEEQERRRRSRANKHKREISIDSKSLYRMSVASSRYGESLSRGSTPGIPNTANLRGYHNFLDEIPPLPACPIKSVTPSPFTAAPEPYRFPSDEAYENDRVTASPPRSAGLSTGLPGFELGFPIDQEPPKPQDRHSQTARLSNGSSDFVRPEPARPDSPVASKSSAALPAYTVDQDFSVSNFARGLGLGDPYHATNNSTSSSDSSPSDTATTSSCSTQPSEPPSADIKPPPSPYKYDLDSPTDPLFQQGRFKRTPPKYERFVELPHDSEPEGLNGDTESSSSRPSSQRDHVPNKMESLVRAPAPPKSPGPRRIRCRGCGELIVGKSVSSADGRLTGRWHKACFVCYTCRSPFQTADFYVLNNNPYCGQHYHELNGSLCSSCGRGIEGPCLQAEGMVRDEKDGKEKRQLFHPDCFTCKTCRIVLKGDYLEWNGDVYCDRDGRRAAAMAYPPPSPGLRPGPSPGPGQNPGFNGPPPGYGRRPSYNSPPVAGPPRGGPGPGPGRAPAPTRGRGRGNNFSRPGNRGPGGPPPGMYPPKPNSGFPPGKPLPRGGAGGLQPPPGPRRFPERRTTKLMML
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.45
3 0.44
4 0.46
5 0.48
6 0.46
7 0.44
8 0.39
9 0.31
10 0.22
11 0.18
12 0.14
13 0.11
14 0.08
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.08
20 0.14
21 0.16
22 0.17
23 0.21
24 0.23
25 0.31
26 0.32
27 0.33
28 0.3
29 0.32
30 0.37
31 0.38
32 0.4
33 0.38
34 0.42
35 0.43
36 0.42
37 0.45
38 0.45
39 0.48
40 0.51
41 0.48
42 0.48
43 0.46
44 0.46
45 0.47
46 0.41
47 0.33
48 0.26
49 0.25
50 0.25
51 0.29
52 0.3
53 0.28
54 0.3
55 0.31
56 0.34
57 0.35
58 0.29
59 0.24
60 0.26
61 0.28
62 0.25
63 0.24
64 0.2
65 0.18
66 0.19
67 0.18
68 0.14
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.15
76 0.18
77 0.21
78 0.22
79 0.23
80 0.24
81 0.26
82 0.29
83 0.29
84 0.27
85 0.25
86 0.29
87 0.31
88 0.27
89 0.25
90 0.23
91 0.23
92 0.23
93 0.25
94 0.26
95 0.25
96 0.26
97 0.28
98 0.28
99 0.3
100 0.31
101 0.29
102 0.28
103 0.33
104 0.37
105 0.43
106 0.5
107 0.58
108 0.61
109 0.69
110 0.72
111 0.7
112 0.69
113 0.68
114 0.68
115 0.67
116 0.68
117 0.68
118 0.67
119 0.69
120 0.68
121 0.67
122 0.62
123 0.53
124 0.45
125 0.39
126 0.35
127 0.29
128 0.26
129 0.2
130 0.19
131 0.2
132 0.22
133 0.18
134 0.16
135 0.18
136 0.19
137 0.19
138 0.18
139 0.16
140 0.15
141 0.18
142 0.19
143 0.16
144 0.13
145 0.14
146 0.18
147 0.18
148 0.17
149 0.14
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.14
163 0.2
164 0.25
165 0.31
166 0.4
167 0.42
168 0.49
169 0.56
170 0.63
171 0.68
172 0.74
173 0.78
174 0.8
175 0.86
176 0.87
177 0.83
178 0.81
179 0.77
180 0.74
181 0.7
182 0.61
183 0.54
184 0.46
185 0.43
186 0.36
187 0.29
188 0.21
189 0.13
190 0.14
191 0.18
192 0.18
193 0.21
194 0.21
195 0.22
196 0.21
197 0.22
198 0.19
199 0.15
200 0.17
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.19
206 0.21
207 0.2
208 0.21
209 0.2
210 0.2
211 0.23
212 0.26
213 0.23
214 0.22
215 0.25
216 0.24
217 0.26
218 0.26
219 0.23
220 0.2
221 0.18
222 0.21
223 0.16
224 0.16
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.1
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.19
235 0.23
236 0.25
237 0.27
238 0.28
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.26
243 0.25
244 0.26
245 0.25
246 0.26
247 0.26
248 0.26
249 0.24
250 0.23
251 0.22
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.29
256 0.29
257 0.28
258 0.27
259 0.24
260 0.21
261 0.19
262 0.22
263 0.17
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.17
270 0.14
271 0.13
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.13
288 0.17
289 0.23
290 0.24
291 0.25
292 0.33
293 0.4
294 0.46
295 0.47
296 0.5
297 0.47
298 0.52
299 0.51
300 0.43
301 0.36
302 0.3
303 0.27
304 0.22
305 0.2
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.15
310 0.15
311 0.16
312 0.18
313 0.21
314 0.22
315 0.23
316 0.25
317 0.24
318 0.26
319 0.26
320 0.24
321 0.22
322 0.2
323 0.19
324 0.18
325 0.18
326 0.15
327 0.13
328 0.1
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.08
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.05
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.13
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.11
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.13
377 0.14
378 0.17
379 0.19
380 0.21
381 0.2
382 0.21
383 0.23
384 0.23
385 0.23
386 0.23
387 0.21
388 0.23
389 0.27
390 0.28
391 0.27
392 0.29
393 0.3
394 0.32
395 0.31
396 0.31
397 0.3
398 0.33
399 0.32
400 0.32
401 0.3
402 0.26
403 0.24
404 0.22
405 0.21
406 0.16
407 0.23
408 0.24
409 0.29
410 0.3
411 0.33
412 0.41
413 0.45
414 0.55
415 0.56
416 0.58
417 0.59
418 0.6
419 0.61
420 0.54
421 0.5
422 0.46
423 0.39
424 0.34
425 0.28
426 0.26
427 0.22
428 0.2
429 0.17
430 0.12
431 0.11
432 0.09
433 0.08
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.12
443 0.15
444 0.18
445 0.24
446 0.28
447 0.36
448 0.44
449 0.51
450 0.53
451 0.55
452 0.53
453 0.49
454 0.47
455 0.38
456 0.3
457 0.26
458 0.23
459 0.19
460 0.2
461 0.18
462 0.2
463 0.22
464 0.24
465 0.25
466 0.31
467 0.38
468 0.46
469 0.55
470 0.6
471 0.65
472 0.73
473 0.75
474 0.72
475 0.72
476 0.67
477 0.59
478 0.52
479 0.47
480 0.42
481 0.36
482 0.31
483 0.24
484 0.19
485 0.16
486 0.14
487 0.12
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.12
492 0.12
493 0.13
494 0.17
495 0.21
496 0.28
497 0.31
498 0.31
499 0.31
500 0.33
501 0.34
502 0.36
503 0.35
504 0.35
505 0.36
506 0.41
507 0.38
508 0.42
509 0.43
510 0.42
511 0.4
512 0.38
513 0.39
514 0.33
515 0.34
516 0.29
517 0.25
518 0.26
519 0.24
520 0.23
521 0.18
522 0.18
523 0.16
524 0.16
525 0.2
526 0.17
527 0.19
528 0.22
529 0.23
530 0.25
531 0.26
532 0.28
533 0.25
534 0.25
535 0.22
536 0.17
537 0.15
538 0.14
539 0.12
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.13
544 0.14
545 0.2
546 0.21
547 0.21
548 0.2
549 0.2
550 0.18
551 0.16
552 0.15
553 0.11
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.15
558 0.18
559 0.18
560 0.27
561 0.31
562 0.33
563 0.41
564 0.47
565 0.47
566 0.54
567 0.63
568 0.58
569 0.6
570 0.64
571 0.58
572 0.56
573 0.59
574 0.52
575 0.46
576 0.45
577 0.41
578 0.38
579 0.4
580 0.4
581 0.41
582 0.43
583 0.46
584 0.43
585 0.41
586 0.39
587 0.35
588 0.32
589 0.26
590 0.23
591 0.14
592 0.13
593 0.12
594 0.11
595 0.12
596 0.14
597 0.15
598 0.19
599 0.21
600 0.22
601 0.24
602 0.24
603 0.22
604 0.23
605 0.26
606 0.25
607 0.26
608 0.24
609 0.22
610 0.23
611 0.23
612 0.19
613 0.22
614 0.26
615 0.26
616 0.29
617 0.32
618 0.35
619 0.37
620 0.4
621 0.38
622 0.37
623 0.39
624 0.4
625 0.39
626 0.37
627 0.38
628 0.36
629 0.33
630 0.29
631 0.25
632 0.27
633 0.28
634 0.31
635 0.32
636 0.35
637 0.41
638 0.45
639 0.5
640 0.51
641 0.56
642 0.59
643 0.57
644 0.54
645 0.5
646 0.49
647 0.5
648 0.46
649 0.38
650 0.31
651 0.34
652 0.32
653 0.3
654 0.24
655 0.25
656 0.3
657 0.31
658 0.31
659 0.27
660 0.29
661 0.32
662 0.35
663 0.34
664 0.35
665 0.4
666 0.45
667 0.5
668 0.56
669 0.61
670 0.66
671 0.68
672 0.68
673 0.7
674 0.68
675 0.69
676 0.67
677 0.64
678 0.61
679 0.59
680 0.53
681 0.46
682 0.45
683 0.47
684 0.47
685 0.43
686 0.38
687 0.34
688 0.41
689 0.44
690 0.42
691 0.42
692 0.41
693 0.5
694 0.52
695 0.5
696 0.48
697 0.53
698 0.58
699 0.51
700 0.57
701 0.53
702 0.57
703 0.57
704 0.54
705 0.49
706 0.45
707 0.46
708 0.37
709 0.38
710 0.33
711 0.37
712 0.36
713 0.33
714 0.3
715 0.33
716 0.37
717 0.35
718 0.36
719 0.34
720 0.42
721 0.5
722 0.56
723 0.62
724 0.66
725 0.69
726 0.74