Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JT50

Protein Details
Accession C4JT50    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
458-485DPDTPLGRGERNKRRRRARSNSPTTGTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
465-476RGERNKRRRRAR
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 10.5, cyto 3.5, nucl 3, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
KEGG ure:UREG_05639  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MSFPFASVTSYSPRLRQYANALLTPILPATPASAVRTTKRGTAAINYAENDFDDEELDDNSDSTRRPTGLRSLKREELQPDRGPTGEKLGTEIFAPANVQPNFREWVIRRRPKSMREIQITGHGLLPLNLVPIRIDLEVPAHQPLEPFPLPRNYLEIGINPGAPAYRKPEAAPPYRVKDFILWNLHEPFLTPEEFAIIFVRELDLPNLPVMVTAVCNQIRQQLEEYAGVAMHPIFQKAPATEKSNNTPTQAQQVADTPTSEQRSSAIPAHRPDSNQKKWISQQISPDDGIFSTDDAYRCIVILDITLQNKLYTDRFEWSLLHDQGLADQFARKTCADLGLGPEWVNVISHGICEVVLRLKKDACESGGLVGIGGDGAEIDNQAAHAREAGWRYDPDGLGDEWEPRIQILSKEDIEKREGDRERQIRRLRRETARFSSTAGMSLELTRQSSGGYFDLPDPDTPLGRGERNKRRRRARSNSPTTGTAGGRGTPDLGSIAGYGGGGGTLTDGERQSWRCMHCAWPGHATWAARDGPEGPKVLCQNCGVEYERDGRLPTWSKSLFAPRRILP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.39
4 0.42
5 0.45
6 0.47
7 0.43
8 0.4
9 0.37
10 0.35
11 0.31
12 0.23
13 0.13
14 0.1
15 0.08
16 0.09
17 0.12
18 0.13
19 0.16
20 0.21
21 0.24
22 0.27
23 0.33
24 0.33
25 0.35
26 0.37
27 0.37
28 0.34
29 0.36
30 0.4
31 0.39
32 0.4
33 0.37
34 0.34
35 0.31
36 0.29
37 0.25
38 0.19
39 0.14
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.12
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.16
52 0.17
53 0.19
54 0.23
55 0.32
56 0.41
57 0.5
58 0.55
59 0.59
60 0.64
61 0.65
62 0.67
63 0.64
64 0.61
65 0.61
66 0.58
67 0.55
68 0.5
69 0.48
70 0.45
71 0.39
72 0.37
73 0.31
74 0.25
75 0.24
76 0.23
77 0.23
78 0.2
79 0.21
80 0.13
81 0.11
82 0.13
83 0.11
84 0.19
85 0.19
86 0.21
87 0.2
88 0.23
89 0.25
90 0.25
91 0.31
92 0.25
93 0.35
94 0.45
95 0.53
96 0.54
97 0.6
98 0.68
99 0.68
100 0.75
101 0.74
102 0.73
103 0.7
104 0.69
105 0.61
106 0.62
107 0.57
108 0.48
109 0.39
110 0.3
111 0.23
112 0.2
113 0.2
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.11
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.14
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.19
133 0.18
134 0.18
135 0.2
136 0.25
137 0.27
138 0.27
139 0.3
140 0.24
141 0.25
142 0.25
143 0.22
144 0.22
145 0.2
146 0.2
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.14
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.26
157 0.32
158 0.38
159 0.44
160 0.44
161 0.48
162 0.49
163 0.48
164 0.42
165 0.39
166 0.36
167 0.36
168 0.36
169 0.31
170 0.33
171 0.34
172 0.33
173 0.28
174 0.25
175 0.2
176 0.16
177 0.16
178 0.12
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.18
206 0.18
207 0.19
208 0.2
209 0.17
210 0.18
211 0.18
212 0.18
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.08
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.15
226 0.15
227 0.21
228 0.25
229 0.28
230 0.32
231 0.37
232 0.38
233 0.35
234 0.34
235 0.29
236 0.31
237 0.3
238 0.25
239 0.2
240 0.21
241 0.21
242 0.19
243 0.18
244 0.13
245 0.16
246 0.18
247 0.17
248 0.14
249 0.13
250 0.14
251 0.17
252 0.2
253 0.2
254 0.22
255 0.23
256 0.25
257 0.26
258 0.26
259 0.32
260 0.37
261 0.39
262 0.41
263 0.41
264 0.42
265 0.44
266 0.51
267 0.47
268 0.4
269 0.42
270 0.39
271 0.4
272 0.37
273 0.33
274 0.25
275 0.21
276 0.18
277 0.11
278 0.07
279 0.06
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.18
306 0.24
307 0.22
308 0.21
309 0.19
310 0.17
311 0.18
312 0.19
313 0.15
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.13
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.14
323 0.12
324 0.12
325 0.15
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.05
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.1
343 0.12
344 0.13
345 0.15
346 0.16
347 0.17
348 0.2
349 0.21
350 0.17
351 0.17
352 0.16
353 0.15
354 0.16
355 0.14
356 0.11
357 0.09
358 0.08
359 0.05
360 0.05
361 0.03
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.09
375 0.11
376 0.12
377 0.15
378 0.14
379 0.16
380 0.19
381 0.19
382 0.17
383 0.17
384 0.16
385 0.15
386 0.16
387 0.15
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.09
392 0.11
393 0.1
394 0.12
395 0.14
396 0.17
397 0.19
398 0.24
399 0.27
400 0.28
401 0.29
402 0.3
403 0.29
404 0.34
405 0.35
406 0.34
407 0.41
408 0.48
409 0.51
410 0.58
411 0.64
412 0.64
413 0.71
414 0.75
415 0.74
416 0.75
417 0.78
418 0.77
419 0.76
420 0.71
421 0.62
422 0.56
423 0.51
424 0.41
425 0.35
426 0.27
427 0.2
428 0.16
429 0.17
430 0.17
431 0.14
432 0.14
433 0.12
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.13
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.12
442 0.16
443 0.16
444 0.16
445 0.17
446 0.17
447 0.17
448 0.16
449 0.18
450 0.18
451 0.22
452 0.3
453 0.37
454 0.47
455 0.57
456 0.67
457 0.73
458 0.81
459 0.87
460 0.91
461 0.91
462 0.91
463 0.92
464 0.92
465 0.9
466 0.84
467 0.75
468 0.66
469 0.61
470 0.49
471 0.41
472 0.32
473 0.25
474 0.22
475 0.2
476 0.19
477 0.14
478 0.14
479 0.11
480 0.1
481 0.09
482 0.08
483 0.08
484 0.07
485 0.06
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.03
491 0.03
492 0.04
493 0.04
494 0.07
495 0.08
496 0.1
497 0.16
498 0.19
499 0.24
500 0.29
501 0.31
502 0.32
503 0.34
504 0.38
505 0.4
506 0.45
507 0.44
508 0.44
509 0.42
510 0.43
511 0.45
512 0.4
513 0.33
514 0.31
515 0.29
516 0.23
517 0.24
518 0.23
519 0.23
520 0.26
521 0.27
522 0.22
523 0.27
524 0.33
525 0.33
526 0.34
527 0.32
528 0.31
529 0.3
530 0.34
531 0.31
532 0.27
533 0.29
534 0.31
535 0.31
536 0.3
537 0.3
538 0.27
539 0.32
540 0.35
541 0.34
542 0.38
543 0.37
544 0.37
545 0.4
546 0.51
547 0.51
548 0.51