Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JPF5

Protein Details
Accession C4JPF5    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-159QGALYKEKPPKGQKRKKTVTIAGNVHydrophilic
316-336ELNRTNSEKKRKRTNPEHLVTHydrophilic
469-496AEKEQAIHTRKQKRHRVRQPDMVKPSKSHydrophilic
610-636REPKDGRERGRGRRRNQGADKEKKDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-151KPPKGQKRKK
325-326KR
476-500HTRKQKRHRVRQPDMVKPSKSKRKA
612-632PKDGRERGRGRRRNQGADKEK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ure:UREG_04537  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFQCEACGDVFTKKKLDPHRGQCRGASFSCLDCMVHFQGTEYRSHTGAGTNGLWAKGSSVRLAHGWMLVPASARMAVLDDSCALHGFGPLMICECATVASRIRCYWAVLGRLLRPGWSSVFRQTCMSEAQKYQGALYKEKPPKGQKRKKTVTIAGNVAEKQPRNPYVEDASDVDDVRPGRDFPPPAPSPPPATSTTQGTSTRKEDKAVNVFEYLVPDGANASKVSLGGTREQMKMVSDAPKLFDAPKELARISDGREDDESIYDVAYEENGFSYGAGPIPPALYDQPSNVSMEFMTPGHRMRNRSRRDHPPSLELNRTNSEKKRKRTNPEHLVTPANQTKYVDDVAMMDAPSSMVVNAPTPALNHSGLTGGLSQLMRYSDSPDSLDYRSDHQAGEVYPHPVSPIKRTRRANKDQNGDNGLGISVKGRTGKLMEILGGGSGTTTVAGVSNDPTMKALLRTRRRTSPDAEKEQAIHTRKQKRHRVRQPDMVKPSKSKRKASGSPAANGDDADWDDYDDERPREIKAIEYNPNGDSETGASSKAGDPAAQLVVYKQGQNYSGELEPLKREKANLFLSLVNKGPDSERGCSIHKILKRFHRDQNLSVGSEEREPKDGRERGRGRRRNQGADKEKKDEEEQELWRMLRLRKNDRGEVVVFLQPDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.41
4 0.49
5 0.58
6 0.61
7 0.66
8 0.74
9 0.78
10 0.79
11 0.76
12 0.72
13 0.67
14 0.58
15 0.52
16 0.43
17 0.37
18 0.35
19 0.31
20 0.26
21 0.2
22 0.24
23 0.22
24 0.21
25 0.19
26 0.18
27 0.23
28 0.24
29 0.27
30 0.25
31 0.24
32 0.23
33 0.24
34 0.23
35 0.2
36 0.2
37 0.21
38 0.19
39 0.2
40 0.21
41 0.2
42 0.2
43 0.17
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.18
48 0.18
49 0.19
50 0.2
51 0.22
52 0.21
53 0.18
54 0.17
55 0.15
56 0.15
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.12
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.12
87 0.15
88 0.19
89 0.22
90 0.22
91 0.26
92 0.26
93 0.27
94 0.3
95 0.29
96 0.29
97 0.3
98 0.33
99 0.31
100 0.35
101 0.33
102 0.29
103 0.25
104 0.24
105 0.23
106 0.23
107 0.24
108 0.29
109 0.32
110 0.32
111 0.34
112 0.32
113 0.3
114 0.32
115 0.33
116 0.29
117 0.27
118 0.29
119 0.3
120 0.29
121 0.29
122 0.28
123 0.28
124 0.27
125 0.29
126 0.36
127 0.4
128 0.44
129 0.51
130 0.57
131 0.65
132 0.72
133 0.79
134 0.79
135 0.83
136 0.88
137 0.89
138 0.88
139 0.85
140 0.82
141 0.77
142 0.71
143 0.62
144 0.56
145 0.48
146 0.42
147 0.38
148 0.3
149 0.27
150 0.31
151 0.32
152 0.33
153 0.34
154 0.34
155 0.34
156 0.35
157 0.34
158 0.28
159 0.27
160 0.24
161 0.23
162 0.19
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.13
168 0.13
169 0.18
170 0.2
171 0.19
172 0.28
173 0.28
174 0.31
175 0.34
176 0.34
177 0.35
178 0.35
179 0.37
180 0.31
181 0.34
182 0.32
183 0.32
184 0.31
185 0.3
186 0.34
187 0.32
188 0.33
189 0.34
190 0.4
191 0.37
192 0.38
193 0.36
194 0.38
195 0.44
196 0.42
197 0.39
198 0.32
199 0.32
200 0.3
201 0.28
202 0.21
203 0.13
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.12
217 0.16
218 0.19
219 0.2
220 0.2
221 0.2
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.17
227 0.17
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.18
232 0.17
233 0.15
234 0.16
235 0.18
236 0.19
237 0.19
238 0.18
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.22
243 0.19
244 0.18
245 0.19
246 0.2
247 0.18
248 0.18
249 0.16
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.11
287 0.16
288 0.2
289 0.24
290 0.33
291 0.42
292 0.47
293 0.54
294 0.6
295 0.66
296 0.71
297 0.75
298 0.68
299 0.65
300 0.64
301 0.6
302 0.59
303 0.49
304 0.43
305 0.38
306 0.38
307 0.37
308 0.37
309 0.43
310 0.45
311 0.5
312 0.59
313 0.64
314 0.71
315 0.76
316 0.81
317 0.8
318 0.75
319 0.72
320 0.63
321 0.58
322 0.48
323 0.43
324 0.36
325 0.27
326 0.24
327 0.21
328 0.19
329 0.18
330 0.18
331 0.12
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.07
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.05
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.12
368 0.11
369 0.12
370 0.13
371 0.13
372 0.16
373 0.15
374 0.17
375 0.14
376 0.17
377 0.19
378 0.19
379 0.18
380 0.15
381 0.16
382 0.14
383 0.17
384 0.15
385 0.14
386 0.13
387 0.13
388 0.14
389 0.15
390 0.17
391 0.21
392 0.3
393 0.36
394 0.44
395 0.52
396 0.61
397 0.68
398 0.77
399 0.79
400 0.77
401 0.78
402 0.74
403 0.72
404 0.66
405 0.56
406 0.46
407 0.36
408 0.27
409 0.19
410 0.14
411 0.09
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.11
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.04
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.06
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.13
444 0.18
445 0.25
446 0.35
447 0.43
448 0.48
449 0.55
450 0.61
451 0.62
452 0.63
453 0.65
454 0.65
455 0.64
456 0.62
457 0.55
458 0.5
459 0.49
460 0.5
461 0.43
462 0.4
463 0.41
464 0.48
465 0.54
466 0.63
467 0.7
468 0.74
469 0.81
470 0.85
471 0.88
472 0.85
473 0.89
474 0.87
475 0.86
476 0.84
477 0.8
478 0.73
479 0.7
480 0.72
481 0.72
482 0.71
483 0.69
484 0.69
485 0.71
486 0.75
487 0.76
488 0.75
489 0.69
490 0.65
491 0.61
492 0.54
493 0.44
494 0.36
495 0.28
496 0.2
497 0.17
498 0.14
499 0.11
500 0.09
501 0.09
502 0.1
503 0.13
504 0.16
505 0.16
506 0.17
507 0.18
508 0.18
509 0.22
510 0.21
511 0.23
512 0.26
513 0.32
514 0.37
515 0.39
516 0.41
517 0.37
518 0.38
519 0.34
520 0.26
521 0.2
522 0.14
523 0.14
524 0.13
525 0.12
526 0.11
527 0.12
528 0.13
529 0.15
530 0.14
531 0.11
532 0.11
533 0.14
534 0.15
535 0.13
536 0.12
537 0.1
538 0.16
539 0.17
540 0.18
541 0.17
542 0.18
543 0.2
544 0.22
545 0.22
546 0.2
547 0.19
548 0.2
549 0.2
550 0.2
551 0.24
552 0.26
553 0.28
554 0.25
555 0.27
556 0.28
557 0.34
558 0.36
559 0.34
560 0.32
561 0.33
562 0.34
563 0.34
564 0.34
565 0.27
566 0.23
567 0.21
568 0.2
569 0.24
570 0.26
571 0.26
572 0.29
573 0.31
574 0.35
575 0.37
576 0.39
577 0.39
578 0.39
579 0.42
580 0.46
581 0.52
582 0.59
583 0.63
584 0.68
585 0.72
586 0.73
587 0.7
588 0.72
589 0.67
590 0.58
591 0.52
592 0.45
593 0.35
594 0.36
595 0.38
596 0.29
597 0.3
598 0.3
599 0.34
600 0.41
601 0.46
602 0.45
603 0.51
604 0.58
605 0.63
606 0.73
607 0.78
608 0.74
609 0.79
610 0.83
611 0.82
612 0.83
613 0.84
614 0.83
615 0.85
616 0.86
617 0.82
618 0.76
619 0.69
620 0.64
621 0.59
622 0.55
623 0.52
624 0.49
625 0.48
626 0.49
627 0.45
628 0.44
629 0.44
630 0.43
631 0.42
632 0.48
633 0.52
634 0.58
635 0.66
636 0.69
637 0.67
638 0.66
639 0.61
640 0.55
641 0.49
642 0.43