Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JGV6

Protein Details
Accession C4JGV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-398AEARKAKDREWWARLRRVRQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
382-412RKAKDREWWARLRRVRQALQVKGPKKNKGPP
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG ure:UREG_01207  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYALASKKRKFHRVLESLSSNNTAPKAPHAASKNTATTPKSVHPTIKRVRLTPNSEPDDTAVHASQSPLAGRSSTSSARPSFVPWDRDRFLERLETFRRVDRWSPKPDDINEVQWAKRGWSCVDVMRVECVGGCGHSVVVKLPDEIDELEEYDTEKMEERKQVHTIQRLDLAKPDHALKGLKDRYVKLCSLAQKLPARERIVLPENMNLDELIKMIPLEDLSASQLQTGSTHAGKESLQNVEGETGRQAGQATQTPINQPALSLALFGWDLCGDMHAGLASCNACFRRLGLWMYNPKEDGSSSIYPNLDVVNEHLDYCPWINAATQSGTQKKPGQAAGWEILERVIRNLYRRKTWSAEPTASVLDDQDENQDSKEVDAEARKAKDREWWARLRRVRQALQVKGPKKNKGPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.77
3 0.76
4 0.73
5 0.66
6 0.62
7 0.55
8 0.45
9 0.39
10 0.33
11 0.27
12 0.22
13 0.25
14 0.29
15 0.27
16 0.34
17 0.36
18 0.4
19 0.43
20 0.48
21 0.47
22 0.44
23 0.49
24 0.43
25 0.42
26 0.41
27 0.43
28 0.44
29 0.43
30 0.48
31 0.49
32 0.57
33 0.62
34 0.67
35 0.64
36 0.62
37 0.68
38 0.68
39 0.69
40 0.68
41 0.69
42 0.66
43 0.62
44 0.59
45 0.51
46 0.44
47 0.37
48 0.31
49 0.22
50 0.17
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.15
61 0.18
62 0.19
63 0.21
64 0.25
65 0.26
66 0.27
67 0.27
68 0.27
69 0.31
70 0.35
71 0.4
72 0.38
73 0.45
74 0.45
75 0.47
76 0.47
77 0.41
78 0.36
79 0.37
80 0.35
81 0.35
82 0.38
83 0.4
84 0.38
85 0.41
86 0.42
87 0.38
88 0.45
89 0.46
90 0.5
91 0.53
92 0.58
93 0.59
94 0.61
95 0.59
96 0.58
97 0.51
98 0.47
99 0.45
100 0.41
101 0.36
102 0.33
103 0.32
104 0.26
105 0.26
106 0.24
107 0.19
108 0.19
109 0.21
110 0.2
111 0.24
112 0.24
113 0.22
114 0.21
115 0.2
116 0.17
117 0.15
118 0.13
119 0.09
120 0.07
121 0.07
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.09
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.09
144 0.1
145 0.13
146 0.18
147 0.2
148 0.23
149 0.27
150 0.33
151 0.37
152 0.42
153 0.42
154 0.38
155 0.42
156 0.4
157 0.37
158 0.34
159 0.3
160 0.24
161 0.22
162 0.22
163 0.16
164 0.17
165 0.17
166 0.15
167 0.22
168 0.24
169 0.26
170 0.27
171 0.29
172 0.32
173 0.35
174 0.34
175 0.27
176 0.28
177 0.29
178 0.31
179 0.3
180 0.32
181 0.32
182 0.34
183 0.36
184 0.38
185 0.36
186 0.33
187 0.32
188 0.31
189 0.31
190 0.3
191 0.27
192 0.24
193 0.23
194 0.21
195 0.21
196 0.15
197 0.12
198 0.09
199 0.09
200 0.06
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.12
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.14
231 0.11
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.1
239 0.13
240 0.16
241 0.16
242 0.18
243 0.18
244 0.2
245 0.21
246 0.19
247 0.15
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.12
276 0.15
277 0.19
278 0.2
279 0.27
280 0.35
281 0.38
282 0.39
283 0.37
284 0.34
285 0.32
286 0.28
287 0.23
288 0.21
289 0.21
290 0.2
291 0.23
292 0.23
293 0.22
294 0.22
295 0.2
296 0.14
297 0.11
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.13
302 0.12
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.13
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.11
311 0.13
312 0.13
313 0.16
314 0.21
315 0.27
316 0.28
317 0.33
318 0.37
319 0.38
320 0.41
321 0.4
322 0.37
323 0.33
324 0.36
325 0.35
326 0.31
327 0.28
328 0.23
329 0.22
330 0.21
331 0.19
332 0.16
333 0.18
334 0.18
335 0.25
336 0.34
337 0.38
338 0.45
339 0.5
340 0.54
341 0.54
342 0.59
343 0.62
344 0.62
345 0.59
346 0.53
347 0.5
348 0.45
349 0.41
350 0.33
351 0.24
352 0.17
353 0.15
354 0.13
355 0.15
356 0.16
357 0.17
358 0.17
359 0.19
360 0.17
361 0.17
362 0.18
363 0.15
364 0.16
365 0.19
366 0.24
367 0.29
368 0.33
369 0.39
370 0.38
371 0.39
372 0.44
373 0.5
374 0.55
375 0.56
376 0.62
377 0.64
378 0.73
379 0.8
380 0.8
381 0.8
382 0.79
383 0.76
384 0.76
385 0.77
386 0.75
387 0.77
388 0.79
389 0.76
390 0.77
391 0.79
392 0.78