Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JGQ0

Protein Details
Accession C4JGQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-332YIPRIRTQTPDSTRRRRRRKQALSHDVPSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
316-322RRRRRRK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 3, mito 2, vacu 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
KEGG ure:UREG_02562  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22584  Rcat_RBR_unk  
Amino Acid Sequences MSVSDPQHMPPRCCTNDHIPLKHVDKLFDTKFKNTWNRKYQEYTTKNRLYCPSRGCGEWIKPNQIYLDTGNGPTGGRKYGKCSKCKTKVCVLCNGKMHRARDCPKDEDTKKFNDIAKDAGWKRCYNCSAMVELKEGCNHMTCRCTAEFCIICGAKWKTCECPWFNYTTVHDDDILENMNIPQARREAVPDNEDHRGPIRYQQEMDRRREQEQEDEVLARRLQQVFGFQEEDDDDDSTYDYRPNNGQRALPDRDENSFPPIYDNFYLPSRPSGAHTPPPPDYQTPRSHLLLEDPAVSSRHEISYIPRIRTQTPDSTRRRRRRKQALSHDVPSSPSRVEHWRMGLNLLSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.55
3 0.6
4 0.66
5 0.62
6 0.55
7 0.59
8 0.59
9 0.6
10 0.52
11 0.44
12 0.4
13 0.44
14 0.47
15 0.47
16 0.47
17 0.46
18 0.48
19 0.55
20 0.61
21 0.62
22 0.67
23 0.69
24 0.7
25 0.71
26 0.74
27 0.73
28 0.74
29 0.72
30 0.7
31 0.7
32 0.74
33 0.69
34 0.67
35 0.67
36 0.61
37 0.61
38 0.57
39 0.53
40 0.48
41 0.47
42 0.46
43 0.45
44 0.46
45 0.48
46 0.49
47 0.5
48 0.48
49 0.48
50 0.45
51 0.39
52 0.35
53 0.27
54 0.27
55 0.2
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.17
62 0.16
63 0.18
64 0.18
65 0.26
66 0.36
67 0.43
68 0.49
69 0.56
70 0.63
71 0.7
72 0.77
73 0.75
74 0.75
75 0.77
76 0.72
77 0.74
78 0.68
79 0.64
80 0.63
81 0.62
82 0.6
83 0.57
84 0.55
85 0.52
86 0.55
87 0.55
88 0.56
89 0.58
90 0.54
91 0.53
92 0.61
93 0.58
94 0.58
95 0.56
96 0.52
97 0.49
98 0.5
99 0.48
100 0.41
101 0.38
102 0.33
103 0.3
104 0.33
105 0.34
106 0.35
107 0.35
108 0.34
109 0.35
110 0.39
111 0.39
112 0.33
113 0.34
114 0.3
115 0.3
116 0.31
117 0.29
118 0.24
119 0.23
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.15
128 0.14
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.16
133 0.21
134 0.2
135 0.18
136 0.23
137 0.19
138 0.18
139 0.23
140 0.25
141 0.2
142 0.22
143 0.23
144 0.23
145 0.26
146 0.33
147 0.29
148 0.33
149 0.33
150 0.33
151 0.33
152 0.31
153 0.3
154 0.27
155 0.26
156 0.21
157 0.19
158 0.16
159 0.15
160 0.13
161 0.13
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.12
173 0.15
174 0.17
175 0.19
176 0.2
177 0.22
178 0.23
179 0.23
180 0.2
181 0.18
182 0.17
183 0.16
184 0.2
185 0.21
186 0.2
187 0.22
188 0.28
189 0.36
190 0.42
191 0.48
192 0.49
193 0.48
194 0.49
195 0.53
196 0.48
197 0.44
198 0.4
199 0.36
200 0.29
201 0.28
202 0.26
203 0.23
204 0.21
205 0.16
206 0.16
207 0.14
208 0.14
209 0.13
210 0.17
211 0.17
212 0.19
213 0.19
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.16
218 0.13
219 0.12
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.17
229 0.22
230 0.28
231 0.29
232 0.31
233 0.33
234 0.39
235 0.42
236 0.39
237 0.37
238 0.33
239 0.34
240 0.35
241 0.32
242 0.31
243 0.27
244 0.24
245 0.24
246 0.22
247 0.24
248 0.22
249 0.21
250 0.18
251 0.2
252 0.21
253 0.18
254 0.2
255 0.18
256 0.17
257 0.2
258 0.24
259 0.28
260 0.34
261 0.37
262 0.4
263 0.42
264 0.45
265 0.45
266 0.44
267 0.45
268 0.44
269 0.48
270 0.47
271 0.49
272 0.46
273 0.44
274 0.39
275 0.37
276 0.34
277 0.28
278 0.25
279 0.21
280 0.21
281 0.21
282 0.2
283 0.18
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.14
288 0.18
289 0.28
290 0.34
291 0.35
292 0.38
293 0.4
294 0.42
295 0.48
296 0.49
297 0.49
298 0.51
299 0.57
300 0.63
301 0.71
302 0.79
303 0.83
304 0.89
305 0.89
306 0.92
307 0.93
308 0.94
309 0.94
310 0.95
311 0.95
312 0.92
313 0.87
314 0.8
315 0.69
316 0.62
317 0.53
318 0.44
319 0.34
320 0.27
321 0.26
322 0.3
323 0.34
324 0.37
325 0.4
326 0.42
327 0.42
328 0.43