FuNGI

C4JMS9

Protein Details

Accession

C4JMS9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
339-371	ALARLGKGQKHKPRWQNKNKNRHKKTNGSTEDV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
294-303	KRARAAAERR
344-363	GKGQKHKPRWQNKNKNRHKK

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 13, cyto 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039905 CD2BP2/Lin1 IPR003169 GYF IPR035445 GYF-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005682 C:U5 snRNP
KEGG	ure:UREG_04137 -
Pfam	View protein in Pfam PF02213 GYF
PROSITE	View protein in PROSITE PS50829 GYF

Amino Acid Sequences

MYFEKHRDQAASLRDSIDSIHRTDEGVAFVVIAALKLRKHGGVNVGMISNTLARPKRAAEDYARHHHAEQDPDGPSSSKKLRFDLRNPSTLAPDTNEEDVVLDADEIGRRGQRIKRNAVNIDGYDSDSENENFNARAEARGGSSKAPNDLDEDDMFAEVEEETGLPDDDIGKTRKQVRFLDDNEIEGQVNESRSGGKVILDDMSSNKKGKQKETEAEESDSDTDDEGRADISGVDKELGAGGKKTHAPRLDAFNMRSEQEEGRFDESGNYIRKAVDPDAVHDSWLEGVSKKDMKRARAAAERREEERRQKSIADASVLTSDVLEVLITNLQRGETILEALARLGKGQKHKPRWQNKNKNRHKKTNGSTEDVEMTEEDPAEVTRKQTIEKITGAADILLSRGQTDIYDAERELLTRQYQRETGEAWVDPAHLGSAEPDLDNNTMWEFRWSDARDGGVIHGPYEKAMMESWSSAGYFGGTGAEFRRVGSTSDWSGVAPFL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.32
3	0.31
4	0.31
5	0.26
6	0.22
7	0.23
8	0.22
9	0.23
10	0.25
11	0.25
12	0.19
13	0.17
14	0.16
15	0.13
16	0.12
17	0.12
18	0.1
19	0.08
20	0.09
21	0.1
22	0.1
23	0.13
24	0.15
25	0.17
26	0.19
27	0.23
28	0.28
29	0.3
30	0.32
31	0.32
32	0.3
33	0.27
34	0.25
35	0.22
36	0.18
37	0.14
38	0.19
39	0.19
40	0.2
41	0.23
42	0.25
43	0.31
44	0.33
45	0.37
46	0.38
47	0.45
48	0.51
49	0.58
50	0.59
51	0.54
52	0.51
53	0.53
54	0.5
55	0.47
56	0.42
57	0.39
58	0.36
59	0.35
60	0.36
61	0.31
62	0.27
63	0.27
64	0.32
65	0.33
66	0.34
67	0.39
68	0.47
69	0.54
70	0.61
71	0.66
72	0.64
73	0.63
74	0.62
75	0.58
76	0.53
77	0.46
78	0.39
79	0.31
80	0.28
81	0.25
82	0.24
83	0.22
84	0.18
85	0.17
86	0.15
87	0.13
88	0.09
89	0.06
90	0.05
91	0.06
92	0.07
93	0.07
94	0.08
95	0.09
96	0.1
97	0.16
98	0.23
99	0.31
100	0.39
101	0.47
102	0.53
103	0.6
104	0.62
105	0.6
106	0.57
107	0.49
108	0.44
109	0.36
110	0.3
111	0.23
112	0.2
113	0.17
114	0.15
115	0.15
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.12
120	0.12
121	0.13
122	0.11
123	0.12
124	0.12
125	0.12
126	0.13
127	0.16
128	0.17
129	0.17
130	0.2
131	0.21
132	0.23
133	0.23
134	0.21
135	0.21
136	0.21
137	0.21
138	0.18
139	0.18
140	0.15
141	0.14
142	0.13
143	0.09
144	0.08
145	0.05
146	0.05
147	0.04
148	0.04
149	0.04
150	0.04
151	0.05
152	0.04
153	0.04
154	0.05
155	0.06
156	0.1
157	0.12
158	0.12
159	0.17
160	0.26
161	0.28
162	0.34
163	0.37
164	0.4
165	0.45
166	0.47
167	0.52
168	0.44
169	0.43
170	0.37
171	0.34
172	0.28
173	0.2
174	0.18
175	0.11
176	0.11
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.09
181	0.1
182	0.09
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.15
191	0.16
192	0.17
193	0.2
194	0.24
195	0.28
196	0.33
197	0.4
198	0.42
199	0.46
200	0.52
201	0.54
202	0.52
203	0.5
204	0.44
205	0.37
206	0.29
207	0.24
208	0.17
209	0.11
210	0.08
211	0.07
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.06
228	0.06
229	0.08
230	0.12
231	0.13
232	0.18
233	0.19
234	0.21
235	0.23
236	0.29
237	0.32
238	0.32
239	0.32
240	0.31
241	0.3
242	0.28
243	0.27
244	0.22
245	0.17
246	0.16
247	0.17
248	0.15
249	0.16
250	0.16
251	0.15
252	0.15
253	0.15
254	0.18
255	0.18
256	0.17
257	0.15
258	0.15
259	0.16
260	0.18
261	0.18
262	0.18
263	0.16
264	0.18
265	0.23
266	0.23
267	0.21
268	0.19
269	0.18
270	0.13
271	0.13
272	0.11
273	0.06
274	0.07
275	0.1
276	0.16
277	0.16
278	0.22
279	0.26
280	0.28
281	0.35
282	0.38
283	0.4
284	0.45
285	0.49
286	0.5
287	0.54
288	0.54
289	0.51
290	0.53
291	0.52
292	0.53
293	0.55
294	0.51
295	0.45
296	0.43
297	0.42
298	0.4
299	0.37
300	0.29
301	0.22
302	0.2
303	0.19
304	0.18
305	0.15
306	0.1
307	0.08
308	0.06
309	0.05
310	0.04
311	0.03
312	0.03
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.07
329	0.07
330	0.1
331	0.13
332	0.21
333	0.31
334	0.4
335	0.49
336	0.58
337	0.68
338	0.76
339	0.83
340	0.87
341	0.89
342	0.9
343	0.91
344	0.93
345	0.94
346	0.93
347	0.93
348	0.9
349	0.89
350	0.87
351	0.87
352	0.81
353	0.76
354	0.68
355	0.59
356	0.52
357	0.42
358	0.34
359	0.23
360	0.18
361	0.13
362	0.11
363	0.09
364	0.07
365	0.07
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.14
370	0.15
371	0.17
372	0.21
373	0.25
374	0.26
375	0.27
376	0.27
377	0.24
378	0.23
379	0.22
380	0.17
381	0.14
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.07
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.08
391	0.09
392	0.11
393	0.13
394	0.13
395	0.14
396	0.14
397	0.15
398	0.14
399	0.16
400	0.19
401	0.23
402	0.25
403	0.28
404	0.31
405	0.32
406	0.33
407	0.31
408	0.29
409	0.28
410	0.25
411	0.22
412	0.2
413	0.19
414	0.17
415	0.15
416	0.12
417	0.08
418	0.08
419	0.07
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.12
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.12
429	0.12
430	0.13
431	0.16
432	0.15
433	0.15
434	0.24
435	0.25
436	0.27
437	0.29
438	0.29
439	0.26
440	0.26
441	0.27
442	0.24
443	0.22
444	0.19
445	0.2
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.16
450	0.11
451	0.12
452	0.13
453	0.12
454	0.13
455	0.14
456	0.14
457	0.14
458	0.12
459	0.12
460	0.1
461	0.08
462	0.07
463	0.08
464	0.07
465	0.09
466	0.1
467	0.15
468	0.14
469	0.15
470	0.18
471	0.18
472	0.2
473	0.22
474	0.26
475	0.25
476	0.27
477	0.27
478	0.24

C4JMS9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer