FuNGI

C4JIA9

Protein Details

Accession

C4JIA9

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-75	TNDSDSKKDRSDRRDRDRYRDGSRDRDRDRRRRDRSRERRSERDADG	Basic
87-121	ASANGSYRSRKRSRSRDSDRRRSRRDRYGDDHRSS	Basic
149-187	GRPRRDDDRDDDKRRRREKEGRKRSPSPKPRSKTPEPQL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
36-69	KDRSDRRDRDRYRDGSRDRDRDRRRRDRSRERRS
94-113	RSRKRSRSRDSDRRRSRRDR
130-135	GRARSR
149-181	GRPRRDDDRDDDKRRRREKEGRKRSPSPKPRSK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	ure:UREG_02855 -
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12283 RRM1_RBM39_like cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MSGIDVEALLESTAEPGPKQQPEQPASQTNDSDSKKDRSDRRDRDRYRDGSRDRDRDRRRRDRSRERRSERDADGDEEMTSPKSDRASANGSYRSRKRSRSRDSDRRRSRRDRYGDDHRSSGGDFYRGPGRARSRSRSPYDDRYYRPTGRPRRDDDRDDDKRRRREKEGRKRSPSPKPRSKTPEPQLTEDERDKRTVFVQQLAARLRTKELIAFFEKAGPVKDAQIVKDRVSGRSKGVGYVEFKNEESVPVAIQLTGQKLLGIPIIAQFTEAEKNKAARNAEGHVSGNQNSIPFHRLYVGNIHFSITESDLQNVFEPFGELDFVQLQKDENGRSRGYGFVQFRDPNQAREALEKMNGFDLAGRPIRVGLGNDKFSSDSATNLMRLQSQGQQGSLYGQGGRGTQAASNFDRAGGRDNDKGIGGASALDDTDVAGVNFNNYSRDALMRKLARTDEPAADTSTDDKRKAPKARTEAKPLPVSVNMASRCVLLRNMFDPTEEEGDSWVKELEDDVRAECEEKYGHVVHIALDPNTQGDIYLKFDRVQGGENAIKGLNGRFFGGRQITAQPVVDAVYSSLFSRTKAI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.1
3	0.15
4	0.23
5	0.27
6	0.31
7	0.35
8	0.43
9	0.47
10	0.53
11	0.54
12	0.55
13	0.56
14	0.57
15	0.52
16	0.47
17	0.52
18	0.48
19	0.47
20	0.44
21	0.45
22	0.47
23	0.54
24	0.59
25	0.6
26	0.7
27	0.75
28	0.8
29	0.85
30	0.84
31	0.85
32	0.87
33	0.84
34	0.81
35	0.81
36	0.77
37	0.76
38	0.79
39	0.8
40	0.77
41	0.8
42	0.82
43	0.83
44	0.87
45	0.87
46	0.88
47	0.89
48	0.93
49	0.94
50	0.94
51	0.95
52	0.95
53	0.93
54	0.92
55	0.89
56	0.87
57	0.79
58	0.76
59	0.68
60	0.6
61	0.54
62	0.44
63	0.36
64	0.29
65	0.26
66	0.18
67	0.16
68	0.14
69	0.13
70	0.14
71	0.17
72	0.17
73	0.22
74	0.26
75	0.3
76	0.36
77	0.41
78	0.44
79	0.49
80	0.54
81	0.59
82	0.61
83	0.66
84	0.69
85	0.72
86	0.79
87	0.82
88	0.86
89	0.88
90	0.92
91	0.93
92	0.94
93	0.93
94	0.93
95	0.92
96	0.9
97	0.9
98	0.88
99	0.86
100	0.83
101	0.84
102	0.84
103	0.77
104	0.69
105	0.6
106	0.51
107	0.43
108	0.38
109	0.28
110	0.2
111	0.17
112	0.17
113	0.23
114	0.24
115	0.25
116	0.29
117	0.34
118	0.41
119	0.48
120	0.53
121	0.56
122	0.63
123	0.68
124	0.69
125	0.69
126	0.7
127	0.72
128	0.72
129	0.66
130	0.65
131	0.66
132	0.63
133	0.64
134	0.64
135	0.65
136	0.68
137	0.72
138	0.72
139	0.74
140	0.76
141	0.75
142	0.72
143	0.72
144	0.73
145	0.73
146	0.76
147	0.76
148	0.78
149	0.81
150	0.79
151	0.78
152	0.79
153	0.82
154	0.83
155	0.85
156	0.86
157	0.87
158	0.9
159	0.89
160	0.89
161	0.89
162	0.88
163	0.87
164	0.82
165	0.83
166	0.83
167	0.82
168	0.82
169	0.8
170	0.79
171	0.72
172	0.71
173	0.66
174	0.62
175	0.58
176	0.54
177	0.51
178	0.42
179	0.41
180	0.37
181	0.32
182	0.3
183	0.3
184	0.26
185	0.24
186	0.28
187	0.28
188	0.33
189	0.34
190	0.35
191	0.31
192	0.29
193	0.27
194	0.22
195	0.2
196	0.18
197	0.17
198	0.18
199	0.2
200	0.21
201	0.19
202	0.2
203	0.21
204	0.18
205	0.18
206	0.15
207	0.12
208	0.12
209	0.17
210	0.16
211	0.17
212	0.24
213	0.25
214	0.25
215	0.3
216	0.3
217	0.3
218	0.33
219	0.33
220	0.27
221	0.31
222	0.3
223	0.26
224	0.26
225	0.25
226	0.24
227	0.25
228	0.26
229	0.21
230	0.21
231	0.21
232	0.19
233	0.17
234	0.14
235	0.11
236	0.09
237	0.08
238	0.08
239	0.07
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.06
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.06
256	0.07
257	0.13
258	0.13
259	0.13
260	0.14
261	0.16
262	0.17
263	0.21
264	0.21
265	0.17
266	0.19
267	0.19
268	0.19
269	0.19
270	0.18
271	0.17
272	0.17
273	0.16
274	0.15
275	0.13
276	0.12
277	0.11
278	0.11
279	0.12
280	0.1
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.18
286	0.19
287	0.18
288	0.18
289	0.18
290	0.16
291	0.16
292	0.16
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.11
297	0.11
298	0.12
299	0.12
300	0.11
301	0.1
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.07
311	0.06
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.11
316	0.12
317	0.16
318	0.19
319	0.19
320	0.2
321	0.2
322	0.2
323	0.2
324	0.25
325	0.22
326	0.2
327	0.26
328	0.25
329	0.25
330	0.34
331	0.33
332	0.28
333	0.28
334	0.29
335	0.25
336	0.26
337	0.28
338	0.19
339	0.21
340	0.19
341	0.18
342	0.16
343	0.15
344	0.12
345	0.11
346	0.11
347	0.12
348	0.13
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.13
353	0.12
354	0.13
355	0.15
356	0.19
357	0.21
358	0.21
359	0.22
360	0.22
361	0.21
362	0.23
363	0.16
364	0.12
365	0.12
366	0.13
367	0.13
368	0.14
369	0.14
370	0.12
371	0.12
372	0.14
373	0.17
374	0.2
375	0.2
376	0.19
377	0.19
378	0.18
379	0.19
380	0.17
381	0.13
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.11
391	0.15
392	0.15
393	0.17
394	0.16
395	0.17
396	0.17
397	0.16
398	0.2
399	0.2
400	0.22
401	0.22
402	0.23
403	0.23
404	0.22
405	0.22
406	0.17
407	0.13
408	0.09
409	0.07
410	0.06
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.04
415	0.04
416	0.05
417	0.05
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.06
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.09
426	0.1
427	0.11
428	0.15
429	0.15
430	0.17
431	0.24
432	0.27
433	0.27
434	0.3
435	0.31
436	0.3
437	0.34
438	0.36
439	0.31
440	0.31
441	0.31
442	0.28
443	0.26
444	0.24
445	0.23
446	0.27
447	0.27
448	0.25
449	0.28
450	0.34
451	0.43
452	0.51
453	0.55
454	0.57
455	0.63
456	0.72
457	0.75
458	0.77
459	0.75
460	0.74
461	0.7
462	0.62
463	0.55
464	0.47
465	0.43
466	0.35
467	0.35
468	0.29
469	0.26
470	0.25
471	0.22
472	0.21
473	0.2
474	0.21
475	0.16
476	0.19
477	0.2
478	0.23
479	0.23
480	0.23
481	0.23
482	0.24
483	0.25
484	0.22
485	0.2
486	0.18
487	0.19
488	0.19
489	0.17
490	0.14
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.12
495	0.14
496	0.15
497	0.15
498	0.16
499	0.17
500	0.18
501	0.17
502	0.16
503	0.14
504	0.14
505	0.18
506	0.17
507	0.17
508	0.18
509	0.18
510	0.17
511	0.21
512	0.23
513	0.19
514	0.18
515	0.18
516	0.17
517	0.17
518	0.15
519	0.1
520	0.1
521	0.11
522	0.16
523	0.2
524	0.21
525	0.21
526	0.23
527	0.26
528	0.26
529	0.27
530	0.24
531	0.27
532	0.28
533	0.27
534	0.27
535	0.24
536	0.23
537	0.21
538	0.22
539	0.19
540	0.17
541	0.19
542	0.18
543	0.19
544	0.26
545	0.28
546	0.26
547	0.25
548	0.28
549	0.3
550	0.31
551	0.31
552	0.24
553	0.2
554	0.2
555	0.17
556	0.14
557	0.11
558	0.1
559	0.1
560	0.11
561	0.15
562	0.15

C4JIA9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer