Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JHC3

Protein Details
Accession C4JHC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-405KDSAKESKKRRGGPGAQAGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
392-397SKKRRG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003822  PAH  
IPR036600  PAH_sf  
IPR039774  Sin3-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
KEGG ure:UREG_02696  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02671  PAH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51477  PAH  
Amino Acid Sequences MAPNTQDALSYLDQVKVRFVEQPDVYNRFLDIMKDFKSQAIDTPGVIQRVSTLFNGHPSLIQGFNTFLPPGYRIECGPDDNPDAIRVTTPSGTNTISMSATRPSLESANEPGQSGGLVPSGHTEYYEQSRPGWQAGHGQQQPAQGPMPSAVRSYSPSGRIVPQPQYGPQNAQGQHQEGSYEYQNQHEQPTPATTAAMLHQQEQRGVSQLQNAVSVATGGAGRSVLQLPPTSSQTPGPNQPANSLAGLGSGGLPGGQSEATRRGPVEFNHAISYVNKIKNRFADSPEIYKQFLEILQTYQRESKPIQDVYAQVTVLFNSAPDLLEDFKQFLPESAAQAKVQGPVRQDEVPIAMSNVRGEPGYGAAGLQGQSSRDNVKMPPLGQFNVKDSAKESKKRRGGPGAQAGGAAMGGAGPLDASSVGGGNKAQASQIGNVNKVRRFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.25
4 0.25
5 0.27
6 0.28
7 0.32
8 0.32
9 0.38
10 0.42
11 0.45
12 0.45
13 0.39
14 0.37
15 0.31
16 0.29
17 0.25
18 0.21
19 0.22
20 0.24
21 0.27
22 0.27
23 0.27
24 0.3
25 0.28
26 0.29
27 0.3
28 0.28
29 0.25
30 0.31
31 0.32
32 0.29
33 0.28
34 0.23
35 0.2
36 0.2
37 0.22
38 0.17
39 0.17
40 0.16
41 0.21
42 0.23
43 0.21
44 0.2
45 0.2
46 0.22
47 0.2
48 0.19
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.17
53 0.15
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.16
61 0.21
62 0.23
63 0.25
64 0.25
65 0.26
66 0.27
67 0.27
68 0.27
69 0.23
70 0.22
71 0.18
72 0.18
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.19
95 0.23
96 0.23
97 0.23
98 0.21
99 0.19
100 0.17
101 0.15
102 0.11
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.17
113 0.21
114 0.19
115 0.19
116 0.22
117 0.23
118 0.24
119 0.22
120 0.18
121 0.23
122 0.26
123 0.35
124 0.33
125 0.32
126 0.34
127 0.36
128 0.36
129 0.29
130 0.26
131 0.17
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.15
140 0.18
141 0.2
142 0.2
143 0.21
144 0.23
145 0.25
146 0.28
147 0.3
148 0.31
149 0.31
150 0.3
151 0.31
152 0.33
153 0.32
154 0.3
155 0.3
156 0.33
157 0.3
158 0.32
159 0.31
160 0.28
161 0.28
162 0.25
163 0.21
164 0.14
165 0.16
166 0.14
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.19
171 0.19
172 0.21
173 0.21
174 0.21
175 0.17
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.15
180 0.12
181 0.1
182 0.1
183 0.14
184 0.12
185 0.13
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.17
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.14
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.14
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.1
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.16
220 0.19
221 0.21
222 0.24
223 0.27
224 0.26
225 0.26
226 0.26
227 0.25
228 0.23
229 0.2
230 0.16
231 0.1
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.05
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.06
245 0.1
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.15
250 0.17
251 0.18
252 0.25
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.23
257 0.21
258 0.19
259 0.24
260 0.23
261 0.27
262 0.28
263 0.29
264 0.32
265 0.36
266 0.43
267 0.4
268 0.36
269 0.4
270 0.4
271 0.44
272 0.45
273 0.42
274 0.36
275 0.33
276 0.3
277 0.22
278 0.2
279 0.16
280 0.12
281 0.13
282 0.17
283 0.18
284 0.19
285 0.23
286 0.23
287 0.24
288 0.24
289 0.28
290 0.3
291 0.3
292 0.3
293 0.28
294 0.29
295 0.3
296 0.31
297 0.24
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.13
302 0.11
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.13
313 0.12
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.17
318 0.17
319 0.2
320 0.21
321 0.22
322 0.2
323 0.23
324 0.23
325 0.24
326 0.26
327 0.25
328 0.24
329 0.25
330 0.29
331 0.28
332 0.27
333 0.23
334 0.2
335 0.19
336 0.17
337 0.16
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.11
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.13
358 0.15
359 0.15
360 0.17
361 0.18
362 0.24
363 0.28
364 0.27
365 0.32
366 0.34
367 0.34
368 0.36
369 0.38
370 0.34
371 0.38
372 0.38
373 0.32
374 0.3
375 0.39
376 0.43
377 0.49
378 0.53
379 0.55
380 0.64
381 0.71
382 0.77
383 0.77
384 0.76
385 0.78
386 0.8
387 0.74
388 0.65
389 0.57
390 0.48
391 0.38
392 0.29
393 0.18
394 0.08
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.02
399 0.02
400 0.02
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.06
406 0.06
407 0.08
408 0.08
409 0.1
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.16
415 0.19
416 0.27
417 0.29
418 0.32
419 0.38
420 0.44