FuNGI

C4JR78

Protein Details

Accession

C4JR78

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MADDPKPKRRRRSRRGSAVKTQGTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-17	KPKRRRRSRRGS

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013520 Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3 IPR047021 REXO1/3/4-like IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013087 Znf_C2H2_type
Gene Ontology	GO:0004527 F:exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding
KEGG	ure:UREG_03560 -
Pfam	View protein in Pfam PF00929 RNase_T
PROSITE	View protein in PROSITE PS00028 ZINC_FINGER_C2H2_1 PS50157 ZINC_FINGER_C2H2_2
CDD	cd06137 DEDDh_RNase

Amino Acid Sequences

MADDPKPKRRRRSRRGSAVKTQGTSQASPKKNVQCPDCSKRFVNIQSLKQHRAEKHSEMNRSEAIVGNYAGRAEGVKHPRDITAEAGAIFEARTIISADEHAGLLALLEQQCHSLDELPKMYRLKQYSEEEIDGVSVCKRCHGMKRDIEGRKSCTYHTEKPKPMPAGTSQKKPVYKCCNTNSKGCVNVPTHEYMLPSKGLASRLRKCQLTPLDQSSTAPKRAAIALDCEMVGTVAGDYPVSLSAVDYLTGEVILNRLVRPLVKVTDWRVRITGVTEKTIAQDRAALEGWEAARAELWAFMNPQTILIGHSLANDLKVLGMVHTRIVDSEILTKKAVGPTCKRVWGLKTLCETFLGIRIQAGKKGHSSLEDALATREIVLWCTKNPEHLATWAEQKRVQLAEERALIELAKNELKQKKMEDGQKEGRALPILTRRSEVLGKRKAETLIIEISESEDTADDLDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.94
2	0.96
3	0.94
4	0.93
5	0.92
6	0.88
7	0.78
8	0.69
9	0.65
10	0.58
11	0.51
12	0.5
13	0.49
14	0.47
15	0.51
16	0.57
17	0.59
18	0.62
19	0.67
20	0.64
21	0.64
22	0.69
23	0.74
24	0.73
25	0.68
26	0.64
27	0.62
28	0.65
29	0.6
30	0.61
31	0.59
32	0.59
33	0.64
34	0.68
35	0.68
36	0.66
37	0.68
38	0.62
39	0.63
40	0.62
41	0.59
42	0.62
43	0.64
44	0.66
45	0.6
46	0.6
47	0.53
48	0.47
49	0.41
50	0.35
51	0.28
52	0.23
53	0.21
54	0.18
55	0.17
56	0.15
57	0.13
58	0.1
59	0.09
60	0.1
61	0.18
62	0.25
63	0.27
64	0.3
65	0.31
66	0.33
67	0.35
68	0.34
69	0.28
70	0.24
71	0.22
72	0.19
73	0.18
74	0.16
75	0.14
76	0.11
77	0.09
78	0.06
79	0.04
80	0.05
81	0.06
82	0.06
83	0.07
84	0.07
85	0.09
86	0.09
87	0.09
88	0.08
89	0.07
90	0.07
91	0.06
92	0.06
93	0.08
94	0.07
95	0.07
96	0.08
97	0.09
98	0.1
99	0.1
100	0.11
101	0.13
102	0.15
103	0.19
104	0.23
105	0.23
106	0.28
107	0.29
108	0.31
109	0.33
110	0.33
111	0.33
112	0.37
113	0.4
114	0.42
115	0.44
116	0.41
117	0.35
118	0.32
119	0.28
120	0.21
121	0.17
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.13
126	0.15
127	0.18
128	0.27
129	0.34
130	0.4
131	0.45
132	0.53
133	0.61
134	0.65
135	0.68
136	0.64
137	0.62
138	0.58
139	0.52
140	0.45
141	0.44
142	0.45
143	0.48
144	0.54
145	0.58
146	0.58
147	0.62
148	0.69
149	0.64
150	0.57
151	0.5
152	0.47
153	0.48
154	0.47
155	0.49
156	0.47
157	0.5
158	0.53
159	0.53
160	0.55
161	0.54
162	0.56
163	0.57
164	0.58
165	0.63
166	0.61
167	0.65
168	0.6
169	0.53
170	0.5
171	0.43
172	0.43
173	0.34
174	0.34
175	0.3
176	0.27
177	0.25
178	0.21
179	0.22
180	0.16
181	0.16
182	0.14
183	0.12
184	0.11
185	0.12
186	0.14
187	0.19
188	0.26
189	0.29
190	0.37
191	0.41
192	0.41
193	0.39
194	0.44
195	0.44
196	0.43
197	0.42
198	0.39
199	0.37
200	0.37
201	0.37
202	0.36
203	0.33
204	0.28
205	0.24
206	0.2
207	0.18
208	0.19
209	0.19
210	0.13
211	0.13
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.11
216	0.1
217	0.08
218	0.07
219	0.04
220	0.03
221	0.02
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.03
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.1
248	0.11
249	0.12
250	0.15
251	0.19
252	0.26
253	0.28
254	0.27
255	0.25
256	0.24
257	0.23
258	0.23
259	0.25
260	0.19
261	0.19
262	0.19
263	0.19
264	0.2
265	0.25
266	0.22
267	0.15
268	0.17
269	0.16
270	0.17
271	0.17
272	0.16
273	0.11
274	0.13
275	0.13
276	0.11
277	0.1
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.07
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.07
302	0.06
303	0.07
304	0.06
305	0.05
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.09
310	0.09
311	0.08
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.16
316	0.18
317	0.19
318	0.19
319	0.19
320	0.2
321	0.25
322	0.28
323	0.26
324	0.3
325	0.37
326	0.41
327	0.45
328	0.44
329	0.44
330	0.43
331	0.47
332	0.44
333	0.42
334	0.44
335	0.42
336	0.41
337	0.37
338	0.35
339	0.26
340	0.28
341	0.22
342	0.16
343	0.15
344	0.21
345	0.21
346	0.25
347	0.26
348	0.23
349	0.25
350	0.27
351	0.27
352	0.23
353	0.26
354	0.24
355	0.27
356	0.25
357	0.23
358	0.22
359	0.21
360	0.19
361	0.15
362	0.16
363	0.11
364	0.11
365	0.14
366	0.15
367	0.15
368	0.23
369	0.23
370	0.26
371	0.29
372	0.3
373	0.29
374	0.31
375	0.33
376	0.28
377	0.38
378	0.36
379	0.36
380	0.34
381	0.34
382	0.35
383	0.33
384	0.32
385	0.3
386	0.3
387	0.33
388	0.34
389	0.34
390	0.29
391	0.28
392	0.27
393	0.2
394	0.18
395	0.17
396	0.17
397	0.18
398	0.26
399	0.31
400	0.35
401	0.38
402	0.4
403	0.45
404	0.5
405	0.57
406	0.56
407	0.6
408	0.65
409	0.67
410	0.66
411	0.57
412	0.51
413	0.46
414	0.39
415	0.36
416	0.36
417	0.35
418	0.34
419	0.36
420	0.34
421	0.36
422	0.42
423	0.43
424	0.45
425	0.48
426	0.5
427	0.5
428	0.53
429	0.5
430	0.46
431	0.41
432	0.35
433	0.32
434	0.29
435	0.27
436	0.23
437	0.24
438	0.21
439	0.18
440	0.14
441	0.09
442	0.09

C4JR78

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer