Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JDK8

Protein Details
Accession C4JDK8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
549-582MLSKSEQKLSKKDKDKDKKDKDKKDKDKKKRFFKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
556-582KLSKKDKDKDKKDKDKKDKDKKKRFFK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043127  Sec-1-like_dom3a  
IPR001619  Sec1-like  
IPR027482  Sec1-like_dom2  
IPR036045  Sec1-like_sf  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG ure:UREG_00717  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00995  Sec1  
Amino Acid Sequences MIADFRIVNINYFPRESHLVLFRDPWSFPTLYHPGCNNLVRAHLGDLAQKIVAVCVSLGEYPLIRYFRPKDPTHEASVLSSHLARFVQDELDAYAASREDFPPPSSRPRGVLYVVDRSLDLVAPLIHEFTYQAMAHDLLPIKEGEKVTYNTTINSGEPNQQTKDLEISENDSIWVESRHLHMKDLLGNDSPANVNTLKDMLAGLSKFQEGKNSYTLHLNMAEECMRLFQERNLPELASVEQSLATGLDEDYKKPKNLADQVVRLLDDERVQPHDRLRLIILYLLYRGGLLAADIKKLLAHSQLPPQDGEVVYNFDLLGARVEKPLKDTKQPSQPLFVRKPPVQTEDDTSLSRYEPNLKLMIQEQIRGAVDTSLFPSTRPQMDGGDGMGQDAVSQASLRSAKPTWARTRPSATEPRQRIIVFMAGGATYSEARSCYELSHAHNKDIYLVTSHMLTPSLFLRQIGDLSVDKRRLNLPAEQPKPQAPRHLFEMEPPPKLPSQQLRPQPPPLTASKSLAPPTAGLASLTMSSQEDPRRVKSFGESAPAQPHGMLSKSEQKLSKKDKDKDKKDKDKKDKDKKKRFFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.32
4 0.33
5 0.35
6 0.35
7 0.35
8 0.38
9 0.36
10 0.34
11 0.33
12 0.3
13 0.28
14 0.25
15 0.24
16 0.29
17 0.34
18 0.33
19 0.38
20 0.38
21 0.37
22 0.42
23 0.45
24 0.39
25 0.32
26 0.33
27 0.3
28 0.29
29 0.27
30 0.24
31 0.22
32 0.23
33 0.23
34 0.22
35 0.19
36 0.18
37 0.16
38 0.13
39 0.12
40 0.09
41 0.07
42 0.06
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.23
53 0.28
54 0.36
55 0.43
56 0.45
57 0.48
58 0.55
59 0.6
60 0.59
61 0.56
62 0.49
63 0.42
64 0.41
65 0.34
66 0.26
67 0.22
68 0.15
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.13
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.13
87 0.16
88 0.18
89 0.23
90 0.27
91 0.35
92 0.39
93 0.41
94 0.4
95 0.41
96 0.43
97 0.39
98 0.41
99 0.37
100 0.38
101 0.36
102 0.33
103 0.3
104 0.27
105 0.25
106 0.19
107 0.14
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.15
124 0.16
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.16
130 0.16
131 0.14
132 0.17
133 0.19
134 0.21
135 0.27
136 0.27
137 0.23
138 0.25
139 0.24
140 0.2
141 0.21
142 0.2
143 0.21
144 0.24
145 0.28
146 0.27
147 0.29
148 0.29
149 0.26
150 0.27
151 0.22
152 0.2
153 0.17
154 0.2
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.08
163 0.09
164 0.12
165 0.19
166 0.19
167 0.2
168 0.21
169 0.22
170 0.26
171 0.26
172 0.26
173 0.19
174 0.19
175 0.18
176 0.18
177 0.16
178 0.12
179 0.12
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.06
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.17
196 0.17
197 0.2
198 0.23
199 0.24
200 0.24
201 0.27
202 0.27
203 0.22
204 0.21
205 0.19
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.17
217 0.18
218 0.21
219 0.21
220 0.2
221 0.19
222 0.2
223 0.18
224 0.11
225 0.1
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.15
238 0.18
239 0.19
240 0.19
241 0.21
242 0.24
243 0.3
244 0.36
245 0.36
246 0.36
247 0.37
248 0.37
249 0.36
250 0.29
251 0.23
252 0.16
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.14
257 0.16
258 0.17
259 0.18
260 0.23
261 0.22
262 0.21
263 0.21
264 0.17
265 0.15
266 0.16
267 0.14
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.07
286 0.09
287 0.11
288 0.17
289 0.2
290 0.21
291 0.21
292 0.2
293 0.2
294 0.18
295 0.17
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.07
302 0.08
303 0.07
304 0.08
305 0.06
306 0.07
307 0.09
308 0.11
309 0.11
310 0.14
311 0.22
312 0.23
313 0.29
314 0.33
315 0.38
316 0.46
317 0.52
318 0.49
319 0.5
320 0.51
321 0.52
322 0.52
323 0.51
324 0.47
325 0.43
326 0.47
327 0.43
328 0.44
329 0.38
330 0.35
331 0.34
332 0.32
333 0.32
334 0.27
335 0.25
336 0.21
337 0.19
338 0.18
339 0.15
340 0.18
341 0.17
342 0.19
343 0.2
344 0.19
345 0.2
346 0.2
347 0.25
348 0.19
349 0.19
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.13
363 0.15
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.16
368 0.17
369 0.18
370 0.15
371 0.14
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.07
383 0.09
384 0.09
385 0.13
386 0.14
387 0.19
388 0.25
389 0.33
390 0.38
391 0.45
392 0.49
393 0.51
394 0.57
395 0.55
396 0.57
397 0.59
398 0.58
399 0.6
400 0.59
401 0.56
402 0.54
403 0.5
404 0.44
405 0.36
406 0.31
407 0.21
408 0.17
409 0.16
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.08
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.13
423 0.17
424 0.22
425 0.32
426 0.32
427 0.33
428 0.34
429 0.33
430 0.33
431 0.31
432 0.26
433 0.18
434 0.17
435 0.16
436 0.15
437 0.15
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.09
442 0.1
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.14
449 0.13
450 0.15
451 0.13
452 0.16
453 0.23
454 0.25
455 0.24
456 0.26
457 0.28
458 0.3
459 0.31
460 0.36
461 0.4
462 0.46
463 0.5
464 0.53
465 0.53
466 0.56
467 0.59
468 0.54
469 0.54
470 0.48
471 0.48
472 0.49
473 0.51
474 0.44
475 0.42
476 0.5
477 0.45
478 0.44
479 0.41
480 0.38
481 0.35
482 0.37
483 0.39
484 0.38
485 0.42
486 0.47
487 0.55
488 0.62
489 0.66
490 0.72
491 0.68
492 0.62
493 0.57
494 0.54
495 0.52
496 0.47
497 0.44
498 0.4
499 0.41
500 0.41
501 0.39
502 0.34
503 0.27
504 0.26
505 0.24
506 0.2
507 0.15
508 0.13
509 0.12
510 0.12
511 0.11
512 0.1
513 0.09
514 0.1
515 0.16
516 0.2
517 0.26
518 0.3
519 0.36
520 0.4
521 0.4
522 0.41
523 0.41
524 0.44
525 0.4
526 0.44
527 0.4
528 0.39
529 0.44
530 0.43
531 0.38
532 0.3
533 0.28
534 0.24
535 0.23
536 0.21
537 0.21
538 0.29
539 0.31
540 0.37
541 0.42
542 0.45
543 0.54
544 0.62
545 0.68
546 0.68
547 0.74
548 0.8
549 0.85
550 0.9
551 0.91
552 0.92
553 0.93
554 0.94
555 0.96
556 0.96
557 0.96
558 0.96
559 0.96
560 0.96
561 0.96
562 0.97