Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2JXA6

Protein Details
Accession A0A0A2JXA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
576-596GRIVKDPKTKQLKMNCRNWECHydrophilic
600-621VPIINEKKTEKKDKGPETNGPVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, cyto 6, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09122  PLDc_Tdp1_1  
Amino Acid Sequences MKPLVDPELAAAVEASRRDMYRQQNRHPASQASNFVDLTNDSGNDSDIEEVFPKSKSVVSSETEDDHEHEQLQRALAMSMEPNDRTKTPEHAPPIKHASAPHGDSVVSAGSLLGMNRKQMEEERLARLAKRKADDSSSTPPSQTSRKLPRTEPLPVQHPVALRNPFQSAPQVSTARVRSRTEVCRQLASNSPNINIQPTSRSVAQWPLGAVKKTHITGFPRSGNEITIEEVIQRDDLELGVFSSFLWDMPWLYSKFNNSTTRILFVMQANDEETREQYRQDVSNMPNFRLCFPPMEPQVFCMHSKLLLMFHPGYLRIAVPSANLTPTDWGEDRLMENTVFLIDLPKLDVPEAGKTPFYEELVYFLQASELHRNIIKKLDEFDFSETKRYAFVHTIGGTNTEGKWQRTGSSGLGRAVKALGLETNAPINVDYIASSLGNINTPFLRSIYLACKGDNALLDYELRTANKKKEPRTEVEAYNQECLDHFRVYFPSDETAQDVHSNAKHAIGTICFNPAWWSGANFPRDTLRDCVSERGVLMHNKLAFVHPSTPIEMPDNKECRGWAYVGSANLSESAWGRIVKDPKTKQLKMNCRNWECGVIVPIINEKKTEKKDKGPETNGPVPSAPLPVEVFRDTVPVPMRVPAVPLSESRRPFFFGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.14
4 0.15
5 0.2
6 0.27
7 0.37
8 0.46
9 0.55
10 0.61
11 0.69
12 0.73
13 0.76
14 0.73
15 0.69
16 0.65
17 0.63
18 0.61
19 0.54
20 0.53
21 0.47
22 0.42
23 0.37
24 0.3
25 0.26
26 0.21
27 0.17
28 0.14
29 0.14
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.12
34 0.1
35 0.12
36 0.12
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.14
41 0.14
42 0.16
43 0.16
44 0.19
45 0.23
46 0.24
47 0.28
48 0.31
49 0.32
50 0.31
51 0.31
52 0.29
53 0.27
54 0.25
55 0.21
56 0.21
57 0.23
58 0.23
59 0.22
60 0.21
61 0.19
62 0.18
63 0.16
64 0.15
65 0.13
66 0.14
67 0.17
68 0.18
69 0.2
70 0.23
71 0.23
72 0.26
73 0.27
74 0.29
75 0.31
76 0.37
77 0.43
78 0.48
79 0.49
80 0.53
81 0.59
82 0.54
83 0.51
84 0.45
85 0.43
86 0.41
87 0.41
88 0.35
89 0.28
90 0.26
91 0.24
92 0.24
93 0.18
94 0.1
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.11
101 0.11
102 0.14
103 0.16
104 0.16
105 0.18
106 0.21
107 0.27
108 0.29
109 0.32
110 0.35
111 0.37
112 0.38
113 0.39
114 0.43
115 0.44
116 0.42
117 0.42
118 0.41
119 0.4
120 0.45
121 0.46
122 0.45
123 0.47
124 0.47
125 0.44
126 0.41
127 0.39
128 0.37
129 0.38
130 0.38
131 0.39
132 0.44
133 0.51
134 0.56
135 0.58
136 0.61
137 0.61
138 0.62
139 0.59
140 0.54
141 0.51
142 0.47
143 0.47
144 0.42
145 0.38
146 0.34
147 0.34
148 0.32
149 0.28
150 0.29
151 0.29
152 0.27
153 0.27
154 0.29
155 0.24
156 0.23
157 0.27
158 0.26
159 0.25
160 0.3
161 0.34
162 0.34
163 0.37
164 0.36
165 0.35
166 0.41
167 0.47
168 0.49
169 0.53
170 0.48
171 0.48
172 0.47
173 0.46
174 0.46
175 0.42
176 0.4
177 0.33
178 0.32
179 0.3
180 0.29
181 0.29
182 0.22
183 0.2
184 0.17
185 0.18
186 0.21
187 0.19
188 0.2
189 0.19
190 0.23
191 0.24
192 0.22
193 0.2
194 0.22
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.2
199 0.22
200 0.22
201 0.23
202 0.22
203 0.24
204 0.28
205 0.34
206 0.36
207 0.34
208 0.36
209 0.35
210 0.31
211 0.28
212 0.23
213 0.18
214 0.14
215 0.13
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.15
241 0.17
242 0.2
243 0.27
244 0.3
245 0.29
246 0.33
247 0.32
248 0.32
249 0.3
250 0.27
251 0.22
252 0.19
253 0.18
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.15
266 0.16
267 0.18
268 0.22
269 0.21
270 0.28
271 0.29
272 0.28
273 0.28
274 0.27
275 0.27
276 0.24
277 0.22
278 0.17
279 0.18
280 0.24
281 0.24
282 0.27
283 0.25
284 0.24
285 0.27
286 0.26
287 0.24
288 0.19
289 0.16
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.1
294 0.09
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.12
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.06
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.1
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.11
346 0.1
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.13
358 0.15
359 0.16
360 0.16
361 0.21
362 0.2
363 0.17
364 0.19
365 0.21
366 0.21
367 0.22
368 0.25
369 0.24
370 0.23
371 0.26
372 0.23
373 0.21
374 0.21
375 0.2
376 0.18
377 0.16
378 0.17
379 0.17
380 0.17
381 0.18
382 0.17
383 0.18
384 0.16
385 0.15
386 0.13
387 0.15
388 0.17
389 0.16
390 0.19
391 0.18
392 0.18
393 0.2
394 0.22
395 0.19
396 0.22
397 0.23
398 0.24
399 0.26
400 0.25
401 0.23
402 0.2
403 0.18
404 0.12
405 0.1
406 0.08
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.1
429 0.1
430 0.09
431 0.1
432 0.09
433 0.12
434 0.15
435 0.2
436 0.2
437 0.2
438 0.2
439 0.2
440 0.21
441 0.19
442 0.17
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.12
450 0.15
451 0.19
452 0.26
453 0.34
454 0.4
455 0.47
456 0.55
457 0.61
458 0.62
459 0.66
460 0.64
461 0.59
462 0.59
463 0.59
464 0.5
465 0.46
466 0.4
467 0.32
468 0.26
469 0.28
470 0.23
471 0.18
472 0.16
473 0.16
474 0.18
475 0.19
476 0.2
477 0.18
478 0.17
479 0.17
480 0.17
481 0.17
482 0.16
483 0.16
484 0.16
485 0.15
486 0.16
487 0.16
488 0.18
489 0.16
490 0.17
491 0.15
492 0.15
493 0.16
494 0.15
495 0.16
496 0.14
497 0.17
498 0.15
499 0.15
500 0.16
501 0.15
502 0.16
503 0.14
504 0.15
505 0.18
506 0.24
507 0.28
508 0.25
509 0.26
510 0.28
511 0.3
512 0.31
513 0.3
514 0.27
515 0.28
516 0.29
517 0.33
518 0.3
519 0.29
520 0.25
521 0.25
522 0.26
523 0.25
524 0.26
525 0.26
526 0.25
527 0.24
528 0.25
529 0.23
530 0.21
531 0.21
532 0.22
533 0.21
534 0.22
535 0.24
536 0.24
537 0.24
538 0.26
539 0.27
540 0.29
541 0.35
542 0.37
543 0.35
544 0.35
545 0.34
546 0.33
547 0.32
548 0.28
549 0.2
550 0.21
551 0.24
552 0.24
553 0.25
554 0.22
555 0.19
556 0.19
557 0.17
558 0.13
559 0.11
560 0.11
561 0.12
562 0.13
563 0.15
564 0.21
565 0.27
566 0.33
567 0.42
568 0.45
569 0.53
570 0.63
571 0.66
572 0.67
573 0.72
574 0.76
575 0.76
576 0.8
577 0.81
578 0.75
579 0.76
580 0.7
581 0.64
582 0.54
583 0.47
584 0.4
585 0.31
586 0.27
587 0.22
588 0.27
589 0.26
590 0.26
591 0.25
592 0.26
593 0.34
594 0.42
595 0.52
596 0.52
597 0.58
598 0.68
599 0.76
600 0.83
601 0.81
602 0.8
603 0.79
604 0.8
605 0.72
606 0.64
607 0.54
608 0.46
609 0.4
610 0.34
611 0.26
612 0.2
613 0.2
614 0.19
615 0.23
616 0.22
617 0.22
618 0.19
619 0.22
620 0.2
621 0.24
622 0.25
623 0.24
624 0.24
625 0.25
626 0.27
627 0.24
628 0.27
629 0.24
630 0.25
631 0.24
632 0.27
633 0.32
634 0.38
635 0.42
636 0.42
637 0.41