Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JYR9

Protein Details
Accession C4JYR9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-65PDLQSSKTPKQVKKTAQKRNKKRKAGIYDDDEEHydrophilic
121-144GPEGGSPRKKRRIRRVKEANITCEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-57PKQVKKTAQKRNKKRKA
125-137GSPRKKRRIRRVK
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12.333, cyto_nucl 3.833, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ure:UREG_07320  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15502  PHD_Phf1p_Phf2p_like  
Amino Acid Sequences MPRASAKPGATGFKKIAPLPSTTGAGTKGNAAPDLQSSKTPKQVKKTAQKRNKKRKAGIYDDDEESIIKAGGSDSDGSDEFTTVTTQTKSGRQIHRPTVFAPQPDPAPISAAGTAVSPVGGPEGGSPRKKRRIRRVKEANITCEHCQRGHSPAGNQIVLCDDCNGAWHQFCHDPPVEAETVSEKESQWFCSDCRPLKAPPSVASVPGVSNVETVTATVYDSNFLHSQNLVGGSNFTAEERLGYLSRLSHAALVGLLARISGENPELPIFPANLKELRTSTFIAPFPTKPSSAATNATSQDTTLSTSLPQVAGAISPPPAKVQTQHPPATTIASSDPTPAAAPIDEYASDEEFIPEHRLYPKPGNGFRLPPDSVDLDILLEDPNCRTFSHALHGPAEMRAEAAVGVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.41
3 0.45
4 0.38
5 0.39
6 0.39
7 0.4
8 0.36
9 0.32
10 0.32
11 0.27
12 0.26
13 0.23
14 0.22
15 0.22
16 0.21
17 0.21
18 0.2
19 0.18
20 0.22
21 0.26
22 0.22
23 0.26
24 0.32
25 0.36
26 0.45
27 0.53
28 0.54
29 0.59
30 0.67
31 0.72
32 0.76
33 0.81
34 0.84
35 0.85
36 0.9
37 0.92
38 0.94
39 0.94
40 0.93
41 0.92
42 0.91
43 0.91
44 0.89
45 0.87
46 0.82
47 0.76
48 0.68
49 0.59
50 0.49
51 0.39
52 0.29
53 0.21
54 0.14
55 0.09
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.09
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.15
75 0.2
76 0.27
77 0.35
78 0.43
79 0.49
80 0.56
81 0.64
82 0.66
83 0.63
84 0.57
85 0.58
86 0.53
87 0.46
88 0.4
89 0.32
90 0.29
91 0.28
92 0.28
93 0.18
94 0.18
95 0.16
96 0.15
97 0.13
98 0.12
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.06
103 0.06
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.06
110 0.13
111 0.18
112 0.24
113 0.3
114 0.39
115 0.49
116 0.56
117 0.65
118 0.69
119 0.76
120 0.79
121 0.84
122 0.86
123 0.86
124 0.89
125 0.84
126 0.79
127 0.73
128 0.68
129 0.59
130 0.53
131 0.44
132 0.35
133 0.32
134 0.28
135 0.27
136 0.28
137 0.29
138 0.25
139 0.3
140 0.33
141 0.31
142 0.29
143 0.24
144 0.21
145 0.19
146 0.18
147 0.12
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.11
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.14
157 0.14
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.2
163 0.17
164 0.14
165 0.15
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.1
171 0.14
172 0.15
173 0.16
174 0.15
175 0.15
176 0.14
177 0.2
178 0.26
179 0.24
180 0.27
181 0.29
182 0.29
183 0.33
184 0.36
185 0.32
186 0.28
187 0.32
188 0.29
189 0.27
190 0.26
191 0.2
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.13
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.16
263 0.18
264 0.2
265 0.21
266 0.21
267 0.24
268 0.23
269 0.25
270 0.27
271 0.25
272 0.28
273 0.28
274 0.26
275 0.22
276 0.24
277 0.24
278 0.25
279 0.27
280 0.24
281 0.26
282 0.27
283 0.27
284 0.25
285 0.2
286 0.19
287 0.16
288 0.16
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.11
295 0.1
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.17
308 0.24
309 0.32
310 0.39
311 0.43
312 0.42
313 0.43
314 0.43
315 0.43
316 0.35
317 0.27
318 0.21
319 0.19
320 0.18
321 0.18
322 0.17
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.11
331 0.1
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.12
340 0.16
341 0.14
342 0.16
343 0.2
344 0.23
345 0.28
346 0.36
347 0.41
348 0.45
349 0.5
350 0.55
351 0.54
352 0.57
353 0.56
354 0.55
355 0.49
356 0.41
357 0.4
358 0.34
359 0.31
360 0.27
361 0.22
362 0.16
363 0.15
364 0.14
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.17
373 0.2
374 0.22
375 0.29
376 0.33
377 0.34
378 0.35
379 0.37
380 0.34
381 0.33
382 0.32
383 0.23
384 0.18
385 0.14
386 0.13