Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JHW1

Protein Details
Accession C4JHW1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-73SSDSKDSRERRPAYNRNYRDQQVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_mito 6.5, nucl 5, extr 4, pero 3, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007783  eIF3d  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0098808  F:mRNA cap binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0002191  P:cap-dependent translational initiation  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
KEGG ure:UREG_01386  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05091  eIF-3_zeta  
Amino Acid Sequences MAPFSLADIVSALPSEDDAWGPPVPSGNTLDGIPYAPFSKGDKLGRMADWSSDSKDSRERRPAYNRNYRDQQVYGAGTSSLFAVQVAEDESSFSVVDNTRTSVKTRGFGRGGGTIFRGRGQRGGAQRGRGGAFQRTTTGRGGHAGGDRYYDQRGGRGNRGRRFGWKDYDKPQRNRDSSVTIRPEWSMLEEIDFSRLSKLNLETPDGEDLDNYGFLYYYDRSYDKAPVKNSERRLQSLDRAAYNVTTSADPVIQELAERDEATVFATADILSMLMCASRSVYSWDIIIVKHGNKIYFDKRDNASIDLVTVNENAADAPMEASEGQAGAKQDAINTPGALALEATIINHNFALQTVIESDNAKVDFAHPNPFYNPAEETEPLASKAFKYRRFDLSLEKDEEPVHIIVRTEVDAVLKNNVSGEDQHVTLKALNEFDHKAQGAGGALDWRTKLYSQRGAVVATEMKNNNVKLARWTTQAILAKSDVMKLGFVARANPRSATAHMILGVVGYKPREFALQMNLNMANGWGIVRTIIDLVNSLDGDDDEDGQEDKIKKYVLVKDPNKSVIRLYSVPTNTFEEDDDAGEKVEKEEEKVDEKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.16
11 0.17
12 0.19
13 0.21
14 0.2
15 0.21
16 0.2
17 0.21
18 0.18
19 0.18
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.14
25 0.16
26 0.22
27 0.28
28 0.32
29 0.35
30 0.38
31 0.42
32 0.42
33 0.43
34 0.38
35 0.33
36 0.33
37 0.31
38 0.31
39 0.32
40 0.31
41 0.3
42 0.38
43 0.41
44 0.46
45 0.54
46 0.54
47 0.58
48 0.68
49 0.75
50 0.76
51 0.81
52 0.78
53 0.77
54 0.8
55 0.75
56 0.69
57 0.61
58 0.54
59 0.48
60 0.44
61 0.35
62 0.28
63 0.24
64 0.18
65 0.17
66 0.14
67 0.09
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.1
82 0.1
83 0.13
84 0.13
85 0.16
86 0.19
87 0.2
88 0.22
89 0.27
90 0.29
91 0.32
92 0.34
93 0.4
94 0.38
95 0.39
96 0.39
97 0.37
98 0.35
99 0.31
100 0.31
101 0.25
102 0.24
103 0.26
104 0.26
105 0.21
106 0.24
107 0.25
108 0.28
109 0.32
110 0.41
111 0.41
112 0.42
113 0.42
114 0.42
115 0.41
116 0.38
117 0.34
118 0.31
119 0.29
120 0.26
121 0.29
122 0.27
123 0.28
124 0.28
125 0.26
126 0.21
127 0.21
128 0.21
129 0.21
130 0.22
131 0.22
132 0.2
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.22
137 0.21
138 0.18
139 0.2
140 0.27
141 0.28
142 0.36
143 0.43
144 0.51
145 0.53
146 0.58
147 0.57
148 0.58
149 0.62
150 0.59
151 0.6
152 0.59
153 0.59
154 0.63
155 0.72
156 0.73
157 0.72
158 0.76
159 0.76
160 0.71
161 0.7
162 0.64
163 0.61
164 0.57
165 0.58
166 0.54
167 0.45
168 0.43
169 0.39
170 0.36
171 0.28
172 0.25
173 0.18
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.15
185 0.16
186 0.2
187 0.21
188 0.23
189 0.22
190 0.22
191 0.24
192 0.21
193 0.19
194 0.14
195 0.13
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.14
209 0.22
210 0.25
211 0.3
212 0.31
213 0.37
214 0.44
215 0.49
216 0.53
217 0.53
218 0.5
219 0.48
220 0.51
221 0.46
222 0.44
223 0.44
224 0.41
225 0.34
226 0.31
227 0.28
228 0.23
229 0.21
230 0.16
231 0.11
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.15
280 0.2
281 0.23
282 0.28
283 0.29
284 0.3
285 0.3
286 0.34
287 0.34
288 0.31
289 0.26
290 0.19
291 0.18
292 0.13
293 0.13
294 0.09
295 0.08
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.05
312 0.06
313 0.05
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.1
350 0.14
351 0.15
352 0.22
353 0.2
354 0.22
355 0.23
356 0.27
357 0.26
358 0.22
359 0.22
360 0.17
361 0.2
362 0.18
363 0.19
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.15
368 0.14
369 0.12
370 0.2
371 0.25
372 0.3
373 0.35
374 0.38
375 0.44
376 0.48
377 0.49
378 0.5
379 0.51
380 0.51
381 0.5
382 0.46
383 0.41
384 0.37
385 0.35
386 0.28
387 0.2
388 0.15
389 0.11
390 0.11
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.1
398 0.11
399 0.14
400 0.13
401 0.12
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.11
406 0.14
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.16
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.17
418 0.19
419 0.19
420 0.21
421 0.19
422 0.17
423 0.16
424 0.16
425 0.13
426 0.11
427 0.1
428 0.08
429 0.08
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.12
435 0.17
436 0.22
437 0.29
438 0.29
439 0.34
440 0.34
441 0.34
442 0.33
443 0.3
444 0.27
445 0.2
446 0.24
447 0.2
448 0.22
449 0.26
450 0.26
451 0.28
452 0.27
453 0.26
454 0.28
455 0.34
456 0.34
457 0.32
458 0.34
459 0.3
460 0.35
461 0.39
462 0.33
463 0.29
464 0.27
465 0.26
466 0.25
467 0.25
468 0.19
469 0.15
470 0.14
471 0.12
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.18
476 0.23
477 0.27
478 0.28
479 0.29
480 0.28
481 0.29
482 0.3
483 0.3
484 0.25
485 0.22
486 0.21
487 0.21
488 0.18
489 0.15
490 0.14
491 0.09
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.1
496 0.11
497 0.13
498 0.13
499 0.16
500 0.23
501 0.29
502 0.3
503 0.33
504 0.32
505 0.3
506 0.29
507 0.26
508 0.16
509 0.09
510 0.09
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.09
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.08
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.16
534 0.17
535 0.18
536 0.2
537 0.21
538 0.22
539 0.29
540 0.39
541 0.42
542 0.51
543 0.56
544 0.61
545 0.66
546 0.72
547 0.67
548 0.59
549 0.53
550 0.47
551 0.47
552 0.41
553 0.38
554 0.39
555 0.4
556 0.41
557 0.41
558 0.4
559 0.35
560 0.34
561 0.32
562 0.26
563 0.24
564 0.23
565 0.21
566 0.17
567 0.16
568 0.16
569 0.16
570 0.14
571 0.18
572 0.18
573 0.19
574 0.24
575 0.27
576 0.31