Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JYF4

Protein Details
Accession C4JYF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-133FIEYLKTRMKRKPLRFCAERHydrophilic
357-376LTAVSKRKRNQLPKWIAQNMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 12, nucl 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010614  DEAD_2  
IPR045028  DinG/Rad3-like  
IPR010643  HBB  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR013020  Rad3/Chl1-like  
IPR001945  RAD3/XPD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0016818  F:hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG ure:UREG_07205  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06733  DEAD_2  
PF06777  HBB  
Amino Acid Sequences MSLFLCAPDVFDEAHNIDNVCIEALSIDITEDSLRKASRGANNLERKIDEMKRSDADKLQREYEKLVEGLREADQAREEDQLMANPALPDDLLKEAVPRNIRRAEHFVAFLKRFIEYLKTRMKRKPLRFCAERLTSLVRTLELMNIEDYQPLQEVATFATLTATYEKGFLLILEPFESEAATVPNPILHFTCLDAAIAIKPVFDRFSSVIITSGTLSPLEMYPKMLEFTTVLQESYSMTLARRSFLPMIVTRGSDQAQISSSFQIRNDPGVVRNYGNLLLEFSRITPDGIVVFFPSYLYMESIIRNSVSESFGLTFFRETIGYEKTTFSRSTPCVTLHNALGVCFEEKTIMESWSWLTAVSKRKRNQLPKWIAQNMLESETNLSTDMAVATAKNFLRTMAQPFKNKDQEGISTWSLADLERHVAKQKGEAAKRDQEAQQHQNMLAATNGAHVGNGDMEMYDDVMDEDLIMMDAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.15
7 0.12
8 0.1
9 0.08
10 0.06
11 0.06
12 0.07
13 0.06
14 0.06
15 0.05
16 0.06
17 0.08
18 0.08
19 0.1
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.17
24 0.24
25 0.31
26 0.37
27 0.43
28 0.49
29 0.58
30 0.62
31 0.62
32 0.56
33 0.51
34 0.52
35 0.5
36 0.47
37 0.42
38 0.44
39 0.45
40 0.46
41 0.48
42 0.47
43 0.49
44 0.5
45 0.5
46 0.52
47 0.52
48 0.51
49 0.5
50 0.47
51 0.41
52 0.33
53 0.31
54 0.24
55 0.21
56 0.21
57 0.19
58 0.2
59 0.17
60 0.17
61 0.18
62 0.18
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.16
67 0.16
68 0.16
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.14
73 0.13
74 0.12
75 0.11
76 0.09
77 0.08
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.12
82 0.15
83 0.2
84 0.27
85 0.28
86 0.32
87 0.38
88 0.4
89 0.42
90 0.47
91 0.47
92 0.42
93 0.43
94 0.41
95 0.42
96 0.41
97 0.37
98 0.3
99 0.26
100 0.24
101 0.22
102 0.25
103 0.2
104 0.26
105 0.35
106 0.41
107 0.47
108 0.53
109 0.63
110 0.65
111 0.73
112 0.77
113 0.77
114 0.8
115 0.78
116 0.76
117 0.74
118 0.69
119 0.6
120 0.52
121 0.47
122 0.38
123 0.36
124 0.32
125 0.23
126 0.19
127 0.18
128 0.17
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.1
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.12
199 0.1
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.06
225 0.06
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.16
234 0.13
235 0.17
236 0.17
237 0.17
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.14
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.16
255 0.15
256 0.16
257 0.18
258 0.2
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.12
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.2
314 0.2
315 0.18
316 0.22
317 0.22
318 0.25
319 0.26
320 0.26
321 0.27
322 0.3
323 0.31
324 0.25
325 0.27
326 0.23
327 0.2
328 0.19
329 0.17
330 0.14
331 0.12
332 0.11
333 0.08
334 0.08
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.1
344 0.1
345 0.15
346 0.25
347 0.32
348 0.4
349 0.44
350 0.54
351 0.63
352 0.72
353 0.76
354 0.78
355 0.79
356 0.79
357 0.84
358 0.78
359 0.7
360 0.62
361 0.57
362 0.47
363 0.41
364 0.33
365 0.24
366 0.22
367 0.2
368 0.19
369 0.14
370 0.12
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.12
379 0.12
380 0.14
381 0.14
382 0.14
383 0.18
384 0.21
385 0.29
386 0.34
387 0.4
388 0.46
389 0.51
390 0.6
391 0.64
392 0.62
393 0.57
394 0.5
395 0.48
396 0.45
397 0.45
398 0.37
399 0.29
400 0.28
401 0.25
402 0.22
403 0.18
404 0.15
405 0.1
406 0.15
407 0.17
408 0.19
409 0.23
410 0.27
411 0.27
412 0.31
413 0.38
414 0.42
415 0.46
416 0.5
417 0.53
418 0.58
419 0.59
420 0.59
421 0.54
422 0.53
423 0.56
424 0.57
425 0.56
426 0.51
427 0.48
428 0.46
429 0.43
430 0.35
431 0.26
432 0.2
433 0.14
434 0.12
435 0.13
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.07
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.05