Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2JCT0

Protein Details
Accession A0A0A2JCT0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-52DGNTHLHSRTRKRFRDDRPSDQVIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR034110  LSMD1_Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0031417  C:NatC complex  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
CDD cd06168  LSMD1  
Amino Acid Sequences MSLKRKASFTALPTSPSVPAPSEWGMVIDGNTHLHSRTRKRFRDDRPSDQVIYQNTLRWIFSAQKQQESTQAIDMDTMDSEPTLETTETVDPRQQTLHRFFQQKPQQSSSFRPSRQALAPRANETALAQEDLLRRQAFNQMSSGDSSSESNSPGSNQMGADVDMDMDMNCRGGNDVLDQAPKAWPIWPQAPRKLFVHPTFIPPSIEPQAQGNPKPQDKLLNFANPPNNPTLSFLRQNPFQLGYPQTSTPPHIGGLSTADTNNAPTTMDHDQSVQYLEGLLGRTLRIHTTDTRMFVGLFKCTDADRNVILANSFEYRMPTTSAVQAAAEEKQWGEGSEAKSTTVKVNMTHRLIGLIVIPGRHITKIELE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.36
3 0.31
4 0.29
5 0.22
6 0.21
7 0.24
8 0.23
9 0.22
10 0.2
11 0.2
12 0.18
13 0.16
14 0.16
15 0.12
16 0.11
17 0.12
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.18
22 0.27
23 0.36
24 0.46
25 0.55
26 0.62
27 0.7
28 0.79
29 0.84
30 0.87
31 0.85
32 0.84
33 0.82
34 0.8
35 0.73
36 0.66
37 0.6
38 0.52
39 0.48
40 0.4
41 0.34
42 0.32
43 0.31
44 0.28
45 0.24
46 0.23
47 0.23
48 0.28
49 0.35
50 0.35
51 0.4
52 0.43
53 0.43
54 0.47
55 0.45
56 0.41
57 0.34
58 0.32
59 0.25
60 0.24
61 0.23
62 0.17
63 0.13
64 0.12
65 0.08
66 0.06
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.1
74 0.14
75 0.16
76 0.17
77 0.2
78 0.19
79 0.2
80 0.24
81 0.25
82 0.27
83 0.32
84 0.4
85 0.43
86 0.48
87 0.48
88 0.54
89 0.61
90 0.63
91 0.63
92 0.59
93 0.59
94 0.58
95 0.62
96 0.61
97 0.61
98 0.53
99 0.52
100 0.48
101 0.47
102 0.49
103 0.5
104 0.48
105 0.47
106 0.49
107 0.46
108 0.46
109 0.41
110 0.35
111 0.27
112 0.24
113 0.16
114 0.13
115 0.1
116 0.13
117 0.14
118 0.15
119 0.18
120 0.15
121 0.15
122 0.15
123 0.22
124 0.2
125 0.2
126 0.2
127 0.17
128 0.18
129 0.19
130 0.19
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.12
173 0.19
174 0.26
175 0.31
176 0.37
177 0.39
178 0.4
179 0.39
180 0.41
181 0.4
182 0.35
183 0.37
184 0.31
185 0.34
186 0.35
187 0.34
188 0.31
189 0.24
190 0.27
191 0.22
192 0.22
193 0.17
194 0.16
195 0.21
196 0.23
197 0.24
198 0.27
199 0.29
200 0.31
201 0.32
202 0.31
203 0.34
204 0.31
205 0.34
206 0.32
207 0.33
208 0.32
209 0.36
210 0.41
211 0.33
212 0.34
213 0.32
214 0.29
215 0.22
216 0.25
217 0.25
218 0.24
219 0.27
220 0.29
221 0.3
222 0.32
223 0.33
224 0.31
225 0.29
226 0.25
227 0.25
228 0.23
229 0.23
230 0.23
231 0.22
232 0.22
233 0.21
234 0.23
235 0.2
236 0.19
237 0.16
238 0.14
239 0.14
240 0.12
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.11
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.12
253 0.15
254 0.16
255 0.15
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.18
260 0.13
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.14
274 0.16
275 0.23
276 0.26
277 0.28
278 0.28
279 0.28
280 0.26
281 0.26
282 0.25
283 0.21
284 0.18
285 0.17
286 0.16
287 0.16
288 0.2
289 0.18
290 0.2
291 0.18
292 0.19
293 0.19
294 0.18
295 0.18
296 0.14
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.14
302 0.15
303 0.17
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.22
308 0.23
309 0.21
310 0.19
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.15
315 0.13
316 0.11
317 0.13
318 0.14
319 0.13
320 0.14
321 0.19
322 0.21
323 0.26
324 0.26
325 0.26
326 0.26
327 0.27
328 0.28
329 0.27
330 0.27
331 0.25
332 0.33
333 0.4
334 0.42
335 0.43
336 0.39
337 0.36
338 0.34
339 0.3
340 0.23
341 0.19
342 0.17
343 0.15
344 0.15
345 0.16
346 0.18
347 0.18
348 0.18